南澳島的土地原來都屬於鄭芝龍。李軒打敗鄭芝龍後，這些土地理所當然屬於李軒了。
李軒對島上幾個村莊派出武裝工作隊。
首先將鄭芝龍派駐島上的民事管事當做村民的出氣筒，讓村民去鬥這些管事，然後將島上現有土地平均分給村民。
隨後每一個村民再發一百斤糧食，作為李軒給各位村民的禮物。
接著在村民中組建民兵。民兵的規模有二百多人。民兵的各級領導由李軒的駐守南澳島的正兵擔任。
對於原一千多駐島軍戶，李軒把他們全部變成駐島職業民兵。
每人每月給五十斤糧食和一兩的軍餉。而對於駐廈門和南澳島的正兵，李軒將這次的征戰獎勵提前發給了他們，每人一百五十兩白銀和一百斤糧食。
糧食等到士兵換防時，讓士兵直接去遷安領取。
安平鎮、 廈門島，南澳島的事情處理後，李軒決定全體部隊啟航返回山海衛港口。
回去路上，李軒將這兩次鄭芝龍的操江手的家屬全部帶走，同時讓被俘虜的鄭芝龍計程車兵一部分，轉移到剩餘的空的貨船上。
結果近一千艘貨船用了五百多艘。還剩五百多艘。
李軒在廣東、福建沿岸又大肆購買大米和稻穀，價格高於市場價二成。
這樣採購了十萬石糧食，這十萬石糧食就把剩下的，噸位相對偏小的五百艘貨船裝滿了。隨後近六千艘大船，浩浩蕩蕩返回山海衛。
同時李軒通知家裡再徵兵二萬，全部編入海軍或者海軍陸戰隊。
經過十幾天的航行，終於在十一月中旬，全體船隊返回山海衛港口。
兩萬名操江手的家屬，一部分安排在山海衛港口，一部分安排在昌黎海岸的鹽場，還有一部分安排在遷安北羊毛紡織廠，不管安排在什麼地方都給每位家屬安家費一百斤糧食和十兩白銀。所有操江手的待遇等同於正兵待遇。
至於被俘虜的鄭芝龍的一萬多士兵，有的是跟隨鄭芝龍的積年老兵，對鄭芝龍還是比較忠誠的。
李軒將所有頭目專門隔離關押，剩下的近一萬名普通士兵，分別安置在各個煤礦進行勞動改造，改造好的，兩年後，安置在朔方或者遷安下屬村莊分配給土地。
在礦上除了沒有自由和報酬之外，是讓吃飽的。
在發配去礦上之前，所有士兵必須在這些小頭目身上出氣，最好給打死。
結果這些一千多人的小頭目都讓讓他們曾經的部下給出氣打死了。
這些普通士兵自從親手乾死了昔日的上官，就再也回不去了。
只能死心塌地的跟著李軒了。至於鄭芝龍和鄭芝虎他們的家屬除了大老婆，其他的女眷都給南澳島的軍戶當老婆了。
鄭芝龍和他大老婆及鄭芝虎和他大老婆在遷安各自的小院裡，在武裝部隊的監督之下，過著軟禁的生活。
這次回來之後，每位正兵獎勵一百五十兩白銀和一百斤糧食。操江手和正兵同樣的待遇。
二萬多正兵一下子就耗去三百萬兩銀子。
隨後李軒又從各地民兵中徵召了兩萬名士兵，安排在戰船上抓緊訓練，同時船廠也在抓緊時間，修理鄭芝龍的損壞的破船。
最新的四艘蒸汽機鐵甲艦也在緊鑼密鼓中進行改裝。
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