實驗室裡已經連一張桌子都放不下了……
當然也是因為樣本太多。這一大桌子。
文英在整理,時娟記錄,秦秋雁再記錄一遍,還有個羅宏志拿著攝像機全程拍攝,頭頂還有監控。
四重備份,可見其重要性。
他們的工作有條不紊,進度緩慢,這是個精細工作。
每一個樣本都要記錄編號、名稱、獲取地點、環境、時間、特性。
主要是特性,每一個都有長長一串,充斥著專用術語,什麼DNA-seq、RNA-seq、區域中心內、非同源末端連線、雙端、鹼基對之類之類聽不懂的話。
而且整體氣氛不太好啊。
所有人表情都挺嚴肅的,心裡都裝著事。
好在駱一航來的時候,這項工作已經接近尾聲。
等他們的記錄完成後。
才發現駱一航來了。
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時娟隨口介紹了一下:“老闆,這是我們從XJ帶回來的樣本,一共一百四十四種,現在需要對它們進行基因測序。”
這是育種4.0的前置工作。
育種4.0就是應用基因型大資料、表型大資料、環境大資料建立模型,並進行大量計算機模擬,以尋求在全基因組水平上對已知的不同位點等位基因的最佳組合。
它需要兩個大前提,一個是超級計算機的海量算力,第二個就是基因組資料庫。
馬蘭草的算力是有的,基因資料庫是沒有的。
這玩意耗資大,時間久,國內主要做了農作物的基因組測序,還有少量經濟作物。
馬蘭草這種價值低的近似於野草的植物,是沒有做測序的。
所以就得自己來。
文英他們現在就是在準備樣本,然後構建DNA文庫。
接著才是測序。
測序完了還要進行資料預處理、序列比對、變異檢測、功能分析,並將結果視覺化。
複雜著呢。
而接下來DNA文庫構建是最關鍵的一步。
在這個步驟中,會將提取的基因組DNA隨機打斷成小片段,並進行末端修復等等。
育種4.0所需要的全基因組甲基化測序,還需要進行Bisulfite處理。
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