與此同時，在主世界之外，另一條完全不一樣的世界之中發生了一些奇特的事情，一場滅絕降臨了。
這個世界是新世紀福音戰士的世界，同時又不符合EVA的主體世界，算是內平行宇宙。
因為劇情發生了質的改變，人類的文明己經步入末途。
這個世界的人類發現了希望，卻辜負了光芒，最終走向了滅亡，都是因為人類的傲慢，猜疑和內心的黑暗。
當時使徒所帶來的毀滅性遠超人類文明的認知，同時不只是使徒，甚至還有其他的宇宙入侵者掙脫行星邊界，如毒潮般蔓延至整片宇宙。
璀璨星辰接連坍縮，時空褶皺不斷潰爛、崩壞，人類世代棲息的天地，終究走向了無法逆轉的滅亡。
還沒來得及衝出地球的人類文明，被徹底掐斷了最後一絲希望。地球之外只有死亡，地球之內只剩絕望。
一切悲劇的根源，要追溯到末日降臨之前，彼時的人類曾經擁有過巨人。
巨人強悍的戰力與龐大的體型，一度讓人類心生猜疑與恐懼——巨人和使徒一般高大神秘，兼具恐怖的力量與破壞力。
彼時的世界，曾握有唯一的救贖——迪迦之光，以及那枚名為神光棒的羈絆信物。
但那時的人類，只將這位獨特的存在稱作人形使徒，認定他是模樣更為神聖、力量也更為強橫的異類。
很久以前，外星入侵者肆虐東京，整座城市搖搖欲墜，傾覆只在旦夕。手握神光棒的光之繼承者挺身而出，化身遠古巨人。
面對無數軍隊都無法阻攔的使徒，這位突然橫空出世的巨人以無可匹敵的力量擊潰來敵，拼盡一切護住了萬千生靈。
可人類從未敬畏這份降臨世間的希望，反倒因無法掌控這份超凡力量，心底滋生出無邊的恐懼。
那股力量輕易就能撕裂使徒的防禦、終結敵人的性命，其體內蘊藏的壓倒性破壞力，讓人類的忌憚愈發深重。
戰火平息後，掌權者被猜忌與私慾徹底裹挾，背棄了曾經的感恩與誓言，強行奪走了神光棒。
他們搶走這位人間體的信物，將他驅逐、隔離，甚至把他視作人類的敵人。
光與人心之間的聯結，就這樣被人類親手斬斷。失去心念共鳴的神光棒，又在周遭無盡的黑暗與敵意中迅速黯淡。
在眾人的注視下，這件神聖不凡的器物一點點鈣化，最終淪為一塊冰冷死寂的頑石。
曾經的人間體再也無法召喚巨人，但他心底的溫柔與不滅希冀，自始至終，從未熄滅。
人類深深忌憚這股難以解析的光之力量，明知無法破譯神光棒的奧秘，卻又按捺不住窺探的好奇，於是只針對人間體展開研究。
對其進行了長達5年的研究，最終發現他身上並沒有任何獨特之處，便放他重獲自由。而他，也與這件古怪的奇石徹底隔絕，再無相見的可能。
歲月流轉，數年光陰匆匆而過。第二波使徒災厄毫無徵兆地降臨世間。
人類自以為可以依靠自身武力與武器取勝，認定就算沒有這神秘的巨人，他們依舊能渡過危機。但事實上他們錯了，錯得徹徹底底。
猙獰的AT力場撕裂大地，山河劇烈震顫，末日的陰影籠罩西方。民眾爭相躲進深挖而出的地下掩體，只求苟全性命。
唯有那位失去力量的人間體，逆著奔逃的人流，毅然衝進斷壁殘垣的城區。
在一棟歪斜、即將坍塌的樓房下，他看見一個走失的小女孩正孤零零地站在原地哭泣。
他沒有選擇逃離，護下來不及撤離的孩童的念頭剛一浮現，身體便己率先行動，快步衝向了孩子。
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