明軍剛趕到幹谷口，就看到前方有3千大批大順軍士兵向這裡而來。
駐紮在江口的馬科得知孫守法正在進攻子午谷後，心想怪不得找不到游擊隊的主力了，原來他們在子午關。他知道憑游擊隊的武器，他們不可能在幾天內攻陷子午關，就令部將劉先率3千士兵趕往子午關，與守關的大順軍一起消滅孫守法的主力。
劉先看到前方有無數的明軍正規軍後，心想子午關關城肯定已被明軍攻破了，憑自己這幾千人馬是擋不住明軍的，就率部掉頭逃了回去。
明軍沿著洵水河河谷繼續前行15裡後，來到了沙溝口（今稱廣貨街）。洵水河在這裡折向西流，流到西邊14裡的白楊坪後，再折向南流24裡，便是江口鎮。
江口鎮是洵水河支流江河匯入幹流的江口，子午道里來往的商旅多了後，就在這裡形成了鎮子，被稱為“江口鎮”。
龔廣方、孫守法率部來到了江口鎮後，發現鎮子裡的大順軍都逃走了。於是沿著洵水河河谷繼續前行10裡，來到了胡家巖。到了這裡後，子午道就不再沿著洵水河河谷走了，而是沿著月河梁山的主脊向西南方向走，走15裡後就來到了七里溝口。溝口有月河流過。
月河發源於七裡溝口西南20裡的平河梁山的徐家坪，它自源頭流出了，向東北流到旬陽壩後，折向東南方向流，經七里溝口，在50裡外的窯灣匯入洵水河。
漢代開鑿子午道時，子午道是從七里溝口沿著月河向東南走，到月河坪後，沿著直水河（今稱池河）南下，經東腰嶺關、火鐮砭、鐵爐、迎豐、漢王城（也稱直城，今漢陰縣城）、池河口（今池河鎮）、馬嶺關、石泉，再到南子午鎮。西晉以後，從七里溝口開闢了一條新道。新道的走向是從七里溝口溯月河而上，經旬陽壩到平河梁山腳下，然後沿著長安河河谷南下，經火地塘、西腰嶺關、五郎關、五穀關、兩河口到南子午鎮。此後，新道、舊道一起用，如要到興安盆地的話，就走舊道，如要去漢中盆地的話，就走新道。
孫守法告訴龔廣方，馬科進入子午道後，在新道、舊道里都駐紮了軍隊。於是，明軍兵分二路，一路由龔廣方自己率領，沿著新道去南子午鎮；另一路由菅禮耕率領，沿著舊道去漢陰城。孫守法的游擊隊也分兵隨虎賁軍進入了新道、舊道，孫守法、姚科隨龔廣方走新道，耿三桂隨菅禮耕走舊道。
龔廣方率部從平河梁山腳下進入了長安河河谷。
長安河發源於平河梁山南麓，自源頭流出後，一直向南流，到了兩河口後與汶水河交匯，成為子午河，總長約100裡。
龔廣方率部過了火地塘6裡後，來到了西腰嶺關。
西晉時期開鑿子午道新道時，在腰嶺山西麓也修築了一個關城。於是，腰嶺山東麓的關口稱為“東腰嶺關”，西麓的關口就稱為“西腰嶺關”。西腰嶺關關城位於一個山坳中，它有南、北2個關門，每個關門是在岩石上開鑿的一左一右2個石門洞，每個洞口寬約7尺，高約一丈，每個石門洞都有2扇包有鐵皮的木門，2扇木門的間距在2米左右。南、北關門之間的山坳裡就是關城，四周的山嶺上還有高二丈的關牆。敵人要攻陷關城，無論是破關門，還是從四周的關牆上攀牆而入，都必須付出重大傷亡。
駐守在西腰嶺關的正是從幹谷口逃回來的劉先，他先逃到江口鎮，因江口鎮無險可守，就繼續南逃到了西腰嶺關。劉先到了西腰嶺關後，就派人向駐紮在五穀關的馬科報信。現在見明軍到來後，也不聽楊廷樞的勸告，拒絕投降。
孫守法見現在風向還是北風，就向龔廣方建議仍使用煙霧彈。
龔廣方說現在關城南沒有友軍，就不必使用煙霧彈了，可以改用催淚彈。
虎賁軍向關城裡扔了幾顆催淚彈後，散發出來的氯丙酮使關牆、關城裡的大順軍不斷地流眼淚。大華公司在製造催淚彈時，還在裡面加了辣椒水，所以這些大順軍士兵不僅流眼淚，還被辣得連眼睛都睜不開，都痛苦地喊叫著。
