當帝國的軍事血脈在悄然強筋健骨之時，另一項關乎國本命脈——農業的宏大工程，也在工部的主持下，於紹興三十六年的秋收後全面鋪開。
這便是“全國主要水利設施大普查與系統性修繕”工程。
如果說整頓幣制是梳理經濟的血管，普及法律是構建社會的骨架，那麼興修水利，便是滋養帝國軀體最根本的“精氣血”。
“國以民為本，民以食為天，食以水為命。”
趙構在垂拱殿召見工部尚書沈該、都水監使者趙不棄及相關諸路轉運使、勸農使時，開門見山地指出：“自南渡以來，戰事頻仍，百廢待興，於水利一道，雖有所措置，然多為應急、區域性之功。
今北疆漸固，內政稍安，然天時不常，水旱頻仍。
欲使倉廩實，邊儲足，非大修水利不可。
而修水利，首在明其現狀，知其損益。
故朕意，對天下主要陂、塘、湖、瀆、渠、堰，尤其是那些傳承千百年、澤被萬頃的古名工程，來一次徹徹底底的‘摸家底’與‘治痼疾’！”
旨意一下，工部牽頭，都水監具體負責，抽調精通水文、地理、工程的官員、吏員、匠師，並徵調各州縣熟悉本地水利的“老河工”、“老農”，組成數十支精幹的普查勘驗隊伍，分赴各路。
朝廷撥付專款，要求各地全力配合，不得隱瞞、敷衍。
普查內容極為詳盡：工程的地理位置、始建年代、歷代修葺情況、當前完好程度、灌溉（或防洪、航運）範圍、受益田畝、管理現狀、存在的主要病害（如淤塞、潰決、閘門損壞、渠堤崩塌等）、以及初步的修復方案與預算。
工程浩大，意義深遠。
許多自唐末、五代以來便失於修葺、或僅維持不廢的千年古渠、百年老堰，第一次迎來了朝廷派來的專業團隊，進行全面、科學的“體檢”。
在蜀中，都江堰，這個“澤潤天府，功垂萬世”的曠世水利工程，自然是普查的重中之重。
普查隊在成都府路官員和堰工（世代守護都江堰的工匠家族）的陪同下，溯岷江而上，細緻勘查魚嘴、飛沙堰、寶瓶口這三大主體工程。
他們測量水勢流量，檢查竹籠卵石壘砌的堤岸有無鬆動，評估“深淘灘，低作堰”的歲修準則執行情況，記錄下遊灌溉水網的分佈與現狀。
發現部分支渠因年久失修或豪強侵佔而淤塞、改道，導致灌溉不均；一些古老的“水則”（水位標尺）損毀；管理上存在“堰官”權責不清、經費被挪用等問題。
普查隊詳細記錄，並會同地方制定了包括疏浚關鍵支渠、重修水則、釐清權責、保障歲修經費在內的綜合整治方案。
在關中，普查隊面對的是一片“十渠九廢”的悲涼景象。
戰國時鄭國主持開鑿的鄭國渠，漢代的白渠、成國渠、龍首渠等，這些曾“溉澤鹵之地四方餘頃，收皆畝一鍾”，造就了“天府之國”的偉大工程，歷經漢末、三國、南北朝、隋唐五代的戰亂與管理廢弛，到北宋時已大多淤塞、荒廢。
南宋雖名義上控制關中部分，但實際控制力有限，修復更是無從談起。然而，此次普查並未放棄。
普查隊跋涉於殘破的渠堤之上，辨認著湮沒在荒草與黃土中的古渠遺蹟，訪問當地遺老，查閱殘存的地方誌，力圖復原這些古渠的原始脈絡與灌溉範圍。
雖然大規模修復尚需時日，但這份詳盡的“病歷”與“復原圖”，為未來若有朝一日光復關中後的水利復興，奠定了珍貴的基礎。
在淮南，古芍陂（安豐塘）的普查與修復則相對更易推行。
芍陂乃春秋時楚相孫叔敖所築，歷經兩漢、南北朝、隋唐不斷修浚，是淮南重要的灌溉與防洪樞紐。
南宋控制此地後，有所維護，但欠賬不少。
普查隊發現，陂周堤防有多處單薄、滲漏，進水、放水閘門朽壞，庫區淤積嚴重，蓄水能力下降。
。碑立石刻，程章水用定明，系渠級五、農、鬥、支、幹浚疏、量丈新重，淤清夫民織組，門閘換更，防堤固加：復修手著即立方地與部工。發頻紛糾權水，紊渠區灌
