藥園中的新苗在月光下輕輕搖曳，葉片上的露珠映照著諸天星辰。林凡如往常一般提著水桶澆灌，卻發現井水觸到苗葉的瞬間，竟泛起九彩漣漪。更奇特的是，每道漣漪中都浮現出一個世界的倒影，彷彿這株新苗的根系已貫穿萬界。
守古老祖清晨巡查時駭然發現，自己的本命法寶永珍鏡竟映照不出新苗的形態。灰袍人推演天機，卦象顯示道生一，一生二，二生三，三生萬道，而這株新苗正在演化萬道歸元的至高境界。
蘇婉的虛影在晨霧中凝實，說這株道苗正在吸收諸天萬界的道韻，恐怕會引來萬道守護者。果然，午時三刻，天空突然降下九色花雨。花雨中走出一位身著素白道袍的女子，她手持玉淨瓶，瓶中的柳枝輕輕拂動，每一下都帶著淨化萬道的氣息。
女子自稱淨玄，奉道尊法旨特來收取這株逆天道苗。她柳枝輕點，一道淨化神光直射新苗。林凡正要阻攔，卻見新苗自主舒展葉片，將淨化神光盡數吸納。更神奇的是，葉片上浮現出比之前更玄奧的道紋，彷彿將淨化之力轉化成了養分。
淨玄道人色變，說她的淨世柳枝乃道尊親賜，可淨化世間一切道則。她話音未落，新苗突然開出一朵白花。花瓣綻放時，淨玄道人的玉淨瓶突然出現裂痕，瓶中的甘露倒流而出，反被新苗的根系吸收。
林凡輕撫花瓣，說道法自然何來逆天，這株苗不過是在追尋最本真的大道。淨玄道人怔住，她修行千年，從未見過如此玄妙的現象。但師命難違，她咬破指尖，以精血在虛空畫下一道符籙。符成之時，九天之上傳來威嚴的道音，說逆道者當受天譴。
一道紫色神雷劈下，這雷不是尋常天雷，而是專斬道基的滅道神雷。守古老祖急祭法寶，灰袍人佈下大陣，卻都被神雷餘波震飛。危急關頭，新苗的葉片突然合攏，將林凡護在中間。神雷劈在葉片上，竟如泥牛入海。更令人震驚的是，葉片上浮現出雷紋，將滅道神雷的道則完全吸收融合。
蘇婉驚喜道，說道苗護主，它已生出靈性懂得反哺之道。淨玄道人見狀，終於動容。她收起殘破的玉淨瓶，向林凡躬身一禮，說道友恕罪，是貧道著相了，這株道苗已超脫道尊推演，當有新的緣法。她化作一道白光消失，但臨走前留下警示，說道尊不會善罷甘休，接下來恐怕會派萬道巡天使前來。
果然，三日後夜幕降臨時，藥園上空出現九輪明月。月華如練，凝聚成九道身影。這些身影或持道劍，或託寶塔，或捧書卷，每一尊都代表著一種大道的極致。為首的白衣劍修冷喝，說奉道尊法旨擒拿逆道之苗，九人同時出手。
道劍斬因果，寶塔鎮時空，書卷定命運，九種大道法則交織成天羅地網，要將新苗徹底封印。這一次的威勢遠超淨玄道人，連周邊的時空都開始凝固。林凡正要出手，新苗卻自主飛起。它在空中輕輕搖曳，葉片上浮現出永珍更新的道韻。更神奇的是，九道巡天使的攻擊在接近新苗時，竟然相互抵消，化作最純淨的道源被新苗吸收。
灰袍人驚呼，說萬道相生相剋，這株苗竟然能引導大道相互制衡。九道巡天使面面相覷，他們修行萬年，從未見過如此詭異的現象。就在這時，新苗突然結出一顆道果。果實裂開，裡面走出一位與林凡相貌相似的道童。
道童向九人拱手，說諸位道友何必執著道爭，不如共參大道。他小手輕揮，九道巡天使驚覺自己苦修萬年的道基竟然更加精純。更讓他們震驚的是，以往修行中的諸多困惑，此刻都豁然開朗。九人同時頓悟，向道童躬身致謝後飄然離去。
危機解除，但道童的身影漸漸淡去，重新化作道果回到枝頭。林凡明白，這只是暴風雨前的寧靜。七日後的子夜，藥園中的藥材突然全部枯萎。不是死亡，而是將全部生機注入新苗。新苗以肉眼可見的速度成長，轉眼間化作參天大樹。樹冠遮天蔽日，枝葉間流轉著超越認知的大道真諦。而樹幹的紋理，漸漸組成三個古樸大字：問道樹。
與此同時，九天之上傳來一聲嘆息，說既然你已成就問道樹，便來萬道天一會吧。林凡抬頭望天，知道真正的道爭現在才開始。
就在問道樹成形的剎那，整片天地突然陷入奇特的寂靜。不是沒有聲音，而是萬道都在向這棵樹朝拜。守古老祖發現，自己修煉萬年的大道竟然在樹下自然圓滿。灰袍人更震驚地看到，天機推演在樹下變得清晰如鏡。
但福兮禍所伏。問道樹的氣息太過特殊，引來了不速之客。虛空裂開一道縫隙，走出一個揹著藥簍的採藥人。這人看似平凡，但每一步都踏在大道節點上。他伸手摘下一片問道樹的葉子，葉子在他掌心化作飛灰。
可惜可惜。採藥人搖頭，這麼好的苗子，偏偏長錯了地方。
他取出藥鋤，輕輕刨向樹根。這一刨看似簡單，卻蘊含著斬斷因果的可怕道韻。更可怕的是，問道樹竟然無法反抗，彷彿天生被這藥鋤剋制。
林凡正要出手，採藥人卻突然收手。他盯著林凡看了半晌，突然大笑：原來是你！那個被道尊逐出師門的傻小子！
林凡愣住，他完全不認識這人。但採藥人接下來的話讓他毛骨悚然：你忘了？三千年前，你我在萬道天同門學藝。你因質疑道尊的大道獨尊論被貶下界...
隨著採藥人的講述，一段被封印的記憶在林凡腦中甦醒。他確實曾是萬道天弟子，因主張萬道平等而被廢去修為打入凡間。這株問道樹，竟是他當年帶下界的一粒道種所化！
道尊早就推算出你會種出問道樹。採藥人冷笑，特地派我來收取成果。畢竟，這等神物不該留在叛逆手中。
他再次舉起藥鋤，這次帶著必殺之意。但就在鋤頭落下的瞬間，問道樹突然綻放九彩霞光。樹冠上結出三千道果，每個道果中都坐著一個林凡的虛影。這些虛影同時開口：
道本無主，何來叛逆？
聲浪過處，採藥人的藥鋤寸寸斷裂。他驚恐地發現，自己苦修萬年的採藥大道，正在被問道樹反向吞噬。
不可能！採藥人慘叫，我的大道專門剋制萬木，怎會被反噬？
林凡福至心靈，輕撫樹幹：因為你採的是藥，我種的是心。
問道樹突然縮小，化作一枚種子落入林凡掌心。這種子看似普通，卻蘊含著讓採藥人戰慄的氣息——那是超越萬道之上，真正的大道本源。
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