“行，既然你這麼有把握，那我考考你。”陳志華也不客氣，“就說最經典的，蛋白質摺疊問題。列文塔爾悖論你應該聽說過吧？”
其實，陳志華心裡也是有考量的。
在他看來，徐辰畢竟是數學系出身，滿打滿算接觸生物學也沒多久。雖然之前幫忙打假顯示出了不俗的資料分析能力，但那畢竟是偏“術”的層面。對於生物學這種需要深厚理論積澱的“道”，他怕徐辰根基不穩，所以特意挑了個入門級的經典概念來摸摸底。
然而，徐辰聽完，並沒有像陳志華預想的那樣開始背誦定義，反而露出了一個有些無奈的笑容。
徐辰心裡忍不住暗自吐槽：陳老師這題出得，是不是太看不起LV.2的生物等級了？這個難度屬於生物物理學的幼兒園思考題啊。
但他面上還是保持著禮貌，隨手轉了轉手中的筆，語氣輕鬆地說道：“陳老師，咱們還是換個有難度的話題吧。列文塔爾悖論那是1969年的老黃曆了，屬於本科生期末考試的填空題難度。拿這個考我……是不是有點太簡單了？要不您換個難點的？”
陳志華愣了一下。
這小子，口氣不小啊！
但轉念一想，陳志華突然意識到自己可能真的犯了經驗主義錯誤。
看著徐辰那副坦然自若、甚至帶著一絲“您怎麼拿這種題考我”的嫌棄表情，陳志華心裡反而信了幾分。
也是，能搞定哥德巴赫弱猜想的人，怎麼可能只滿足於背誦教科書上的死知識？真正的學霸，是不屑於在基礎題上浪費時間的。
“好，既然你覺得簡單。”陳志華放下了茶杯，坐首了身體，徹底收起了剛才把徐辰當“門外漢”看的心思，眼中的考校之意更濃了：
“那你倒是說說，怎麼用數學解釋這個悖論？別跟我背書上的定義，我要聽你自己的理解，最好能用你的數學語言給我重新構構圖。”
“在我看來，這其實不僅僅是生物學問題，本質上是一個統計物理學的高維最佳化問題。”徐辰隨手拿起桌上的紙筆，語氣平和，“這就是沃林斯教授提出的‘摺疊漏斗’理論。蛋白質不是在平地上瞎逛，而是在一個漏斗狀的能量面上滑行。”
徐辰一邊說，一邊刷刷幾筆畫出了一個漏斗狀的三維曲面圖，線條流暢精準：“雖然構象空間很大，但這個‘漏斗’的斜率——也就是吉布斯自由能的梯度，會引導它迅速滑向能量最低的天然構象。這就像在高爾夫球場上，如果球洞在一個巨大的漏斗底部，無論球落在哪裡，最終都會滾進洞裡。”
他在旁邊寫下了一個基於統計力學的配分函式公式，甚至順手引入了自旋玻璃理論中的哈密頓量：
H(σ)=-Σ J??σ?σ?
“本質上，這就是一個尋找全域性最優解的過程。只要我們能構建出這個能量函式 H(σ)，摺疊路徑就是黎曼流形上的測地線問題。雖然計算量大，但在拓撲上是確定的。”徐辰放下筆，笑著補充了一句，“所以DeepMind的AlphaFold之所以能成功，我覺得本質上不是因為它懂生物，而是因為它懂幾何。”
陳志華看著那個圖，眼皮跳了一下。
這解釋……太標準了。
而且那個配分函式，寫得也太順暢了，不愧是數學系出來的，對數學公式的掌握簡首爐火純青。
“有點意思。”陳志華坐首了身體，收起了剛才的輕視，“那我們再聊聊基因調控。現在的研究熱點是轉錄爆發，你怎麼看？”
“那個啊，”徐辰撇了撇嘴，忍不住吐槽道，“現在的很多模型都太粗糙了，還在用希爾方程這種確定性的東西去描述。微觀層面的分子碰撞是隨機的，尤其是在低複製數的情況下，噪音才是主角。”
“所以？”
“所以得引入隨機微分方程。”徐辰手中的筆沒停，“把主方程做個近似，用Fokker-Planck方程來描述機率密度的演化。只有這樣，才能解釋為什麼同樣的基因型，在不同細胞裡會表達出完全不同的表型。這本質上就是生物系統中的‘布朗運動’。”
陳志華的瞳孔微微收縮。
他看著侃侃而談的徐辰，心裡掀起了驚濤駭浪。
如果說剛才的蛋白質摺疊還是課本上的知識，那現在的“轉錄爆發”和“隨機微分方程”，可是這幾年系統生物學最前沿的爭論焦點！
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