統一指揮：確立清晰的指揮鏈。皇帝為最高統帥，下設海軍都督府（暫由海事司兼理），總督天下海軍。艦隊設提督。總兵。參將。游擊。守備。把總等職，權責分明。
統一訓練：在舟山。廈門。廣州設立三大水師學堂，招募通曉海事。算術。幾何。天文之學子及有經驗之水手。漁民入學，系統學習航海。測量。炮術。帆纜。格鬥。新入伍水兵，必須經過至少半年學堂培訓和海上實習，方可登艦。
統一戰術：摒棄過去接舷跳幫為主的混亂戰法。強調艦隊陣型（單縱陣。雙縱陣。橫陣）。搶佔上風。舷側炮火齊射。明確各級戰艦在艦隊中的位置與職責，要求各艦必須嚴格執行旗艦旗語燈號。
依據《操典》與新的戰略佈局，大夏皇家海軍三大艦隊雛形，在玄極七年底至八年初，初步成型：
1。北海艦隊：駐防天津大沽口，以原登萊。天津水師為基礎，吸納遼東海商力量整編。
提督為老成持重的沈有容。轄有戰船四十餘艘，其中新式戰艦八艘。
主要負責渤海。黃海防務，拱衛京畿，警戒朝鮮。日本方向，並保護日漸繁忙的北洋漕糧海運與北方沿海貿易。
2。東海艦隊：駐防浙江舟山定海。
這是三大艦隊中毋庸置疑的絕對主力。
靖海將軍鄭芝龍兼任提督，其麾下收編的大批前「海商」武裝船隊，成為艦隊最富經驗的核心力量。
轄有戰船一百二十餘艘，其中「青龍」級及改進型新式戰艦達到二十四艘，包括旗艦「青龍號」。
輔以大量改進型福船。廣船。
此艦隊將直接面對來自東海洋麵的主要威脅，並承擔開拓遠海。護佑東南海貿的重任。
料羅灣即將到來的決戰，將由東海艦隊獨力承擔。
3。南海艦隊：駐防廣東廣州黃埔。
以原廣東水師及部分歸附的粵。瓊海商船隊為基礎組建。
提督為熟悉南洋事務的原廣東海道副使何汝賓。
轄有戰船六十餘艘，其中新式戰艦六艘。
主要負責南海防務，巡弋瓊州。廉州直至西沙海域，警戒葡萄牙。西班牙及南洋諸國，保護通往西洋的貿易航線。
三大艦隊，呈「品」字形扼守帝國海疆，相互呼應。
海軍都督府（海事司）統籌人員。艦船。物資調配，制定整體方略。
各艦隊提督在轄區內有專斷之權，但重大行動需報備，戰時由皇帝或都督府直接指揮。
當鄭芝龍在舟山基地，接過繡著「東海艦隊提督鄭」的嶄新帥旗，看著港口內舳艫相接。帆檣如林，尤其是那二十餘艘新式戰艦整齊列陣，在陽光下反射著青灰色冷硬光澤時，即使是他這樣見慣風浪的海上梟雄，胸中也湧起難以言喻的豪情與沉重。
豪情在於，他終於不再是那個朝廷眼中的「海盜招安」，而是堂堂正正的帝國海軍上將，手握當世東亞最強大的一支艦隊。
沉重在於，他知道這份權力與榮耀背後，是皇帝毫無保留的信任，是帝國傾盡資源的支援，更是一場即將到來的。決定國運的生死豪賭。
「料羅灣……」鄭芝龍撫摸著冰涼的帥旗旗杆，目光越過港灣，投向東南方那片未知的海域。
他知道，那裡集結的敵人，將比澎湖的荷蘭人強大十倍。
但他更知道，他身後這支剛剛誕生的帝國海軍，已無路可退。
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