佐助決定阻止宇智波斑的陰謀後，大蛇丸與鷹小隊剩餘成員一同趕往戰場治療五影。
大蛇丸和三代火影這對師徒，在面對神樹分裂體時展現出了無與倫比的默契。大蛇丸首先發動了他的忍術——潛影蛇手，無數條毒蛇如閃電般迅速纏繞住了神樹分裂體，使其動彈不得。
緊接著，三代火影毫不猶豫地揮舞起他那根著名的金箍棒，這根棒子在他手中彷彿擁有無窮的力量。只見他猛地一揮，金箍棒狠狠地砸向神樹分裂體，瞬間將其打斷成數段。
在不遠處，綱手目睹了這一幕，她的目光落在了自來也的墳墓上。想起曾經與自來也的點點滴滴，她心中不禁湧起一股慚愧之情。
然而，戰鬥並沒有結束。經過眾人不懈的努力，十尾人柱力帶土終於被擊敗了。但就在這時，一隻神秘的漩渦狀白絕突然出現在戰場上，攔住了眾人的去路。
這隻白絕名為阿飛，他的實力深不可測。面對以三代目火影為首的忍者聯軍，阿飛毫無懼色，一場驚心動魄的惡戰就此展開。
與此同時，佐助也遭遇了巨大的危機。他被複活的宇智波斑擊倒在地，生死未卜。香磷心急如焚，想要立刻前去救治佐助，但大蛇丸卻冷靜地勸誡她和其他兩人稍安勿躁，等待合適的時機再行動。
終於，在經過一番激烈的戰鬥後，大蛇丸四人終於等到了一個稍縱即逝的機會。他們毫不猶豫地抓住這個時機，施展出渾身解數，成功地壓制住了強大的阿飛。
趁著阿飛被壓制的瞬間，大蛇丸四人立刻抓住機會，如離弦之箭一般飛速突破了阿飛的包圍圈。他們心急如焚，全速奔向佐助所在的地方，心中默默祈禱著能夠及時趕到。
當香磷、水月和重吾三人趕到時，他們的心情異常沉重，因為他們不知道是否還來得及治療佐助。然而，就在他們感到絕望的時候，一個意外的發現讓他們燃起了希望——兜早已在那裡，正全神貫注地救治著佐助。
時間一分一秒地過去，整個場面異常緊張。兜全力以赴地施展著他的醫術，每一個動作都顯得格外謹慎。經過一段漫長而焦急的等待，佐助的身體終於有了反應。他緩緩地睜開了眼睛，雖然眼神還有些迷茫，但顯然已經脫離了生命危險。
就在這時，無限月讀突然開啟，一道耀眼的光芒籠罩了整個世界。大蛇丸和其他人都來不及反應，便一同被這股強大的幻術所籠罩。他們的身體被神樹的分裂體緊緊纏繞，無法掙脫。
然而，幸運的是，無限月讀最終還是被解除了。隨著光芒漸漸消散，大蛇丸和其他人終於重獲自由。他們感到如釋重負，同時也對這場突如其來的變故感到後怕。
由於大蛇丸已經徹底改邪歸正，並且在第四次忍界大戰中帶領鷹小隊剩餘成員立下了赫赫戰功，所以他不再被列入叛忍名單中。這對於大蛇丸來說，無疑是一個全新的開始，他可以放下過去的包袱，重新迴歸正常的生活。
並且被允許在不涉及他人生命安全的情況下繼續做實驗，但仍需要被歷代火影派人暗中監視。第四次忍界大戰結束後十幾年後鳴人接替卡卡西成為七代目火影。
在《博人傳》這部作品中，大蛇丸展現出了令人驚歎的技術實力。他成功地對自己的身體進行了完美的改造，不僅讓自己變得比以往更加年輕，還獲得了再生能力。這意味著，即使他的身體受到了損傷，也無需像其他忍者那樣透過結印來施展醫療忍術，受損的部位就能自動完成再生。
然而，一個新的敵人——宇智波信的出現，讓鳴人和佐助意識到這其中可能與大蛇丸存在某種關聯。於是，他們決定找到大蛇丸一探究竟。
當鳴人和佐助找到大蛇丸時，大蛇丸向他們透露了一些關於宇智波信的重要資訊。原來，信並非普通人物，他實際上是大蛇丸的實驗體之一。信的體質極其特殊，對於移植在自己身上的任何組織都不會產生排斥反應。
