【天幕畫面雙線並行，奈克瑟斯宇宙與高斯宇宙的戰局同步掀起波瀾。奈克瑟斯宇宙內，諸星團在TLT東京分部見到了松永總監。
對方以高濃度R7粒子素為信物，懇請他找到現身的奧特曼適能者，協助提取能量研發適能者病毒抗體。
諸星團未立刻應允，轉而索要了初代適能者姬矢準的住址。
次日，諸星團在郊外戰爭展覽館見到了年邁的姬矢準，告知他孤門一鳴繼承光之力量、後被孤門一輝帶走的始末，向其詢問奈克瑟斯與孤門的線索。
姬矢準拿出三張關鍵照片：一是病患記憶中黑暗山脈深處的三角石刻遺蹟，
二是他與西條凪在異空間“臨終之地”發現的神秘印記。
三是逐月激增的適能者病患資料，預示異生獸正醞釀大規模反撲。
望著第二張照片上的暗紅色圈紋印記，諸星團猛然驚醒，那是究極生命體阿布索留特人的標誌！
小金人來了？
他心頭巨震，懷疑異生獸的反常進化、奈克瑟斯的離奇消失，都與這群操控時空的宇宙人脫不了干係。
談話間，三聲爆炸接連響起，三隻蟻蟲型異生獸現身城郊，呈三角陣型設下能量囚籠圍困天降的賽文奧特曼。
牢籠內電光肆虐，賽文卻憑藉瞬移脫身，以橙紅色光線、奧特斬與光鞭連擊，輕鬆剿滅三隻異生獸。
諸星團透過心電感應與對方取得聯絡，得知這位適能者正是千樹憐，他繼承了諸星團留下的力量，一首在暗中清剿異生獸。
此時日本全境異生獸災害爆發，病毒開始突破記憶膠囊的封鎖，在晚期患者身上實體化，全民皆兵的危機再度降臨。
傍晚，千樹憐與諸星團在TLT總部會合，諸星團將R7粒子素贈予他強化進化信賴者，同時提出了破局之法：借晚期病患的意識夢境，潛入奈克瑟斯遺蹟尋找失蹤的孤門一輝。
隨後千樹憐找到正在深山清剿異生獸的西條凪，諸星團將計劃和盤托出。
西條凪雖覺冒險，仍決意彌補當年對奈克瑟斯的偏見，加入行動。
姬矢準也聞訊趕來，初代適能者三人組時隔多年再度聚首。
松永總監得知計劃後大為震驚，點明三人因體內R7粒子濃度極高，根本無法感染適能者病毒，自然無法憑自身進入遺蹟。
諸星團隨即提出替代方案：藉助病患的夢境，由千樹憐化身賽文構築能量蟲洞，讓眾人以實體闖入遺蹟空間。
松永雖覺匪夷所思，仍為他們提供了拒絕前往烏托邦的晚期病患。
能量蟲洞成功開啟，諸星團、姬矢準、西條凪三人隨千樹憐一同進入遺蹟。眼前的景象遠超三人預期：本該神聖的遺蹟只剩晦暗山脈與血色密林，空氣中瀰漫著壓制情緒的特殊磁場，人類會在此無限復活，被異生獸反覆虐殺以收割恐懼，是一座永無解脫的恐懼囚籠。
賽文救下一名被反覆啃食的受難者並將其淨化，卻並未脫離這片空間，這裡存在多重平行的同位體空間，關押著數不盡的病患意識。
眾人一路深入，抵達遺蹟核心，姬矢準認出了刻滿壁畫的石之翼，正是他初次與奈克瑟斯相遇之地。
千樹憐伸手觸碰石刻，瞬間陷入幻境：銀色的奈克瑟斯向他伸出光絲紐帶，幾乎要將他同化。
危急時刻諸星團三人厲聲將他喚醒，幻境破碎，眼前的石之翼早己異化為怪獸，正用猩紅絲線試圖吞噬闖入者。
賽文掙脫束縛，以護盾反彈黑暗光線，操控頭鏢斬殺了無法移動的石之翼異生獸。
不等眾人喘息，整座三角遺蹟徹底活化，化作擁有劍臂與V型獨眼的巨型遺蹟異生獸，懸浮在空中虎視眈眈。
。謎之隨也落下的輝一門孤，態狀鬥戰進眼捉捕態啟開刻立文賽
。後最外番，區護保羅株宙宇斯高至轉跳面畫
。勢之碾呈力實，態形羅泰級超斯歐卡出聚凝部頭斯歐卡
。人斬迪將又，膛的克傑與代初穿貫，菲佐踩，斯艾碎手隨他
。軀邊半碎打拳一泰超斯歐卡被，撲反合融肢殘弟兄收吸圖妄羅泰的存殘
。碎砸場當被也置裝，竄逃置裝送傳球紅啟他
。走遁速極球紅作化人個整，管接識意一另羅泰，際之死瀕
。天生出逃方對由任，步一了慢仍，擊追態形河銀換切斯歐卡
。球地護守斯高替代，念理的存共平和守堅將，序秩沌混棄摒己早己自明表，群怪的驚安，態常復恢使天斯歐卡後戰
】。相真的曼特奧牌冒群這明探，門登自親後日意決，標座的國之偽了下記也他時同
)怪變會後最翼之石道知就我(
)？阱陷魚釣的生異是都蹟個整著合(
)了去哪跑底到亞諾以所(
)？吧奧偽是也本亞諾會不(
)。溫別特都人金小得覺至甚我(
