堵胤錫搖搖頭，輕嘆道:“知恥而後勇，現在回來，還是好的，至少還要點臉。這幾年來官軍皆望風而降，這些各地軍將沒有屈膝投降清虜就不錯啦。”
萬元吉問道:“堵巡撫，依你之見，放他們進城好還是不放？”
堵胤錫道:“你是江西總督大人，你來做主。”
楊廷麟在旁插言道:“還是放他們進來吧，進來也可以增加守城的力量，不管怎麼說，他們從各地千里馳援，沒有功勞也有苦勞，雖然有些見風使舵，但歸根結底沒有投降清虜。”
堵胤錫“嗯”了一聲，算作附和。萬元吉對身旁的副將叫道:“去通知守門將領，放他們進來吧。”
城下的各地援軍忽喇一聲，紛紛開始進城，又是一陣人嚷馬嘶。
楊廷麟說道:“我們也去看看去吧。”
三位督撫大人帶著一眾副將下得城來，在城門附近看視進城來的各軍將士。
率軍回來的有滇將趙印選、胡一青；兩廣總督丁魁楚派的童以振、陳課部；廣東將領龔棻、黎遂球部。湖廣總督何騰蛟派來的總兵曹志建領兵二千名，已經逃回湖南。
眾將看見堵胤錫、萬吉元、楊廷麟諸人，皆面有愧色，紛紛對他們抱拳請罪道:“末將無能，守城不力，大敵當前，卻私自撤退，羞愧無地，末將願戴罪立功，殺賊於贛州城下。”
楊廷麟拱手道:“諸將辛苦，待稍作歇息，再從長計議。”
各將領著各軍進城安頓去了。
堵胤錫對楊廷麟、萬元吉二人道:“我們都是文官帶兵，於行伍之事並不精通，此時應當派出探子四出打探清虜動靜，決不能坐守孤城。此外還應奪回周圍的南康縣、上猶縣。派兵將駐守，以作犄角之勢。方保萬全之策。”
二人點頭稱善，說:“堵大人思慮得很是，只是派何人前去恢復兩城為好呢？”
堵胤錫看了看二人，說道:“城中將領、士兵雖多，然戰力、火器皆不強，守城尚且勉為其難，出城作戰難保一觸即潰。還是我帶上本部人馬去吧。”
二人都讚揚堵胤錫忠勇無私，高風亮節。
金聲桓和清軍總兵柯永盛等正龜縮於上猶縣城，等待南京方面洪承疇處發來的援軍。時南京派出的滿清將領巴布泰和屯泰率領的一支八旗軍正兼程趕來，在路上逡巡了十餘日，於十日後到達上猶縣城，與金聲桓部匯合。
南康縣城已被堵胤錫奪回，上猶縣城卻久攻不下，反而被金聲桓趁夜派軍出城襲營，堵部明軍折損一千餘人，只得退回南康縣城。
巴布泰和屯泰一經到達後就展開反擊，先奪回南康縣城，繼而掃平贛州周圍鄉鎮。南康縣城是贛州背後的退路，南康城一丟，贛州就成了徹底的孤城了。
堵胤錫率軍退回贛州城，人馬帶傷，士氣低落。城內一時軍心又動搖起來。原先因見堵胤錫來援而返回來的各地援軍皆後悔不迭。此時後路已斷，連逃跑都沒處逃了。
過兩日，清軍開始攻城。八旗軍巴布泰、屯泰攻東門，漢軍金聲桓、柯永盛攻西門。城內明軍在楊廷麟、萬元吉、堵胤錫的率領下堅決抵抗。戰況激烈，雙方兵馬不下於三四萬。然清軍有了八旗軍的來援，實力大增，贛州又成為了一座孤城，城內各地派來的守軍互相不熟悉，各不接受指揮，互不統屬。
堵胤錫感到非常焦急，召集眾將商議軍情。由堵胤錫建議成立贛州守備，由楊廷麟任總督，總領全域性，萬吉元和堵胤錫各任巡撫，掌管各路人馬。各省來援的將領趙印選、胡一青，童以振、陳課，龔棻、黎遂球各授總兵，底下的將領各授參將、游擊不等。
明軍開始有了上下之分，各級將領皆要聽命行事，違令者斬。楊廷麟、諸胤錫等又不避矢石，親到一線指揮，與將士同甘共苦，頗得軍心。
城內的守備一度穩固，清軍又圍攻了數日，急切間也攻不下。金聲桓向巴布泰、屯泰等提議採取圍而不攻，待城內彈盡糧絕之時再一鼓而下，這樣可以不費一兵一卒，贛州唾手可得。
巴布泰、屯泰十分輕視漢軍，對金聲桓、柯永盛等漢將也十分不滿，認為贛州久攻不下，是漢軍兵將作戰不力，推諉拖延的結果。不但向南京參奏金聲桓和柯永盛，還當面斥責二人。金聲桓唯唯諾諾，但是也心生不滿，每日敷衍了事。
清軍只管圍困贛州，一時也無可奈何。
就在雙方僵持之時，城中到處盛傳一個驚人的訊息，有內應欲開城門迎清軍。楊廷麟、堵胤錫、萬元吉大驚，急忙派人徹查。原來是城內一些貪生怕死之徒，見清軍勢大，便想暗中投靠以求自保。他們迅速將這些內應一網打盡，可此事卻讓明軍人心惶惶。巴布泰、屯泰得知此事後，決定加大攻城力度，同時派人在城外散佈內應之事，擾亂明軍軍心。金聲桓雖依舊敷衍，但也不得不配合行動。贛州城再次陷入危機，明軍傷亡漸多，糧草也日益減少。楊廷麟等人一面安撫軍心，一面組織敢死隊準備夜襲清軍大營，試圖打破困局。
城內三位督撫大人，楊廷麟、萬元吉、堵胤錫一致商議決定，由滇軍將領趙印選、胡一青率領兩千滇軍，趁著夜黑沒有月亮的晚上，從城上縋下城來偷襲清軍大營。然而明軍的幾次出城襲營都沒有奏效，清軍以騎兵衝殺的方式剿殺出城襲營的明軍。滇軍反而損失慘重。
