一、帕米爾高原
帕米爾高原是喜馬拉雅山、崑崙山、喀喇崑崙山、興都庫什山、阿賴山脈等五大山脈的山結形成的高原，平均海拔4500以上，總面積約10萬平方公里。它東起西崑崙山，西至噴赤河、哈茲拉季季紹赫山脈（），南起瓦罕走廊，北至阿賴山脈，自北向南共有八帕，即和什庫珠克帕米爾、薩雷茲帕米爾、郎庫裡帕米爾、阿爾楚爾柏米爾、大帕米爾、小帕米爾、塔克敦巴什帕米爾（也稱東帕米爾）以及瓦罕帕米爾。
帕米爾高原有豐富的金、銀、銅、鉛、鋅、錫、鎢、銻、汞、鈾、煤炭、硼、稀土資源。
砂金礦：帕米爾高原的很多溝谷中有砂金礦，以西帕米爾達爾瓦茲（Darvoz）地區的砂金礦床為最大，黃金儲量25噸，其次是朗庫裡湖（Langkul Lake）周邊的砂金礦。郎庫裡湖位於卡拉庫裡湖（Karakul Lake）的東南部，海拔3780米左右，為淡水湖，距中國邊境僅20公里左右。郎庫裡湖西4公里左右是肖庫裡湖（Shorkul Lake），兩湖之間有郎庫裡河相通。郎庫裡湖砂金礦區就是指朗庫裡湖、肖庫裡湖周邊溝谷的砂金礦，一直延伸到中國境內的阿克陶縣布倫口鄉境內。
金屬礦：帕米爾高原除了有砂金礦外，也有巖金礦、銅金礦、鎢金礦、銀金礦等金屬礦。如在塔吉克霍羅格（Khorog）東北60公里的巴爾坦格（Bartang）地區有伊卡爾鎢金礦，礦石中還伴生銅、鈷；在薩雷茲湖（Sarez Lake）周圍有巴扎爾達拉（Bazardara）銀礦礦集區、卡爾塔圖爾（Kaltatur）銀礦礦集區，這二個銀礦礦集區有幾十個大大小小的銀礦，礦石中伴生金、鎢、錫、銅、鉍等。如薩雷茲湖東南45公里、葉什勒池（Yashilkul Lake）東北36公里處有阿克吉爾加（Akjilga）銀銅銻礦，2017年中國某公司接手時，保有礦石量116.35萬噸，銀保有儲量1286.06噸，銅保有儲量1.15萬噸，銻保有儲量1.17萬噸，鉍保有儲量4896.87噸，另伴生錫、鋅、鉬。阿克吉爾加銀銻礦附近是特雷祖貝特斯（Trezubets）錫鎢礦。今塔吉克在帕米爾地區勘察到了70多處銅礦點，主要集中在西帕米爾的達爾瓦茲山支脈，有納夫諾烏銅礦、達lai塔格銅礦等。帕米爾高原的鐵礦資源也比較豐富，今塔吉克在高原勘察到了約5億噸鐵礦，因開採難度很大，暫時開採的是達爾瓦茲地區的鐵礦。塔吉克還在帕米爾地區發現了12條稀有金屬礦脈，含有鉭、鈮、鈹、銫、鋰、錫、鈰、釔、釷、鋰等元素。
硼礦：在帕米爾高原穆爾加布附近有亞卡爾哈爾硼礦，礦區海拔4500-5000米，是塔吉克唯一的硼礦，也是中亞最大的硼礦。
煤礦：在西帕米爾達爾瓦茲（Darvoz）地區有拉夫那烏煤礦區，該煤礦區海拔2900-3500米，共有3個煤礦。
帕米爾高原還盛產各種寶石，如天青石、紅寶石、藍寶石、祖母綠、碧璽、剛玉、石榴石、蛇紋石、螢石、水晶等。
天青石主要產於巴達克山（今稱巴達赫尚）的噴赤河兩岸，共有9條天青石礦帶，儲量在5000萬噸以上，硫酸鍶品位大於85％，是世界上品質最好的天青石。美國佔領阿富汗期間，塔利班每年靠出售天青石，就賺取了5億美元。如在噴赤河阿富汗與塔吉克交界處的庫克恰（Kokcha）河谷有薩雷桑（Sar-e Sang）天青石礦區，該礦區位於阿富汗埃什卡希姆（Eshkashem）北40公里左右、塔吉克霍羅格南約60公里。該礦區的天青石，早在5000年前就開採了，古埃及法老就用它做聖甲蟲護身符。
其它寶石產於帕米爾高原各“帕”中，以產於西部加蘭（Garam）礦區、東部郎庫裡（Rangkul）礦區的為最佳。加蘭礦區位於霍羅格（Horog）南約35公里的錫尼曼山（Sygniman），早在唐代就開採了，出產的紅寶石稱為“巴拉斯紅寶石”。加蘭礦區有十多個礦，其中的庫埃拉爾（Kuhilal）寶石礦就位於噴赤河東岸庫埃拉爾村附近的懸崖上。郎庫裡礦區位於朗庫裡湖西20公里左右。郎庫裡寶石礦區於1980年由前蘇聯地質專家發現，該礦區現有庫爾特（Kukurt）、斯內日涅（Snezhny）、特伊卡（Teika）、尼日涅（Nizhny）、格洛里亞（Gloria）等十多個寶石礦，因開採寶石礦形成了穆爾加布（Murghab）鎮，出產的紅寶石稱為“巴達赫尚紅寶石”。帕米爾地區的螢石礦大多與貴金屬礦、稀有金屬礦伴生。