數百名明軍士兵帶上防毒面具後，攀上了關牆，用子彈、刺刀將關牆上的大順軍士兵擊殺後，又向關城裡的大順軍開槍、扔手擲彈。很快，關城裡的大順軍士兵被徹底消滅了，劉先也被虎賁軍扔出的手擲彈炸死了。
龔廣方、孫守法佔領西腰嶺關後，沿著長安河繼續南下約20裡，來到了五郎關（位於今寧陝老城北的焦家堡附近）。
五郎關始建於北宋年間，為了抗擊遼軍進犯西北，楊家將楊五郎曾在此駐紮，並修了關城，故稱為“五郎關”（注：今位於寧陝縣城的五郎關城樓是建於2009年的仿古建築，並不是在真正的五郎關）。
駐守在五郎關的大順軍見明軍突破了西腰嶺關，忙向南逃到了12裡外的五穀關（今寧陝縣縣城附近）。
五穀關位於長安河、魚洞河交匯處，始建於唐代，因其控長安河上谷口、長安河下谷口、魚洞河谷口、東溝河（長安河的左岸支流，今稱東河）谷口（谷口位於五穀關南3裡）、西溝（長安河的右岸支流）谷口（谷口位於東河谷口西3.2裡），故稱為“五穀關”。此後，五穀關成了子午新道上的軍事要塞。進入明代後，朝廷修繕了五穀關的關牆、關城，還在這裡設有驛站、巡檢司。趙光遠投降李自成後，大順軍佔據了五穀關。馬科、賀珍去了關中後，大順軍仍然佔據著五穀關。馬科奉命進入子午道清剿孫守法的游擊隊時，就駐紮在五穀關。
馬科從五郎關逃來計程車兵那裡得知大批明軍到來後，忙下令迎戰。
楊廷樞再次來到關城前，告訴馬科，李自成已被我們俘獲，大順朝已徹底完蛋了，你在西安城的家眷都很好。他勸馬科，你曾是朝廷的高階軍官，你投降後，朝廷會考慮到你曾為清剿李自成立下過赫赫戰功，也為抗擊後金軍立下過汗馬功勞，並不會為難你的。
馬科聽後，心想楊廷樞說的是真的，不然官軍不可能從西安進入子午道。他們既然能輕鬆佔領子午關、江口鎮、西腰嶺關、五郎關，定然也能輕鬆佔領五穀關。如自己頑抗下去，跟隨自己多年的弟兄都會戰死。可官軍已殺了自己的兒子，即使自己投降官軍，活著也沒啥意思了。想到這裡，馬科令部下開啟關門。
當龔廣方進入關城後，看見站在關樓上的馬科用刀朝自己的脖子一橫，一股鮮血從脖子裡噴湧而出。龔廣方趕緊令軍醫、護士搶救，可終究沒能把他救回來。
龔廣方望著躺在地上的馬科，嘆了一口氣，令親兵去買口厚實的棺材，將馬科埋了。
龔廣方、孫守法佔領五穀關後，沿著長安河繼續南下，來到了40裡外的兩河口（今兩河鎮）。
。軍西大了給移口河兩將，後中漢出退珍賀、科馬。隊軍有駐口河兩在就，起代唐自，點起的道岔舊、新道新午子是口河兩於由。縣泉石到谷河河峰饒著沿後然，）鎮峰饒今（關峰饒到谷河河家著沿，後埡門土了到，山安越翻向方南東向口河兩從是道新。縣洋到後）鎮峽金黃今（口峽金黃出，山王越翻西向子碾著沿口河河午子從可也，縣洋到西向鎮水金經，上而谷河江漢溯口河河午子從或；縣鄉西到可南西往，縣泉石到可東往，後鎮午子南了到，鎮午子南到谷河江漢著沿再，）渡沙白今（口河河午子到後裡03進行南西向谷河河午子著沿是道原。道岔的道午子條一了鑿開又口河兩從，時代唐。河午子為稱河水汶將也人後，源主的河午子是河水汶因，”河午子“為稱，後匯口河兩在）游上的河午子（河水汶與河安長
。鎮午子南了往逃，後來軍明見軍西大的口河兩在紮駐
。縣泉石攻進關峰饒從，領率科姚、樞廷楊由路一另。縣泉石攻進再，鎮午子南往趕谷河河午子著沿，領率法守孫、方廣龔由路一，路二分兵又，後口河兩領佔法守孫、方廣龔
。降投了擇選就，道通的縣鄉西往逃們他了死封已軍明見軍西大的裡鎮在守駐，後鎮午子南到來河午子了到部率方廣龔
。城縣泉石了向攻關峰饒、關嶺馬從別分也軍賁虎的領率樞廷楊、軍賁虎的領率耕禮菅，時城縣泉石攻進邊西從部率方廣龔當
