伏井出K的暫時失蹤，讓城市獲得了短暫的喘息之機。琉璃的生活似乎也進入了一種奇特的“日常”狀態。白天，她會化身嚴苛的教官，在星雲莊或郊外對小陸和艾莉進行地獄式的特訓，將自己在阿布索留特歷經生死磨練出的戰鬥技巧和經驗傾囊相授；晚上，則要麼沉浸在PS4的遊戲世界裡，要麼就窩在公寓的沙發上，用光能凝聚的虛擬鍵盤，繼續她的“創作大業”。
她的新小說，依舊套用著《科茲莫英雄傳》的世界觀，但內容卻愈發黑暗、深刻，彷彿注入了真實的靈魂。她將自己在不同平行宇宙執行“破襲計劃”、收集基因碼的經歷，藝術加工後寫了進去。
故事背景設定在一艘名為“希望方舟”的巨大空間站，人類在其中繁衍生息，懷揣著探索宇宙的夢想。然而，災難降臨，一種名為“赫茲魯”（原型斯菲亞）的奇異宇宙生命體包圍並侵蝕了空間站，將其與外界徹底隔絕。倖存的人類在封閉絕望的環境中掙扎求存了一年。
主角“夜璃”奉命於“暗影迪格斯”，在這艘被封鎖的、充滿絕望與微光的空間站中穿梭，執行各種危險任務（影射收集基因碼）。她見證了人性的光輝與黑暗，經歷了無數生死考驗。其中，濃墨重彩的一筆，是她前往空間站深處一個被稱為“阿爾法區”的水晶叢林地帶（靈感源自琉璃實際去過的某個星球）。
在那裡，她再次遭遇了畢生的夢魘與執念——“光輝聖女昭華”（湊朝陽）以及她的兩位兄長“羅諾”（湊活海/羅索）和“布諾”（湊勇海/布魯）。琉璃將自己作為複製品對朝陽那份複雜扭曲的情感——自卑、憤恨、不甘、以及一絲連自己都無法承認的扭曲嚮往和嫉妒——描繪得淋漓盡致，入木三分。
最終，雙方在絢爛而危險的水晶叢林中爆發激戰。琉璃將這場戰鬥寫得極其精彩，招式碰撞、能量迸射、心理博弈、環境利用，彷彿親身經歷。最終夜璃雖棋高一著擊敗了格羅布，卻因複雜心緒未能下殺手，黯然離去。
這部名為《方舟絕境：水晶之殤》的小說，依舊以“艾莉&格麗雅”的筆名（名義上掛靠艾莉）釋出，再次引發了巨大轟動。其對人性的深刻挖掘、對絕望環境的真實描繪、以及堪稱頂級的戰鬥場面描寫，甚至讓不少評論家認為其文學性和思想深度已經超越了伏井出K的原作。
然而，平靜的日常終究是暫時的。琉璃透過某些渠道（主要是關注AIB的動向和萊姆的資訊篩選）得知，AIB內部似乎發生了一些事情，涉及一個名為“超時空破壞神賽剛”的兵器與捷德戰鬥時意外打開了異次元裂縫（捷德14、15集劇情）。
某天，小陸急匆匆地找到正在公寓裡打遊戲的琉璃，臉上寫滿了擔憂：“琉璃小姐！不好了！來葉她……她被帶到AIB的研究所去檢查了！”
琉璃放下手柄，眉頭微蹙：“檢查？為什麼？”
“來葉她最近身體好像出了點問題，症狀和之前被利特魯之星附身時很像，而且……她還說總是聽到一個陌生的聲音，說什麼……貝利亞即將歸來……”小陸的語氣十分不安。
貝利亞即將歸來？琉璃的心猛地一沉。該來的，終究還是要來了嗎？
她立刻起身：“艾莉，我們走一趟。”
“嗯！”艾莉也意識到事態嚴重，連忙點頭。
兩人迅速趕到AIB的秘密研究所。剛進入隔離觀察區，就感覺到氣氛不對勁。幾個AIB的工作人員倒在地上昏迷不醒，一個長相怪異、穿著AIB制服卻明顯不是地球人的外星人（戈德拉星人）正試圖強行開啟關押利特魯之星宿主（包括來葉）的隔離艙！
“住手！”小陸大喝一聲。
那戈德拉星人一驚，回頭看到小陸和琉璃艾莉，臉上露出猙獰的笑容：“哼，礙事的傢伙！既然被發現了，那就把你們一起解決掉！”
他猛地朝小陸撲來！速度極快！
但有人比他更快！
只見黑影一閃，琉璃不知何時已經出現在小陸身前，面對撲來的戈德拉星人，她甚至沒有太大的動作，只是簡單直接的一記側踢！
砰！ 一聲悶響！戈德拉星人以比來時更快的速度倒飛出去，狠狠撞在後面的金屬牆壁上，發出一聲痛苦的慘叫，掙扎著半天爬不起來。
“好、好厲害……”小陸和艾莉都看呆了。琉璃剛才那一下，無論是速度、力量還是時機的把握，都堪稱完美，完全不像人類能做到的。
那戈德拉星人又驚又怒，嘶吼道：“可惡的地球人！你們惹怒我了！”他猛地按動腰間的一個裝置，身體瞬間巨大化，頂破了研究所的天花板，出現在外面的城市中！
“沒辦法了！”小陸立刻掏出昇華器，“遇到事情，不能坐以待斃！”
“捷——德——！”
捷德奧特曼原始形態出現，與戈德拉星人展開激戰。獲得特訓成果的捷德，戰鬥技巧明顯提升，很快便佔據了上風，眼看就要將戈德拉星人擊敗。
然而，就在此時，異變陡生！
天空，毫無徵兆地暗了下來！一股令人窒息的、龐大無比的黑暗威壓瞬間籠罩了整個城市！彷彿末日降臨！
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