今天一大早，小智就迎接了一位路邊訓練家的挑戰，但是在妙蛙種子擊敗對方的鐵甲犀牛後，妙蛙種子背上的種子卻散發出陣陣藍光
感到不妙的小智立刻帶著妙蛙種子來到了寶可夢中心，將其交給喬伊小姐，而小霞懷中的波克比卻是敏銳的感知到了一旁擺放在治療臺上的花朵正不斷的盛開
納茲也察覺到了這一情況，但並沒有任何表情，只是盯著看著妙蛙種子而感到緊張的小智，來到對方身後輕聲開口
“小智不要太緊張了，妙蛙種子應該是快要進化了”
“進化……，原來是這樣嗎？原來妙蛙種子並不是生病啊，那就太好了”
聽到娜姿的話，小智也是鬆了一口氣，激動的看著正在醫療室裡的妙蛙種子，喬伊小姐也證實了這一說法
而喬伊小姐也帶著四人來到了窗邊，看著外面盛開的花田，解釋起了這裡的原因
“你們看外面的情況，據說妙蛙種子在快臨近進化的時候就會聚集到某處，在一起舉辦慶祝進化的祭典，那個祭典似乎是跟月亮的圓缺和星星的移動軌跡有關”
“而且他不見得是在某一年的不同樣的季節舉辦的，所以才會出現這種狀況”
“原來是這樣啊，看來我們是進入一個非常奇妙的景觀呢，”小剛看著外面盛開的花田，以及那些花朵中散發出來的點點熒光，不由得感嘆了一聲
“那個妙蛙種子們聚集進化的地方，被稱作為不可思議的花園，可是從現在為止，截止至今日都沒有人見過那個地方，被一致認為是一處幻影的花園”
“不可思議的花園啊，我也好想看一看，皮卡丘，你也很想看一看對不對？”
“皮卡～”
小智也非常憧憬那處不可思議的妙蛙種子的花園，但在醫療室內的妙蛙種子則是想到了曾經火恐龍進化後的樣子，心中還是有一些擔憂，所以依舊非常抗拒著自己的進化
“種子～”
而到了深夜，小智一行人以及寶可夢中心的所有人都進入夢鄉以後，妙蛙種子獨自一人離開了寶可夢中心，早有預料的皮卡丘緊跟在妙蛙種子的身後，在月亮的對映下，兩隻寶可夢來到了花田中
“皮卡～”（妙蛙種子，你還是在擔心自己進化後會像火恐龍那樣嗎？不過你可以放心了，現在的我們可都是不一樣的自己哦）
“種子種子～”（但是我還是不明白，有些擔心，畢竟小智是我們的訓練家，而且現在的他還不是未來的他，我總是害怕自己進化後性格發生變化，會不聽他的命令）
“皮卡丘皮～”（放心了，畢竟我們可都是小智的夥伴呢，而且我想小智也不會怪你的，他可能只會反思自己的過錯吧）
但是就在這個時候，叢林中伸出了樹枝，妙蛙種子釋放出來的藤編將小智的妙蛙種子緊緊的束縛著，並且有大量的妙蛙種子從中出現，抬著妙蛙種子向著不可思議花園的方向前進
皮卡丘見狀，也急忙的跑回了寶可夢中心，將小智一行人叫醒後，緊追著妙蛙種子們的身影
另外一邊的火箭隊在看到了小智的妙蛙種子，被七隻妙蛙種子抬起來後，剛動起心子就被妙蛙種子們的藤編打飛到天空，變成了流星
小智他們在經過了一番不懈的努力後，最終來到了妙蛙種子的不可思議花園，見到了下方大量的妙蛙種子，以及從一棵巨樹中出現的霸主級妙蛙花
而在霸主妙蛙花的一聲咆哮下，眾多的妙蛙種子開始回應，身體上不斷散發出進化的光芒，進化成了一隻只的妙蛙草
但小智的妙蛙種子卻依舊壓抑著自己體內那股進化的力量，引來了霸主妙蛙花的注視
“叭納～”（你為什麼不願意進化？）
“種子種子～”（我想證明，就算以妙蛙種子的身份，也可以替我的訓練家贏回許多的勝利，就算不進化，我也可以幫助到我的訓練家）
“叭納～”（不要異想天開了，光憑你妙蛙種子的身體是無法承受更強大的力量，只有進化你才能真正的變成一名強者）
）家練訓的我助幫以可也我，化進不遠永算就，子種蛙妙是算就，的明證會定一我，事種這可認不才我（”～子種子種“
