隨後，清定便追贈登坂清高為加賀守護代、越前守護代、鎌倉府問注所執事、等職，命其弟登坂安忠負責接替登坂清高統轄登坂勢，繼續隨北陸道上杉軍行動。還讓北陸道上杉軍總大將柿崎景家派人將他的遺體送至越後刈羽郡實相寺安葬，並召集越中、越後、能登三國的高僧為其做法事祈福。
不僅如此，清定還讓登坂清高的長男登坂藤右衛門入嗣魚沼甘糟家，成為上杉家譜代家臣甘糟繼義的婿養子，賜予金覆輪太刀一把，待元服後拜領‘清’字，更名為甘糟清長（甘糟景繼）。其次男登坂藤太郎繼承魚沼登坂家家名，以及登坂清忠遺領兩萬七千石知行地。
像這種業績突出的家臣，清定也用幾乎是空前絕後之禮，為家中之人做出了表態：只要忠心奉公，他都看在眼裡，全都看在眼裡。
對於加賀一向一揆眾的頑固派，以及朝倉軍，柿崎景家、齋藤朝信可沒有什麼招降的想法，直接選擇了亮刀子。
此時的北陸道上杉軍本隊、偏師，以及光教寺等各部軍勢齊聚於大聖寺城外，鯰川清長所率的先陣軍勢則是將山中城團團包圍起來。同時，還將大聖寺城、山中城與越前之間的聯絡徹底切斷。
作為朝倉軍總大將的真柄直隆意識到腹背受敵後，也只能率四千餘軍勢拼死抵抗，希望能堅持到主君朝倉義景派遣援軍前來解圍。
柿崎景家、齋藤朝信見接連二十多天的猛攻都沒能攻破大聖寺城，便決定故技重施——引水灌城。
如此一來，城中的堀江景忠、黑坂景久等人見大勢已去，意識到自己根本無法活著等到主君朝倉義景發兵前來解圍後，便主動用箭書與城外的北陸道上杉軍進行聯絡，並盡報城內虛實。
柿崎景家、齋藤朝信等北陸道上杉軍諸將在看完箭書以後感到非常高興，當即下令對大聖寺城再度發起猛攻。
堀江景忠、黑坂景久等人還主動將大手門、搦手門開啟，迎上杉軍進入。
真柄直隆畢竟是朝倉家中的頭號猛將，擅長使用一把長為五尺三寸（約175cm）的太郎太刀。當他獲知上杉軍如同潮水一般湧入城中後，二話不說就率麾下馬廻眾前往三之丸進行阻擊。
在真柄直隆如同惡鬼修羅一般的兇猛衝擊之下，其四周是頭顱殘肢四處飛舞。
北陸道上杉軍突入大聖寺城中的武士、鄉士、足輕都沒有料到朝倉軍中竟然有如此猛將，攻勢也一度遭到遏制。
見真柄直隆如此悍勇，柿崎景家、齋藤朝信等北陸道上杉軍諸將雖然心生愛才之意，但也不能繼續坐視此人大量殺傷己方的武士、鄉士、足輕。
於是，柿崎景家果斷下令麾下鐵炮隊向真柄直隆進行集火射擊。
僅僅一陣硝煙過後，真柄直隆以及緊隨其後的二十餘名馬廻眾皆被打成了篩子。
即便如此，真柄直隆滿是槍眼的屍體依舊屹立不倒，仍然做出一副準備揮舞太郎太刀的樣子，使得上杉軍的武士、鄉士、足輕皆繞道而過，不敢靠近。
由於總大將真柄直隆陣亡後，大聖寺城守軍計程車氣、戰意頓時如同洪水洩閘一般流失。
真柄直澄（真柄直隆之弟）、三輪三郎等大聖寺城守將因兵力寡少，在戰至力竭後是被上杉軍所討取。三之丸、二之丸、西之丸等城中大部分地區皆被上杉軍迅速壓制。
作為守將之一的佐佐布掟俊倒是趁著城中混亂之際，縋城而下，意圖逃回越前，但還沒逃出多遠，就遭到了落武者狩，其首級還以十五貫銅錢的價格賣給了北陸道上杉軍。
最後，眼見城破在即的溝江長逸並沒有效仿堀江景忠、黑坂景久等人那樣倒戈，反而是在上杉軍攻入本丸之前，於大廣間之中切腹自盡了。
經此一役，進入加賀支援加賀一向一揆眾殘部的朝倉軍全軍覆沒，自真柄直隆、真柄直澄、溝江長逸、佐佐布掟俊、三輪三郎等人以下，被討取四千餘人。
與此同時，討伐盤踞在南江沼郡山中莊的加賀一向一揆眾殘部的戰事也進入了尾聲。
獲知北陸道上杉軍大舉來犯，作為加賀一向一揆眾殘部首要人物的岸田新四郎為加強防備，便分兵于山中黑穀城、水無山城、長壽寺、貓巖城、法圓寺、上原城等十餘座山中城外圍城池兵砦、一向宗寺院進行守備，意圖節節抵抗，阻擋北陸道上杉軍的攻勢。
鯰川清長以北條芳林、小國重賴、上野家成三部為先手役，兵臨法圓寺的寺內町外。
法圓寺守將莊四郎五郎、小黑源太等人早就被北陸道上杉軍嚇破了膽，根本不敢與之交鋒，直接一矢不放的棄寺逃往岸田家本據山中城北面的長壽寺才停下。
隨後，鯰川清長便集中兵力，在半天之內，就一舉將孤立無援的上原城攻落，討取自守將黑瀨藤兵衛以下三百餘人。
就在山中莊的門戶重地上野城、法圓寺兩地皆被北陸道上杉軍奪取後，鯰川清長直接以先陣主力攻向山中城，由大川忠秀、五十公野弘家、登坂安忠等部負責監視、牽制山中黑穀城、貓巖城、水無山城等地，做出佯攻姿態。
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