埃琳娜透過即時成像資料與模擬結果的對比，發現了這個關鍵的協同效應。
第三個發現則是超越SFR-1的“影子網路”。
利用升級後的動態網路模型，在“神威”上對更大範圍的相互作用組資料進行挖掘時，趙棟團隊發現，與SFR-1存在強關聯的，並不僅僅是已知的幾個候選蛋白。
模型預測出一個由數個之前被忽略的、丰度較低或相互作用較弱的蛋白組成的“影子網路”。這個網路似乎與SFR-1存在功能上的互補或備份關係。
這很可能就是陸時羨之前提到的，更復雜的‘排程網路’的雛形，很顯然，SFR-1可能只是這個網路中最突出、最容易捕捉的一個節點，而不是全部。
這些發現，每一個都足以形成一篇高水平的論文。
但它們此刻都被嚴格保密，作為後續決定性衝刺的彈藥。
科爾德斯普林發表的PNAS論文，在陸時羨團隊基於“神威”獲得的這些新認知面前，顯得如此單薄和表面他們僅僅抓住了SFR-1最顯而易見的那部分功能，卻完全錯過了其背後更為精妙的調控邏輯。
在“神威”上執行的這兩個多月，對陸時羨團隊而言，不僅僅是一次算力的提升，更是一次全方位的淬鍊。
他們不僅獲得了顛覆性的新資料和新假說，更重要的是，他們提前熟悉了E級超算的程式設計模式和思維方式，為未來“方舟”的投入使用積累了寶貴的經驗、優化了核心演算法、甚至培養了一支能打硬仗的計算生物學團隊。
陸時羨站在計算中心的大螢幕前，看著代表計算任務進度的光流如銀河般奔湧。
他知道，科爾德斯普林此刻或許仍在為他們搶先發表的成果而沾沾自喜，國際學界或許仍在看衰繁縷的未來。
但他們不會知道，在東方這片土地上，一臺國之重器正為一項絕密的研究開足馬力。
他們更不會知道，他們以為的終點，在陸時羨的眼中，早已只是一個微不足道的起點。
時間來到2025年的10月。
金秋的江南，天高雲淡。位於長三角生態綠色一體化示範區的“方舟”生物超算中心，如同一片巨大的、泛著金屬冷光的繁縷草葉，靜靜地臥在湖畔。
在經歷了近二十四個月、幾乎是二十四小時不間斷的加班加點後，這臺承載了無數期望與壓力的國家重器，終於宣告一期工程正式竣工並完成初步除錯，可以投入試執行。
這一天，繁縷研究院核心團隊幾乎全員到齊。陸時羨、羅伯特·萊夫科維茨、埃琳娜·沃森、趙棟樑，以及所有參與了前期“神威”攻關和“樞紐蛋白”專案的研究員們，齊聚在“方舟”的主控室內。
空氣中瀰漫著一種混合了緊張、興奮與莊嚴的情緒。
主控室前方，是巨大的弧形視覺化螢幕，下方是簡潔的控制檯。
與“神威”那種充滿工業力量感的風格不同，“方舟”的主控室更顯精密與未來感，燈光柔和，環境噪音被控制在極低的水平。
華國發改委、科技部，以及“方舟”建設方的總工程師也蒞臨現場。
簡單的啟用儀式後，象徵性的水晶鑰匙被交到了陸時羨手中。
沒有過多的喧譁，所有人的目光都聚焦在那塊即將點亮的主螢幕上。
“陸院士，‘方舟’一期，總計1.7 Exaflops的峰值算力，生物專用架構，現已就緒。請下達第一個正式計算任務！”超算中心主任鄭重宣佈。
陸時羨深吸一口氣，與羅伯特和埃琳娜交換了一個眼神，點了點頭。
他走到控制檯前，接入自己的加密許可權，從隨身攜帶的固態硬碟中，調出了那份凝聚了他們在“神威”上數月心血的、關於“樞紐蛋白”最核心也最大膽的猜想與資料包。
“啟動‘方舟’任務序列T-001。專案代號：‘天網’。
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