袁崇煥說督師軍前有便宜處置之權，毛文龍虛兵糜餉、私市拒調，十二罪已經呈明。各島兵將依附於毛，若押解奏請，訊息傳開，誰也不肯聽點，殺他正是為了整頓東江。
“整頓以後呢？”天啟問。
袁崇煥答諸島已經分領，各將受約束，餉額正在重核。魏忠賢在旁呈上停糧、換冊與補發的迴文，沒有開口。皇帝翻過，叫袁看候查期間幾處報斷口糧的日期。
袁崇煥說下頭辦理失當，應責經管之人，毛的罪卻不因領糧出了差錯便可免。又奏若事事候京中回旨，海上軍情往來，幾時能辦成。
“朕給你的舊敕在，六月給你的明旨也在。”天啟將兩件併到他面前，“哪一件準你見著後旨，還只拿前敕行事？”
袁崇煥再拜，說當日確有不得不決之勢。他願獨任，未敢推給旁人。
天啟臉色沉下去，叫兵部取雙島在場諸將的回報，查誰見過拒調，誰聽過軍前議處。那些人各有說法，案子半年沒有合攏；袁奏軍中已定，皇帝卻還得另遣人給被停糧的兵匠接飯。
“朕命你查，你先斬了。再問罪，你說願任。那道旨到了邊上，還算不算朕的話？”
御史在這時出列，奏請將兩案合看。毛文龍牽制後金後方，殺毛之後敵即繞塞而入，袁又疑遲主力，其間不無可疑。疏中用上了通敵二字，請留袁嚴訊。
袁崇煥聽到末句，抬起頭來。
天啟讓御史把見過的人、查得的書信說清。對方答疑跡既重，須先收查，若不查，證據怎會自己送來。皇帝將疏留下，卻不許把通敵寫進今日的案由。
“你疑是他引敵，就拿出引敵的證據。幾封論失守的疏，換個題頭，便成了通敵？”
孫承宗等御史退回，才出班奏，昨日關寧諸營的戰功不能抹，督師的失察和越權也不能以一戰抵消。但眼下留人，必須同日把領兵之人定下，朝廷要查袁，不能讓遼將猜測下一道鎖鏈是給誰的。
天啟問他，可願暫攝關寧軍務。
“臣領京畿排程，督師這一層可以接。祖大壽仍統原部，各營將領也須留，不能今日換帥，明日將帶兵的人全換一遍。”
信王始終在旁聽著，直到皇兄問他看法，才合上戰報。他不敢替袁斷臨陣的罪，只說軍中訊息未必同宮裡一樣全，先傳出去的是拿人，臣弟以為詔中應將查什麼、不查什麼寫明。
天啟命擬旨，袁崇煥留錦衣衛候查，列雙島擅殺總兵、薊門敵情失察、入援排程失當三項。督師關防封存，由孫承宗暫攝其軍務。祖大壽及諸將原官、本營不動，仍各領原部，不因袁案株連各營。
擬旨時，兵部尚書請先派人去營中核收關防、令符。值房早晨已有交代草案，若袁留候即可照辦，其中將本部兵符也列在暫收核驗之內。
孫承宗看過，立即請劃去後一項。
“封的是督師關防。祖大壽還要帶兵，符也拿來，外頭認誰的令？”
尚書說暫驗後歸還，並非奪去，孫承宗仍不肯。天啟遂命將各營印符仍歸本將、不許借交代收驗寫入新旨。部裡已擬的單不許再照舊發，另派人去營中宣明。
袁崇煥直到旨稿寫完才開口，請皇帝將今日的糧發到營裡，昨日受傷的也別因離營漏掉。
魏忠賢說糧車已在候出，棉衣、傷藥也齊，只是積欠餉銀湊不全。天啟讓先發實銀，餘欠另核，不能拿一紙領票代過今日。魏忠賢請由內臣押送，與本營將領當面發給，又向袁問昨夜傷者送去了幾處。
袁崇煥報了車場與醫舍，魏忠賢逐處記下，叫把給傷者的那份分出來，隨醫官認人。
“將軍的案留京裡問，兵吃的糧今日送到。陛下既交咱家辦，少了哪營，叫他們來報。”
袁崇煥望著他，最後還是作了一揖。錦衣衛官隨後上前，請他往另一側走，只准一名隨員跟去。宮門外等候的親隨看見人沒從原路出來，問了兩回，只問出督師被留，便上馬出城。
孫承宗領新旨前，另遣一騎去營中傳話，叫祖大壽穩住本部，印符不交，自己隨後親至。他剛要出門，兵部又送來北面敵騎的回報，請他先定兩營接應的位置；他將圖移過來，隨員在門口等馬，旁邊擬好的新交代令還在鈐印。
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