經過一個多月養精蓄銳的上杉軍本隊在上杉清定的一聲令下，如同猛虎下山、餓鷹撲食一般，到處張牙舞爪。
作為上杉軍本隊先手役的本莊繁長是身先士卒、先登陷陣，一舉攻落位於山城、攝津兩國境目地帶的上牧山城，討取自守將三好新左衛門以下三百餘人，奪取糧草兩萬石、戰馬一百匹。
上杉軍攻落了上牧山城這一通往三好家本據芥川山城的必經之地後，可謂是士氣大振。
隨後，上杉軍本隊便以絕對的兵力、裝備優勢，乘勝接連攻落芥川城、今城、帶仕山城、普門寺城、大塚砦、唐崎砦、太田城等地，進而將三好家的本據芥川山城團團包圍起來，卻並沒有立即發起攻城。
因為，清定知曉芥川山城本就是一座易守難攻的城池，且先後作為京兆細川家、三好家的本據，頻繁被增築加固，就算城中沒有太多的守軍，己方也無法輕易在短時間內將其攻落。
於是，清定為了避免遭到不必要的傷亡，便決定來個圍點打援。
畢竟，三好家家督三好熊王丸以及其後見役、三好三人眾筆頭的三好長逸皆在芥川山城之中，清定就等著坐鎮於和泉、河內兩國的巖成友通、三好笑巖等人率軍趕來解圍，自己就能將三好家在近畿諸國之中殘存的兵力一舉殲滅。
於是，清定就下令在芥川山城外挖掘蚰蜒壕，同時還在其四面設定犬鋪，以犬守備，又在各部營砦的四面設定木架，掛鈴於上，只要一有動靜，立刻便能發現。
清定打算以此嚴密手段，來徹底隔絕芥川山城與外界的一切聯絡。
不出清定的意料，茨木城城主茨木重朝（茨木重親）、三宅城城主三宅村良、稻田城城主中川重清（中川清村養子，高山重利次男）、高山城城主高山重利、高槻城城主入江春正、池田城城主池田長正、伊丹城城主伊丹親興等人在或者芥川山城被圍困後，並沒有坐視不管，反而先後率本部軍勢前來馳援。
但攝津諸將缺乏統一指揮，且各自為戰、兵力寡少，最終因兵力、裝備皆處於劣勢而被上杉清定從容派遣甘糟景持、水谷正村、金津義舊等部擊退。
而後，士氣高昂的甘糟景持、水谷正村、金津義舊等部還乘勝追擊，一路尾隨三好軍的敗軍，進而先後攻落富松城、三宅城、茨木城、高槻城等地，還討取茨木重朝、三宅村良、入江春正等數名攝津有力國人領主們。
由於中川重清、高山重利等北攝津諸將擅自率軍前去馳援芥川山城，使得北攝津一帶的守備頓時變得形同虛設，導致宇佐美定勝所部得以順利攻入能勢郡境內，並接連攻落山邊城、三藏山城、小島端城等數座城池兵砦。
丸山城城主能勢賴幸、一藏城城主鹽川政年等人自知無力抵擋上杉軍的凌厲攻勢，便一矢不放的棄城逃往越水城。
不久後，加茂城城主荒木村重見主君兼岳父的池田長正看不清天下大勢，仍執迷不悟的繼續追隨三好家一方後，便聯合池田基好（池田四人眾之一）、池田正村（池田四人眾之一）、吹田村氏（荒木村重之弟）、吉田源介等人，擁立少主池田勝正進行發難。
因出兵馳援芥川山城而遭到上杉軍重創，使得池田長正在面對蕭牆之禍毫無反制能力。
所幸，以荒木村重為首的攝津池田家重臣們並不打算取池田長正之命，僅僅只是將其流放處境罷了。
在完成家督更迭後，荒木村重、池田基好、池田正村等攝津池田家重臣們迅速派遣使者前往上杉軍本陣，一面向上杉軍遞交新任家督池田勝正之弟池田知正為人質，並獻出糧草一萬石，以示恭順。
清定鑑於攝津池田家作為京兆細川家的被官出身，且與榎並三好家頻繁進行聯姻，便決定對其網開一面，授予本領安堵的處分，並要求之後需作為上杉軍先導役，協助上杉軍靜謐攝津一國。
永祿二年，十一月二十五日。
距離上杉軍本隊攻入攝津境內僅僅不到三天的功夫，芥川山城外圍的支城兵砦已經被上杉軍盡數拔除，宇佐美定勝、波多野元秀等將所率的九千餘丹波眾也與上杉軍本隊合流。
為了進一步震懾芥川山城的守軍，清定就命人將前不久討取的兩千餘顆三好軍首級放置在芥川山城外示眾。
芥川山城僅僅堅守了十天的時間，在看到一波又一波的援軍被城外的上杉軍擊潰，以及同僚們的首級接二連三的放置在城外後，城中軍心崩潰，大量城兵、協防領民縋城而下，前往上杉軍陣地投降，三好長逸根本無力阻止。
眼見無力繼續堅守下去，三好長逸在經過再三權衡後，選擇剃髮出家，取法名北齋宗功，並派遣麾下重臣坂東季秀作為使者前往上杉軍陣中，請求開城投降。
然而，清定卻並不打算接受三好長逸的投降。
在清定看來，三好家先前的所作所為已經到了天怒人怨、罄竹難書的地步。
先不說三好家發兵燒討比叡山延歷寺之事，單單發兵攻打禁裡御所、迫使後奈良天皇自盡，就已經把後路給徹底走死了。
要知道，不論是鎌倉幕府執權北條家，還是足利將軍家，在鼎盛之時都不敢迫使現任天皇自盡，頂多是流放後另立新君罷了。
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