崇禎三年九月。
文淵閣大學士徐光啟以年老體衰，精力不濟為由，上書朱由檢乞骸骨，請求致仕，並推薦周延儒入閣，推薦湯若望為皇莊學院教授…
朱由檢百般不捨，但考慮到徐光啟年事已高，萬般不捨之下，允其所請，但依舊強留徐光啟在京，要求他繼續在皇莊指導莊戶從事農業生產，同時完結《農政全書》後，再回鄉頤養天年。
徐光啟再三推辭不過，隨後無奈應允。朱由檢遂命人在皇莊學院中單獨開闢建立一座宅院，供其居住生活，工作之用。同時派遣內衛二十四小時貼身跟隨保護其安全，並授意皇莊學院繼續聘請徐光啟擔任教授，進行教學。
隨後，朱由檢指使施鳯來，跳過內閣廷推流程，直接提拔宋應星入閣，接替徐光啟繼任文淵閣大學士，同時，任命宋應星為皇莊學院副院長兼教授…
訊息一齣，徐光啟差點沒被被氣死。而施鳯來則是終於被打上了佞臣的標籤，開始被士紳群體口誅筆伐…
…
西苑朱由檢臨時行在。
聽著魏忠賢彙報的曹化淳事件，讓朱由檢大腦有些崩盤，情感上，誰能想到陪伴在自已身邊那麼多年的貼身太監，自已最信任的人之一的曹化淳竟然是敵方的間諜。安全上，敵人將炸彈放到自已身邊，自已竟然還屁顛屁顛的每天都帶在身邊…
於是他成長了，朱由檢決定，以後自已身邊的人，每個人都要查祖宗十八代…
魏忠賢正在給朱由檢彙報事情，眼看著正主在那發呆，輕聲喚道：
“皇爺…皇爺…”
朱由檢回過神來道：
“嗯？你說完了？”
魏忠賢：“…”
這時候，我說完和沒說完有區別嗎…
“皇爺，曹化淳這邊調查的線索全部斷掉了，這時候咬著不放，除了讓咱們暴露，一點作用沒有。老奴已經將暗衛行動隊都撤了回來，讓情報部的人慢慢滲透。請皇爺聖裁…”
朱由檢翻了個白眼，心想，你都決定好了，還問我作甚？於是說道：
“朕不是專權之人，暗衛由你執掌，你只要管好了就行，具體怎麼做，朕沒有興趣…”
“對了，李信和宋獻策查的怎麼樣了？”
魏忠賢聽著心下一喜，這是放權給自已了呀。自已這是得到這小子的信任了…
“是，皇爺。李信和宋獻策的身份都沒問題，兩人入宮之時都籍籍無名，且當時您是突然將兩人弄來的，就算那群人有通天之能，也無法提前預知未來…”
朱由檢心道，這還真是無心插柳柳成蔭啊，遂說道：
“行吧，解除對二人的調查，恢復李信，宋獻策出入西苑的許可權，其他人繼續嚴密審查，朕不希望三軍之中混進來什麼奇奇怪怪的東西。嗯…必須要查清他們的祖宗十八代！”
魏忠賢頓時嘴角一抽，訥訥道：
“是，皇爺。還有，曹化淳一死，大內總管空懸，司禮監那邊，皇爺您還是要安排一下的…”
說著，魏忠賢遞出一張名單道：
“這些都是宮內審查過後，沒有問題的太監，陛下可以放心使用…”
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