正所謂一朝天子一朝臣，在權力更迭之際也是廟堂洗牌之時，這是歷史的規律，但如果自身正處於動盪不堪或者剛由大亂到大治，那麼內部的洗牌必然會引起極大的震動，甚至有可能導致滅亡。
儘管武田晴信以迅雷不及掩耳之勢，將一場尚未發生的‘謀反’彈壓，並將相關之人盡數抓捕歸案。
但是，對於這些人的處置，武田晴信則是陷入了沉思。
雖說以目前武田晴信本人的能力、威望來說，他可以將這些潛在威脅盡數剷除，進一步強化自身的君權。可武田義信畢竟是今川義元的女婿，若是對他的處置稍有不慎，那麼今川家必然會因此與武田家反目成仇。
而且，前任武田家家督武田信虎仍居住在今川家本據駿府館外的城下町之中。
眼下，只要今川義元有擁立武田信虎重返甲斐、再度擔任武田家家督的想法，那麼以目前武田家的實力，是無論如何都無法與之進行抗衡的。
如今的武田家單單面對上杉軍的大舉侵攻，都是左支右絀，狼狽不堪，甚至還有隨時崩盤的可能，急需今川家的大力支援。若是失去了今川家支援，那麼武田家很難支撐到秋收之時。
然而，武田晴信此時面對的幾乎是一個死局——不剷除潛在威脅吧，家督地位不穩；剷除吧，武田家所面臨的形勢將會更加危急。
但出於防守的本能，人一般都會選擇先穩固自己的地位，就像宋高宗趙構在北方領土和皇位之間選了皇位一樣。
在經過再三權衡之後，武田晴信還是打消了廢嫡以及送歸今川鈴姬的想法。他並不願從甲斐源氏的庶子家中去收養一個養子來繼承武田家的家名，畢竟肥水不流外人田。
作為武田家御一門眾的穴山家是親今川派之首，小山田家是親北條派之首。而透過聯姻的方式成為御一門眾的彌津家在川中島八幡原之戰後被上杉家攻滅；木曽家、下條家在叛離武田家後倒向了上杉家。
可以說，武田家的這些御一門眾中很少與宗家一條心的。之前是這樣，現在依舊是這樣。
算上嫡長子武田義信，武田晴信目前為止只有四個兒子，三個為嫡出，一個為庶出——武田義信、海野信親、西保信之（安田信之、武田信之，一說與廳南武田家武田豐信為同一人）、諏訪四郎丸。
其中，武田晴信的次男海野信親是個盲人，且一度被送入長延寺之中出家為僧，後來還被指認為海野家家督，迎娶了海野幸義之女為正室；三男西保信之很早就被安排繼承了武田家庶子家西保家（安田武田家）的家名，擔任要害山城城主。
於是，為了儘快平息此次‘謀反’事件，武田晴信便下令將參與‘謀反’的首要之人飯富虎昌、曾根周防守（武田義信乳母之夫）、楠浦虎常、漆戸虎光、長坂昌國、勝津野昌世、穴山信豐、梁田彌太夫等人誅殺，雨宮家次等部分武田義信馬廻眾流放出甲斐，曾根昌世、跡部勝忠（勘定奉行）、長沼長助等人進行蟄居。
至於武田義信的處分，武田晴信只是繼續將其幽禁在東光寺之中，但許可其正室鈴姬進行探望。同時，他還向今川義元表示這是武田義信御下不力所致，並不會因此廢嫡，更不會讓武田義信與鈴姬離緣。
對於處置‘謀反’之人有功的家臣，武田晴信也進行了一定的賞賜:荻原豐前守獲得太刀“一條三原”；因飯富家多次謀逆已蒙上了恥辱，飯富昌景繼承曾經因為山縣河內守虎清被武田信虎誅殺而斷絕的山縣家家名，並更名為山縣三郎兵衛昌景
另外，飯富虎昌與武田義信的一部分家臣除了誅殺、流放之外，其餘之人也被分拆給了家中重臣們:山縣昌景獲得五十騎；跡部勝資獲得了一百騎；松尾信是（武田信虎之子）獲得了五十騎。
就在武田家中不穩之際，海尻城因糧草告罄、外無援軍迎來的末期。
由於武田晴信正忙於穩定甲斐一國的局勢，就導致上杉家從後方源源不斷的調集援軍至海尻城下，使得上杉清定所統轄的本隊軍勢已經膨脹至一萬七千餘眾。
而海尻城不僅被切斷了與外界的一切聯絡，甚至連汲道也被上杉軍切斷了，城中守軍陷入了斷糧斷水的窘境之中。
即便如此，原虎胤、多田昌賴等人依舊堅信著自己的主君武田晴信還是會派遣援軍前來，並沒有因此放棄，反而打算繼續負隅頑抗。
清定認為攻落海尻城的時機已至，便下令對海尻城發起了最後的攻擊。
隨著清定的一聲令下，早就蓄勢待發的上杉軍各部是一擁而上，如同黑色潮水一般，從四面八方向著海尻城攻去，在利用雲梯和縋繩攀上海尻城後，就對城中因缺糧斷水而無力抵抗的守軍舉起了屠刀。
原虎胤、多田昌賴等人不願束手就擒，用自己最後的力氣於大廣間之中手持肋差互刺而亡。
至此，堅守了一個月之久的海尻城被上杉軍攻落。同時，也宣告著武田家的勢力被徹底逐出了信濃佐久郡，足輕大將四天王家之一的多田家也絕嗣了。
在攻落海尻城後，清定就留泉親重率三百餘軍勢留守海尻城，令長野業正、高田憲賴、小幡景定、倉賀野尚行等將率五千餘軍勢陳兵於佐久郡與甲斐山梨郡境目地帶的川上原，做好隨時越過信州峠攻入山梨郡境內的準備。
清定自己則是率一萬一千餘軍勢南下至海口城，在稍作休整後，做好隨時越過清裡口，攻入甲斐巨摩郡的準備。
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