孫承宗聽聞皇帝擔心武將藩鎮割據之亂並未倉促辯駁，先是拱手一拜，而後從容開口。
“陛下聖慮深遠，防微杜漸，此帝王長治久安之思，臣不敢輕駁。
然唐末藩鎮之禍，與本朝以文制武之弊，根源截然不同，不可混為一談。
其一，唐末之弊，在於地方軍政、財賦、民政盡付武人。
節度使總領一地錢糧、戶口、官吏任免，不用朝廷撥餉，不靠朝廷授官，自給自足、世襲相傳，方能割據自立。
而今大明邊將，無尺寸之土，無自籌錢糧之權。
遼東、宣大、各鎮兵馬，糧餉出自戶部，器械出自工部，糧草轉運由朝廷首轄。
武將只管練兵、作戰、守土，不掌民政，不理賦稅，手中無養兵之財，無治民之權，縱有勇將，何以割據？
其二，本朝‘以文制武’，早己矯枉過正，不是制衡，是捆縛、猜忌、苛制。
如今文官不懂兵略，卻事事掣肘：臨戰遙控佈陣、戰後吹毛求疵、平日剋扣軍餉、言官肆意羅織罪名。
良將束手，悍將寒心，勇者戰死，庸者尸位，這才是邊患日深、流寇西起的根源。
合理制衡，是監察而非掣肘；是節制而非捆殺。
其三，防武將割據，不在文官層層壓制，而在陛下握三大權柄。
一曰兵權拆分：邊鎮之兵，分屬不同總兵、副將、參將，帥無專兵；戰時命將，戰畢收權，兵無常帥，帥無常部，此乃祖宗定製，只要嚴守此法，便無私人部曲坐大之患。
二曰人事收歸朝廷：總兵、副總兵、邊關大將，皆由陛下欽點、兵部考核升遷，武將不得私授官職、私養死士，有功由朝廷升賞，有罪由朝廷論罪，榮辱皆繫於皇權。
三曰監軍有度、巡邊有制：可設總督、巡撫總領邊務，不為牽制戰將，只為統籌糧運、安撫邊民、稽查貪腐；
御史巡邊、兵部巡查，監察軍紀虛實，杜絕冒功、空餉、私通外敵，以文監武，而非以文壓武；以文輔武，而非以文害武。
其西，陛下所憂‘武將飛揚跋扈’，恰恰是權不對等、賞罰不明逼出來的。
將士血戰沙場，文臣坐而論道，稍有失利便彈劾構陷，寸功不錄、小過重罰；
久而久之，忠良畏禍，驕兵自縱，反而愈發桀驁難管。
若陛下明定規矩：將有專戰之權，臣有監察之責；戰場上聽將帥排程，朝堂上受國法約束。
戰守之機，文臣不得外行干政；法度之下，武將不得逾越皇權。
權責分明，獎懲公允，悍將知敬畏，良將知進退，何懼跋扈作亂？
今日大明之患，不在武人太強，而在武人太弱；不在武將擅權，而在文武內耗。
遼東寸土日失，蒙古環伺塞外，陝甘流民百萬，京城倉廩焚燬，饑荒迫在眉睫。
此刻若依舊死守庸人舊論，死死捆住武將手腳，邊軍愈弱，敵寇愈橫，內亂愈烈。
待到山河破碎、流寇圍城，縱使無藩鎮之禍，亦有亡國之危。
不盡破以文制武之陋規，不還邊將臨敵之權，遼事必不可為，邊患必不可平。
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