自此，朝鮮畏懼建奴的戰力，就開始左右搖擺，不再是大明堅定的盟友。
不過，一個人的出現，讓感覺受到委屈和侮辱的朝鮮，找到了偷偷攻擊建奴的方法。
這個人就是明朝的游擊將領毛文龍，他是影響建奴和朝鮮關係的重要人物。
沈遼之戰後，建奴佔據遼東，流亡的遼民要麼逃亡海上孤島，要麼竄入朝鮮境內。
王化貞主持遼東防務期間，毛文龍受到重用，負責出遼海，聯絡遼南的反金將領，招攬流亡的遼民，以騷擾建奴後方。
此後，毛文龍的勢力就逐漸進入朝鮮。
1621年，毛文龍聯合漢人將領陳良策發動了鎮江堡大捷，遼南西衛漢民紛紛應響。
事後，努爾哈赤派阿敏、皇太極東征鎮江，響應毛文龍的遼民或被殺、或被擄，剩下的三萬人避難於朝鮮。
毛文龍也在此時進入朝鮮宣川、鐵山一帶。
十月，努爾哈赤再派阿敏徵毛文龍，明朝游擊隊伍慘敗，毛文龍帶殘兵逃走。
時任朝鮮國王是李琿，史稱“光海君”，他擔心毛文龍繼續留在朝鮮還會引來後金的進攻，導致引火燒身，於是拒絕接納毛文龍。
當毛文龍逃到定州時，守將也拒絕開門。
朝鮮一方面頂住建奴要求捉拿毛文龍的壓力，一方面勸說毛文龍遁入海島。
實際上既想著利用毛文龍牽制和威脅建奴，借刀殺人；又想著控制明國在朝鮮的勢力。
1622年，毛文龍被迫駐紮於朝鮮鐵山皮島（椵島），開闢了東江鎮，以此作為騷擾建奴的基地。
李琿在位期間，擔心王位不穩，展開了大規模的肅清運動。
武將文臣們都擔心自己遭到迫害，人心惶惶，政局不穩。
1623年，李曙、申景禛等武將發動政變，推翻了光海君，立李倧為王，史稱“朝鮮仁祖”。
真是水淺王八多。
李倧上臺後，為了鞏固統治，大力獎賞發動政變的功臣。
但在封賞過程中，李適等人感到不公，於是心生怨恨，甚至預謀起事。
1624年，李適起兵，帶領1.2萬人向漢城挺進，史稱“李適之亂”。
這次叛亂很快被平定了，李適等主要將領被殺，但此事也證明了朝鮮內部矛盾重重。
李倧急需要明朝的冊封來確保自己即位的合法性，因此他在外交上“聯明排金”，對毛文龍進行重新支援。
李倧在朝鮮北部劃出大片土地以供毛文龍集團屯守，不僅免徵商稅，還提供糧食、火器。
毛文龍在朝鮮的勢力迅速增長，不僅控制了皮島、駐紮鐵山，還將勢力範圍佈置在宣川、定州、龍川、昌城、滿浦、漳鹿、長山、石城、廣鹿、三山、旅順等地，嚴重威脅了建奴的大後方。
原本明朝認定李倧是篡位，不予冊封，但在毛文龍的請求下，明熹宗朱由校也從“聯鮮制奴”的大局出發，允許了朝鮮的請求。
1625年，明朝派遣官員正式舉行了冊封儀式。
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