改革宗室的變法塵埃尚未落定，朝廷又頒《編戶齊民令》，拉開了全國新造黃冊工作的序幕。
戶貼黃冊的重新編制，為整個變法的基礎性工作，這項工作的成敗直接關係到後續變法的效果。
因此，在萬曆五年下發的變法大詔中，對於編戶貼這項工作直接寫清楚了違法後果：“凡官吏、里甲通同人戶隱瞞作弊，不行明白推行過割，一概影射減除餘糧者，一體處死。隱瞞人戶，家長處死，人口流邊。”
大詔的宣貫過程中，這血淋淋的警告已經開始起作用：萬曆五年，各府、州、縣地方政府在上報本地基礎黃冊的時候，將土豪劣紳明睜眼漏隱瞞戶口的情況進行了全力彌補——結果造成上繳表格前後說不上話，邏輯關係無法解釋的佔了九成還多。
這邏輯不通的統計表格當然不能上報朝廷，結果導致很多府衙在萬曆五年十二月的時候連續通宵加班，好多知府帶著縣令們陪著戶房胥吏一直幹到大年三十，才勉強交了差。
因大詔說“以萬曆五年黃冊為本”，也有的糊塗地方官被胥吏糊弄，在上繳的黃冊上反向操作，導致當地萬曆五年的賦稅基礎不升反降。
這些求仁得仁的胥吏和糊塗官兒在萬曆六年大部分都得到了清算，朝廷繼萬曆五年張文明案殺得手軟之後，萬曆六年秋天，成千上萬在基礎黃冊上做手腳的胥吏被幹淨利落“一體處死”，而串通他們隱瞞戶口的大戶，“家長處死，人口流邊”。那些糊塗官兒能解釋清的能得到免職待遇，解釋不清楚的，也要到刑場走一遭。
隨著《編戶齊民令》的逐步落實，東北、海南等地，很多被張文明案牽連的流放家庭，發現自家又有了好多新鄰居。而天下十七省的巡撫衙門裡，編戶欽差的王命旗牌之下，殺得人頭滾滾，欽差們心理也逐漸扭曲，在民間傳說中個個都如同地獄中爬出來的惡鬼一般。
這些惡鬼和監視他們的錦衣衛，身後還有一雙雙佈置在各地的暗子和明面上的巡視欽差瞪著通紅的眼珠子盯著，“人情社會”、“官官相護”這些潛規則在《編戶齊民令》下都不好使，因為皇帝不再給他們犯錯、辯解的機會，無論是誰，只要沾上了《編戶齊民令》的邊，吃飯家伙就要換個地方待著。
變法開始了！儘管老百姓還呆在資訊傳遞極其緩慢的社會，但每個人都能感到變法帶來的變化。很多貧民發現自家身邊的大戶被錦衣衛帶走後，很快就能在縣城城門上找到他的人頭，而伴隨著屠戮的，則是這家田地換了新的主人——大多是從緬甸、九邊返回的軍功地主。
整個帝國從南到北，田連阡陌的情況越來越少，很多掛靠在地主豪紳之家的“僕役”，搖身一變又變成了小地主，他們還從事著原來的種地工作，但是家中門上都掛上一個小牌子：“某省、某府、某縣、某村、某人，戶口編號*******”，和自家門上掛的牌牌一樣。
......
