在內裡有螺旋狀的地勢可以讓人安全往中層移動，周圍也有不少的野生寶可夢棲息，在這裡不受外界所打擾的環境，讓悠閒的寶可夢們並沒有對小智一行人做出反應，使得小智他們能夠平安無事的透過。
小智一行人在到達中央區域，在那裡有通往下層的大洞，路上建立有第１觀測站和第２觀測站，這也是剛才因哈莉提及的，她與肯緹尼最深能到達的工作區域，由於小智他們時間緊迫，任務繁重，並沒有進入到其中進行探索，這兩座觀測站的作用也僅僅起到路標的作用，說明小智一行人並沒有走錯方向。
從上層位置下至中層，這裡也有綠油油的草地覆蓋，也有由上層瀑布落下形成的湖泊，中層與上層相比，太陽能照耀到的範圍更小，所以這裡便是第零區草地區域的底層。
中層秘密洞窟內有《朱之書》與《紫之書》中記載的神秘符號，小智一行人同樣無暇顧及，從那些神秘符號的中間徑首穿過。
跑在隊伍最前面的小智，在經過一個被藤蔓遍佈的建築物說道。
“這個是第３觀測站嗎？”
派帕抬頭瞄了瞄在上面若隱若現的門牌後，回覆道。
“沒錯，上面是寫著「第３觀測站」，儘管小的時候我跟車潛入這裡並沒有看清周圍的環境，但我記得行至這裡的時候，我有在縫隙中瞥見這裡一眼，在往外面而去，就是下層洞窟的入口。”
不一會兒，眾人便往著派帕所指的方向跑去，往下一層的方向深入……
來到下層區域，這裡己經是太陽光照耀不到的地底，貧瘠的洞窟中沒有任何的植被生長。但奇怪的是，小智一行人明明身處洞穴，卻不感到這裡的昏暗，周圍反而充滿了亮晶晶的亮光。
小智他們在踏足這裡之後，被這眼前的美景所震撼，除了派帕，畢竟他在十年前與獒教父來過這裡一次。
看著周圍充滿耀眼寶石，開滿亮晶晶的花朵，螺旋狀的地勢可以讓人安全往底層移動，第４觀測站就在他們眼前不遠處的地方。
小青好奇的看著周圍道。
“咦！這些在洞穴中的結晶好像寶可夢太晶化的晶體！”
就在小智與小青看著牆壁上的晶體出神的時候，小青被牆壁上突如其來，發出幽藍色亮光搖曳的花朵所驚叫道。
“那是什麼！”
小智與派帕被小青的驚叫聲吸引，湊了過來看道。
“怎麼了？小青……”
小青顫顫巍巍的回答道。
“剛剛……，那裡有一朵奇怪的花……”
倆人順著小青手指的方向看去，在一片長滿結晶的牆壁上，均沒有發現任何會動的物體存在。
“花……，哪裡有花？”
小青眨巴眨巴後，揉了揉自己的眼睛後說道。
“奇怪？怎麼不見了！難不成是我看錯了……”
就在這時，在他們一旁的皮卡丘與蒂蕾喵發現到了危險的來襲，雙雙“嗷”的一聲後，在小智他們的身後做出戰鬥姿態。
小智一行人被皮卡丘它們的反應所驚擾，紛紛回過頭來看向皮卡丘它們正對峙著的方向，那裡正是他們從中層通往下層的洞口。
看向黑洞洞的洞口，並沒有發現任何的異樣，小智他們疑惑的問道。
“皮卡丘，你怎麼了？”
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