自從他離開北大來到法國後,和生科院那邊的聯絡就少了很多。他點開郵件,快速瀏覽了一遍。
郵件的內容很長,語氣中透著一股濃濃的“求救”意味。
大意是這樣的:徐辰走後,劉偉和幾個師弟師妹接手了那個關於“代謝網路重構”的課題。他們把徐辰之前在野生型大腸桿菌上跑通的那個模型,嘗試著遷移到了具有工業價值的工程菌上。
原本以為只是個簡單的“套公式”工作,結果在收集了大量的工程菌多組學資料後,他們發現,當把這些海量的資料強行塞進徐辰留下的那個“高維非線性微分方程組”時……
模型崩了。
或者說,他們找來的負責資料處理的人,算不出來了。
郵件的最後,劉偉附上了幾張充滿了奇異奇異攝動項和拓撲矩陣的報錯截圖,並用一種卑微的語氣寫道:
“徐神,救命!這方程太變態了,我們找的數學系外援己經快被逼瘋了。您受累給看一眼,指條明路吧!等您回國,胖子燒烤我請客,管夠!”
……
看著郵件裡那字裡行間透出的絕望,徐辰忍不住笑了。
“這老劉,看來這一年沒少加班啊。”
徐辰在腦海中,幾乎己經能想象出劉偉頂著更加後退的髮際線,在實驗室裡沒日沒夜跑資料的苦逼模樣了。
之前陳教授的預估,要把野生型的實驗室成果推到工程菌的工業化應用,怎麼也得兩三年。
首先要解決的就是試驗菌的資料採集問題。結果這才不到一年,劉偉他們居然己經把工程菌的資料全收集完了,甚至己經推進到了最後的資料擬合階段。
“看來這幫‘生物狗’捲起來,也是不要命啊。”
……
徐辰沒有多想,隨手點開了附件裡的報錯截圖。
對於普通的數學碩士來說,面對這種動輒成千上萬個變數、且充滿了高度非線性和奇異攝動項的生物動力學方程組,確實容易抓瞎。
但在徐辰這個曾經親手構建了這套體系的人來說,這就跟看小學生的加減乘除算錯了一樣明顯。
“原來是這裡……”
徐辰只掃了兩眼,就發現了問題的癥結。
“工程菌為了追求高產,內部的某些代謝通路被人工強化了。這導致原有的‘慢流形’假設在區域性區域失效了。他們找來的外援,還在死板地套用我之前的那個費尼切爾不變流形定理,沒有做區域性座標變換,這就導致了在積分的時候,高頻振盪項把主項給掩蓋了,結果自然是不收斂。”
徐辰甚至都沒用草稿紙,首接在郵件回覆框裡,敲下了一段極其乾脆利落的“指導意見”:
“劉師兄,問題不大。你們的方程在跨越‘乙醯輔酶A’那個節點時,遇到了剛性跳變。告訴你們的數學外援,不要用全域性的龍格-庫塔法去硬解。在那個區域性區域,引入一個‘龐加萊對映’,把連續的軌跡截斷成離散的差分方程,然後在區域性切空間裡做個線性化展開,再用奇異值分解(SVD)降維,那個奇點自然就繞過去了。祝好。”
敲完這段話,點擊發送。前後耗時不到五分鐘。
徐辰並沒有給出具體的數學推導和程式碼,而是僅僅提供了一個“方法論”級別的指導。
在他看來,既然生科院那邊請了數院的碩士來幫忙,那這幾個專業名詞對方肯定聽得懂。
只要指明瞭方向,剩下的髒活累活,人家自然能搞定。
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……








