然而，預想中的毀滅並未降臨。
一個更加純粹。更加強大的A。T。力場憑空出現，完美地將所有的爆炸衝擊與毀滅性的火焰盡數格擋在外。
而力場的中心，正是那臺通體閃耀著紅光的初號機。
不知何時，它的頭頂，出現了一個由光構成的。聖潔的光圈。
胸口的裝甲已經完全開啟，露出了內部那顆巨大。鮮活。如同心臟般搏動的紅色核心。
「吼——！」
一聲不似人類。彷彿來自遠古洪荒的咆哮響徹雲霄。初號機雙手發力，肌肉賁張，竟硬生生將地面上那片代表著虛數空間的「影子」，如同撕裂一張畫布般，從中撕開了一道巨大的豁口！
「嘶啦——！」
伴隨著這聲撕裂天地的巨響，天空中那巨大的球體投影發出了最後的悲鳴，隨即整個爆裂開來。
沒有火焰，沒有碎片，只有無窮無盡的。如同血液般猩紅粘稠的液體，從爆裂的中心傾盆而下。
一場猩紅的血雨，籠罩了第三新東京市。
沐浴在這場詭異的血雨之中，初號機緩緩站直了身體。
它一手將二號機從即將閉合的虛數空間裂縫中拉出，另一手提著同樣脫困的零號機，靜靜地佇立著。
那姿態，宛如降臨人世的神明。
……
「EVA……到底是什麼東西……」
主控室內，赤木律子呆呆地看著螢幕上傳回的畫面。
她第一次對自己所從事的事業產生了動搖與恐懼。
這真的是人類能夠駕馭的力量嗎？
她們引以為傲的技術，不過是僥倖克隆了名為「莉莉絲」的神之細胞，對其真正的本質，依舊一無所知。
而在她身旁，葛城美里的身體在微微顫抖。
那片猩紅的雨，那頭頂光圈的巨人，讓她腦海深處塵封的。最恐怖的記憶被強行喚醒。
十五年前，南極。
那場將世界拖入地獄的第二次衝擊。
那個引發了一切災難的。被稱為「光之巨人」的罪魁禍首，此刻，其身姿竟與螢幕上的初號機，完美地重合在了一起。
為什麼……會這樣？
EVA，不正是他們為了對抗使徒，為了阻止第三次衝擊而製造出來的，屬於人類的武器嗎？
在所有人之後，冬月幸增看向了身旁那個始終沉默的男人。
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