基於這一獨特的體質，大蛇丸在信的身上進行了一系列大膽的實驗。他將許多團藏在宇智波滅族事件中收集到的寫輪眼移植到了信的身體裡。這些寫輪眼賦予了信強大的力量和特殊能力。
不僅如此，大蛇丸還將信已經移植好各種寫輪眼的右臂送給了團藏，成為了團藏的新右臂。這一舉動無疑讓團藏的實力得到了極大提升，同時也讓信成為了一個極其危險的存在。
大蛇丸不僅曾經使用信的細胞成功克隆出了大量信的克隆人，而且這些克隆人在一定程度上保留了信的某些特質和能力。然而，後來信卻帶著一部分克隆人毅然決然地離開了大蛇丸。
在劇場版《火影忍者劇場版：博人傳》中，有這樣一個情節：當博人和佐良娜好奇地詢問巳月關於他父母的事情時，巳月毫不猶豫地回答說他的父母是大蛇丸。面對佐良娜進一步追問大蛇丸到底是他的爸爸還是媽媽時，巳月則表現得十分淡然，他回答道：“我倒覺得不管算是爸爸還是媽媽都無所謂啦。”就在這時，畫面一轉，我們看到大蛇丸正躲在不遠處，默默地觀察著這一切。
大蛇丸的戰鬥經歷也是相當豐富的。他曾經與山椒魚半藏交戰，但不幸落敗（這是在第二次忍界大戰時，當時他與自來也、綱手三人協力對抗山椒魚半藏）；他還與三代目火影猿飛日斬有過一場激烈的對決，不過這場戰鬥最終因為某些原因而中斷（這是 TV 動畫原創的情節）；此外，大蛇丸與旗木卡卡西也交過手，並且成功戰勝了卡卡西（同樣是 TV 動畫原創的情節）；然而，當他面對宇智波鼬時，卻遭遇了慘敗；不過，在與四代目風影羅砂的戰鬥中，大蛇丸則展現出了強大的實力，最終取得了勝利（這場戰鬥是他與君麻呂、藥師兜三人協力完成的）。
這場戰鬥對於他來說簡直就是一場輕鬆的遊戲，他的實力遠遠超過了這三個草忍。只見他身形如電，瞬間便避開了草忍們的攻擊，然後以雷霆萬鈞之勢展開反擊。他的每一招每一式都猶如疾風驟雨一般，讓草忍們根本無法抵擋。僅僅幾個回合，這三個草忍就已經被他打得毫無還手之力，最終只能乖乖地認輸。
這一次，他面對的是三個實力強大的對手，他們分別是鳴人、佐助和小櫻。然而，他並沒有絲毫的畏懼，反而露出了自信的笑容。戰鬥一開始，他就展現出了驚人的實力，他的攻擊如同狂風暴雨一般，讓鳴人、佐助和小櫻三人疲於應對。儘管他們三人聯手抵抗，但還是無法抵擋住他的猛烈攻勢。最終，他以絕對的實力戰勝了這三個強大的對手。
御手洗紅豆雖然也是一名實力不俗的忍者，但在他面前還是稍顯遜色。他的速度快如閃電，力量大如雷霆，讓紅豆根本無法與之抗衡。在激烈的戰鬥中，他巧妙地避開了紅豆的攻擊，並抓住機會給予她致命一擊。最終，紅豆在他強大的實力面前敗下陣來。
這場戰鬥異常激烈，雙方都使出了渾身解數。三代目火影猿飛日斬作為木葉村的頂尖忍者，其實力自然不容小覷。然而，他同樣擁有著超乎常人的實力和戰鬥技巧。在戰鬥中，他與三代目火影展開了一場驚心動魄的對決，雙方你來我往，互不相讓。儘管最終他戰勝了三代目，但也付出了慘重的代價——他的雙手被三代用屍鬼封盡所封印。
VS 綱手、自來也：由於雙手被屍鬼封盡所封印，他無法使用忍術，這使得他在與綱手和自來也的戰鬥中處於絕對的劣勢，最終慘遭失敗。
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