他在本地目錄裡翻了很久,找到了自己在MIT期間的部分實驗記錄和工作筆記。
他試圖把當時的處理流程重新搭起來,儘量還原那段時期的工作狀態和引數設定,嘗試在那個框架下復現當時的分析路徑。
【python
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt】
【signal_file = “processed_batch_24_signal.csv”
df = pd.read_csv(signal_file, header=0, sep=“”)】
【region_start = 42130000
region_end = 42135000】
【region_signal = df【(df【“position”】 >= region_start) & (df【“position”】 <= region_end)】【“signal”】.values】
.......
else:
print(“未檢測到顯著異常訊號。”)
看到這個結果,林曉搖搖頭。
他剛才用掃描框架跑了一遍目標區域的資料,沒有出現預期的訊號偏移。
程式碼執行正常,沒有任何明顯的錯誤提示,也沒有顯示出異常偏離的痕跡。
但也沒有返回他想要看到的結果。
果然,時間隔得有些久了。
當時使用的軟體版本、資料格式、參考基因組註釋,都和現在這套體系存在細節上的出入。
有些差異他可以手動調整,有些則無法完全對齊。
他跑了幾組對照,結果都和預期有差距,波形並沒有按照他預想的方式重現。
他停下了操作,看著螢幕上那幾行輸出的結果,沒有繼續嘗試調整引數。
那些差異積累起來,己經足夠讓他的預期落空。
林曉盯著螢幕上那幾行輸出結果看了一會兒,準備結束今天的工作。
霍夫曼一首站在他身後,沒有離開。
他沒有說話,只是安靜地站在一旁看著林曉的操作過程。
看到林曉把註釋加上、儲存檔案、關閉編輯器之後,他才開口:“沒有重現?”
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