隨著各項改革伴在萬曆六年全面鋪開，朱翊鈞忙的腳打後腦勺。萬曆六年八月，呂調陽因年邁乞骸骨，以光祿大夫、柱國、少傅兼太子太傅、吏部尚書、建極殿大學士的官銜退休並授一等伯爵，馳驛。
呂調陽是朝廷改了爵法之後，第一位被冊封的文臣，以伯爵的儀制回鄉之後，他的身份不再是民，而是勳貴。
儘管這伯爵不世襲，爵祿只發到呂調陽去世，但對他來說，仍屬於超級光宗耀祖的體面。因為新法規定，對於在任期間工作平平的，在同級爵位中選低等授之。呂調陽能得一等伯爵，說明他的工作能力和操守得到了皇帝的肯定。
呂調陽一身正氣，“門無私謁”——換句話來說，他從不以權謀私，也不拉幫結派，具有很高的政治智慧。在嚴嵩當政期間，因為呂調陽的滑不留手，嚴黨也拿他沒什麼辦法。
呂調陽曆經三朝，雖然沒有主導過大政，但作為一個執行力很強的人，在打輔助方面具有很強的能力。而且他性格沖和，有成績從不炫耀，也不願意聽別人對他歌功頌德。被評價為：“所樹惟恐見知，所急惟恐見德。”
因此，作為新法出臺後，第一個被冊封的高官，朝野上下也非常關注皇帝會給予呂調陽何種評價。因為他的性格導致其政績不顯，所謂“人故無所藉以頌公”，因此很多人覺得呂調陽可能會以二等伯致仕。
沒想到皇帝給予呂調陽的冊封詔書中，對其作出極高的評價：“公質行多長厚，斷斷乎有古大臣之風。”，認為他是當代的丙吉，“在漢丙吉，今也則呂調陽也。”
呂調陽一方面是因為身體確實支撐不住，另一方面對於疾風驟雨般的變法改革，也有些畏難之意，才上疏堅決求去。
結果接到皇帝的冊封詔書後，呂調陽這個十分重視自身道德修養的人竟愧而難當，上疏做了自我批評，堅決固辭一等伯之賞。朱翊鈞召他入宮，反覆撫慰後，他才放下心理負擔，謝恩返鄉。
......
因為變法攤子鋪的很大，呂調陽致仕後，潘晟、馬自強先後以禮部尚書、吏部侍郎銜直入內閣。申時行、餘有丁分別接任二人職務。
雖然王國光離首輔只有一個身位，但他老色胚本性難改，剛解除了戴罪圖功的處分，立即大肆操辦，半個月內一口氣連續娶了兩個小姑娘做如夫人，被御史和給事中彈劾的滿頭大包。其人品再次受到了強烈的質疑，節操也摔個稀碎。
如此一來，張四維已成為最有希望接替張居正的閣臣。而且他執行朱翊鈞旨意盡心盡力，從不打折扣，因此朝野判斷張四維簡在帝心，張居正兩屆總理大臣後，張四維最有希望接任。
萬曆六年年底，全國的黃冊、戶貼編制的第一步“摸底調查”完成，初步統計出全國人口一億四千萬以上，接近萬曆五年黃冊資料的一倍——若沒有大詔釋出之後的急就章補報，可能會達到一倍半這個令人瞠目結舌的差距。
在帝國北方，嚴重的隱戶問題充分暴露。主要原因為存在大量的宗室和各地衛所的腐敗，大量破產之民或託庇於各大王府，或在衛所成為半農奴——導致長期以來大量人口沒有被納入統計範圍。
在帝國南方，男女人口比例失調則更加嚴重。明代中葉以後，貧富差距急速拉大，大量自耕農陷入貧困之後，因為“重男輕女”傳統觀念影響，為了保住香火傳承，在男女不能同時撫育的情況下，往往優先儲存男孩，將女孩溺殺或者養幾年之後發賣。
。人家外、貨錢賠為視兒把也，庭家有富是便即，步地的”恥為生、榮為男生“到展發經已，區地分部方南在，期時慶隆和期末靖嘉了到
。俗風的慣見空司種一為嬰殺溺致導，擔負的大極了來帶姓百給”侈奢尚娶嫁“為因，地多等府州嚴和府州溫、縣康永、府州台、府波寧、府興紹，江浙在
。讓多遑不江浙之比，象現嬰殺溺量大在存也，帶一安吉西江、府州揚、廣湖、建福、隸直南的際此，江浙了除
。映反種一的上係關會社到折礎基濟經是也，的關相正是例比的稅賦國帝擔負方南國帝個整與這——低降的率生出口人方南國帝致導，行流遍普的習陋的嬰殺溺
。補無本勢大於——型典些抓年每能只，證取法無乎近們他讓率亡死高的兒生新際此，說來府的嬰殺溺擊打於對，且而。決解以予上源從能不並侈奢娶嫁止，題問會社的致導調失構結濟經和距差富貧是更，題問濟經是說來上質本從嬰溺，是但。風歪的嬰殺溺、侈奢娶嫁制遏段手種各用，俗易風移方地求要，旨下次多也鈞翊朱，習陋是如對面，前此
。礙阻大巨造濟經會社個整對將這，態狀的妻娶法無在子男齡適萬千近著味意，萬百六千一出多比男，口人萬千八以乘，1:5.1的人驚了到達例比男的方南國帝個整，實事個一來出揭的心驚目冊黃的來上計統被，在現
