話分兩頭，博物館組織最近倒是處於內外交困之中。
近期，受圓咲一家內戰的影響，蓋亞記憶體大規模流入風都民間，使得許多飽受災難的市民或主動、或被動使用蓋亞記憶體，繼而被蓋亞記憶體的精神毒素影響，這讓風都本就混亂不堪的局勢愈加混亂起來。
在這種情況下，圓咲姐妹之間的內戰依然沒有停歇，反而在圓咲琉兵衛的刻意縱容下，已經毫不掩飾，徹底擺在了明面上，這讓博物館組織的許多幹部趁勢脫離而出，開啟自己的野心爭霸之路。
眼見局勢在自己的縱容下變得如此混亂，圓咲琉兵衛非但沒有進行約束，反而更加認為只有完成最終的計劃，才能改變世界，實現理想鄉的最終降臨。
為此，圓咲琉兵衛一邊持續激發著圓咲若菜的鬥爭意志，一邊促使圓咲若菜變身的粘土人偶摻雜體不斷經歷死亡與重生，加快圓咲若菜對極限力量的融合與掌控，實現最終最後的進化。
徘徊在死亡與重生之間的圓咲若菜，思想與性格愈加病態起來，對極限力量的適應進度也在穩定提升。
在這期間，圓咲若菜成功連線上了地球圖書館，並不斷獲得地球圖書館的控制權限。
但是，讓圓咲若菜想不到的是，她幾次進入地球圖書館都始終沒見到菲利普。
甚至，有好幾次圓咲若菜明明察覺到了菲利普登入進地球圖書館，立馬進入地球圖書館，也還是找不到菲利普的身影。
面對這樣奇怪的情況，圓咲若菜詢問過圓咲琉兵衛，但後者也不清楚是怎麼回事，只是提了幾點猜想與建議。
按照圓咲琉兵衛的猜想進行了一番驗證後，圓咲若菜依然沒有找到問題所在，這進一步刺激了圓咲若菜的精神狀態，使得圓咲若菜愈發病態起來。
愈發病態的圓咲若菜有試過去找菲利普“敘舊”，或者去找W的麻煩，但都被百鬼或圓咲冴子打斷，難以見到菲利普或者是W。
而不知情況的菲利普，則是一邊老老實實的向謝拉德學習記憶體技術，一邊在謝拉德的幫助下研究骨女記憶體和火焚屍記憶體，偶爾抽空回應左翔太郎的變身請求。
混亂的城市，使得時間過漫長又短暫。
在不間斷的死亡與重生中，圓咲若菜成功完成最終的進化，變身成了可以操控大地力量、掌握地球圖書館的地球巫女。
在圓咲若菜完成最終進化之時，所有記憶體、使用記憶體力量的存在都察覺到了圓咲若菜的存在。
其中，以百鬼中的大妖鬼反應最為激烈。
圓咲若菜洩露出來的力量氣息，讓它們看到另一種希望。
雖然，大妖鬼們也不知道該如何利用這股力量，但先奪取到手，自然有足夠的時間可以去研究。
於是，在大妖鬼們的意志下，百鬼暫停了對W的狩獵，轉而去狩獵起圓咲若菜。
百鬼的反應，既在圓咲琉兵衛的預料之中，也在圓咲琉兵衛的預料之外。
圓咲琉兵衛預想過百鬼的反應，但他沒想到百鬼的實力遠在他的設想之外。
或者說，圓咲琉兵衛沒想到百鬼也在不斷進化，甚至進化速度遠超他對蓋亞記憶體的瞭解。
面對百鬼不加掩飾的進攻，還在圓咲琉兵衛掌控下的博物館成員被打的節節敗退。
萬幸的是，百鬼的異常也被左翔太郎他們看在眼裡，順帶知曉了發生在圓咲若菜身上的事情。
對於圓咲琉兵衛的所作所為，菲利普難以接受，也十分心疼圓咲若菜所遭受的精神折磨。
不過，現實的情況並不容許菲利普他們對圓咲琉兵衛等人做出制裁，當務之急是先阻止百鬼帶走圓咲若菜，以防不測。
