雖說上杉清定將京都之中僅存的皇室、公家先行遷往越後府中，但他並沒有忘記白神果春、高木右近、三上大和守等北面武士捨生忘死的阻擋三好·六角聯軍攻打禁裡御所。
為了表彰白神果春、高木右近、三上大和守等北面武士的忠義之舉，清定便命人將收集到殘存骸骨厚葬在深草北陵的正北方，還破格追贈他們為從三位位階。
不僅如此，清定在獲知白神果春之子白神帶刀正在備中四處流浪，過著飢寒交迫的日子後，就特地派遣物見奉行加藤段藏從備中，將其接至京都，一面表奏其擔任從四位上左近衛權少將兼右京亮的官位，一面任命其暫時擔任石清水八幡宮宮司、北面武士筆頭等職。
當然，清定坐鎮於京都清水寺的這段時間裡可不單單對己方有功之人進行賞賜，以及清算敵對勢力。
從表面上看，上杉清定已經成為繼三好長慶之後的新一位天下人，並稱霸近畿諸國。可實際上，死亡和裂變遠遠沒有終結的跡象。
因為，上杉家只不過是替代了執朝廷、幕府牛耳的三好家罷了，並沒有完成一統天下。
此時的扶桑仍然是一個分崩離析、群雄割據的亂世殘局。
除了已經兼併秋津島（本州島）過半的上杉家外，遍佈西國、四國、九州，且尚未臣從於上杉家的大名尚有割據攝津、河內、和泉、淡路、阿波、讃岐等地的三好家，割據豐後、豐前、筑前、筑後以及肥後大部的大友家，割據長門、周防、安藝、備後等地的毛利家，割據播磨的赤松家、割據備前大半的備前守護代浦上家，割據近江甲賀郡絕大部分的六角家，割據伊賀大部的仁木家，割據伊勢半國的伊勢北畠家，割據土佐半國的一條家，割據近半伊予的西園寺家，割據伊予宇和郡半郡、喜多郡半郡的伊予宇都宮家，割據日向大半的日向伊東家······
清定深知若想上杉家不陷入近畿諸國這個泥潭之中，且能夠將大部分兵力順利撤出，只能想方設法讓這些敵對勢力的內部無法上下一心。
不論古今中外，世上有三樣不等人：炎夏、秋收和戰爭。清定可不打算長期將大軍雲集于山城、丹波、若狹、近江等國之中。
為此，清定就將目光投向了與丹波、攝津、備前、美作、因幡、但馬等國接壤的播磨國。
別看赤松家名義上是播磨守護，且曾是足利將軍家的四職家之一，家格與一色家、山名家、京極家幾乎持平，但隨著時間的推移，以及受嘉吉之亂的影響，使得赤松家的實力遭到極大的打擊。
畢竟，嘉吉之亂是足利將軍家成為武家棟樑、天下共主後的首次公然弒君之事。同時，赤松家也成為了人人喊打的反逆之臣。
就算赤松家因禁闕之變中，奪回了被南朝一方搶走的三神器，獲得了足利將軍家的再度重用，可仍然沒能收回美作一國的控制權。
加上赤松家的庶子家遍佈播磨一國全境，這些赤松家的庶子家被世人稱之為‘赤松三十六家’。
其中，別所家、佐用家、宇野家、小寺家還是三十六家赤松家庶子家中實力最強的存在，被稱之為‘赤松四天王’。
像龍野赤松家、上月家、廣瀨家等赤松家庶子家雖然實力不強，但也都佔據著一些播磨境內的重鎮要地，常常對總領家赤松家是聽宣不聽調。
由於播磨一國鄰近京畿，自從室町時代中期開始，播磨國雖然是由赤松家世襲罔替守護職，但室町幕府卻有意扶持赤松家的重臣以鉗制四職家之一的赤松家。
而室町幕府看中的就是赤松家五大重臣之一、東播磨守護代別所則治，與另一位在西播磨有著不小影響力的重臣浦上則宗。
這就使得赤松家的內訌一直持續到文龜二年（1502年），浦上則宗病死為止。在這場長達七年的對立、內訌期間，赤松家領有的另一領國備前國也出現了不穩的跡象。
早在明應六年（1497年）起，世襲罔替備前守護代的松田家眼見赤松家出現內訌爭執，就打算趁此機會一舉奪取備前一國作為松田家的領國。
松田家禍發西端，領地位於西播磨以及東備前之間的浦上家在與別所則治對立的同時，也不得不分兵前往備前彈壓。
然而，松田家的抵抗非常頑強，浦上家的反擊並不順利，反而被松田家壓制。
直到文龜二年，浦上則宗病死以後，松田家看準機會，持續攻打浦上領，甚至還將交戰規模進一步擴大，使得東備前、西播磨等地的大大小小國人領主大都捲入其中，包括後來成為浦上家重臣的宇喜多家。
不僅如此，同年赤松家五大重臣之一的龍野村秀（赤松村秀，龍野赤松家家督）也病故了，這就使得原本赤松家五大重臣相互之間牽制的格局開始逐漸崩壞。
就在赤松家處在危急關頭之際，挺身而出的反而是赤松政則的正室洞松尼。
洞松尼是管領細川政元之姐，雖然其相貌醜陋，被京畿諸國之人稱之為‘鬼瓦’，但是其政治手腕相當高明。
洞松尼利用細川政元的影響力，為自己以及女婿赤松義村撐腰，鎮住意圖割據一方自立的赤松家重臣們，就算在細川政元被暗殺以後，依舊沒有影響到她在赤松家的地位。
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