二、納倫盆地及伊塞克湖地區
納倫盆地是指由費爾干納山脈、塔拉斯山脈、南天山北部的餘脈泰爾斯凱山脈與南天山主脈的古瑪塔格山脈（今喀什北部的山脈）圍成的地區，面積約4.52萬平方公里，包括面積約1.3萬平方公里納倫的盆地，範圍大致為今吉爾吉斯斯坦的納倫州。
伊塞克湖地區是指由南天山北部的餘脈泰爾斯凱山脈（也稱泰爾斯凱阿拉套山）、昆格山（也稱孔根阿拉套山）、外伊犁山脈圍成的地區，面積約4.31萬平方公里，包括面積約6236平方公里的伊塞克湖，範圍大致為今吉爾吉斯斯坦的伊塞克州。
納倫地區及伊塞克湖地區也有豐富的礦產資源。
在納倫盆地有傑捷姆鐵成礦帶，以鐵礦為主，伴生釩。杰特姆（Zhetym，或Jetem，或Zhetymskoye，也稱傑提姆、傑吉姆、捷吉姆、捷吉姆斯科耶）鐵釩礦（也稱傑吉姆套鐵礦），位於卡拉賽（Karasay）西南50公里的杰特姆山（屬泰爾斯凱山）的北麓，也即納倫河的上游地區，1956年前蘇聯地質專家發現，礦區位於海拔2500-4300米的山區，平均海拔3600米，夏季有少量牧民在礦區內放牧，平時屬於無人區，故一直沒開採。吉爾吉斯斯坦獨立後，2004年中國某勘察公司對該鐵礦進行了全面勘察，礦區東西長40公里，南北寬3-5公里，面積152平方公里，礦體出露標高在2935-4226米區段，按礦體推深500米，已探明的礦石量21.58億噸，遠景儲量57億噸，鐵品位33％-45.59％，五氧化二釩品位0.02％，鎳品位0.01％。如考慮500米以下的礦體，遠景儲量可達54億噸。自西向東分為旦幹、圖尤蘇、埃蘭蘇、蒙託巴什、鐵列克南、鐵列克北、庫魯門等7個礦段，礦物主要是磁鐵礦、赤鐵礦，伴生少量鏡鐵礦、黃鐵礦、黃銅礦。該鐵礦是吉爾吉斯斯坦最大的鐵礦，也是中亞地區最大的鐵礦。杰特姆鐵釩礦附近還有鉛鋅礦、錳礦，如阿爾恰雷錳礦，礦石量在210萬噸左右。
在伊塞克湖南部有卡拉賽——阿克希拉剋成礦帶，以錫鎢礦為主。該礦帶從伊塞克湖南70公里的卡拉賽一直向東北沿著泰爾斯凱山延伸到哈薩克、中國邊境，長300多公里。在該礦帶上，已勘察到了數百個錫鎢礦，典型的是薩雷扎斯（Sarydzhaz）錫鎢礦田。在卡拉賽東北有個薩雷扎斯嶺（屬泰爾斯凱山脈），山嶺（Sarydzhaz Ridge）中有1310個冰川，總覆蓋面積達2000平方公里，冰川融水形成了薩雷扎斯河（Sarydzhaz，或Saryjaz，中國稱為庫瑪拉克河、庫馬拉河，其下游就是塔里木河的支流阿克蘇河）。薩雷扎斯河兩岸有很多錫鎢礦，這些錫鎢礦被稱為“薩雷扎斯錫鎢礦田”，因開採該錫鎢礦田，建設了埃尼爾徹克（Enilchek）鎮。礦田中最大的錫鎢礦是特魯多沃（Trudovoye，也稱特魯多奧依）錫鎢礦，在卡拉賽（Karasay）東偏北76公里，距中國邊境僅12公里，錫儲量20萬噸，錫品位0.64％，三氧化鎢儲量12.6萬噸，氧化物品位0.32％，是吉爾吉斯斯坦最大的鎢礦。礦田中其它的大型錫鎢礦還有卡達姆塞礦（Kadamsay）、烏奇科什康礦（Uchkoshkon，也稱烏奇科什孔錫礦，錫儲量6.06萬噸、品位0.53％）。薩雷扎斯礦田中的錫鎢礦，大多還含螢石、銅、銀、鉍，可綜合回收。薩雷扎斯礦區除了錫鎢礦外，還有鈾礦（薩雷扎斯鈾礦）、釩礦（薩雷扎斯礬礦）、金礦。薩雷扎斯礬礦已探明的礦石量2182萬噸，釩儲量7.46萬噸、品位0.34％，另含鈾（品位0.022％）、鉬（品位0.04％）等。薩雷扎斯礦區的金礦有薩雷扎斯（Sary-Dzhazskiy，也稱索爾通-薩雷（Solton Sary））金礦、布丘克金礦（位於薩雷扎斯金礦西，由中國、吉爾吉斯合資開採）
在伊塞克湖西部、北部、東部有塔爾迪布拉克-肯蘇-奧克托爾科依（Taldy Bulak-Kensu-Oktorkoy）銅金礦集區，1969年發現，礦集區沿外伊犁山（吉爾吉斯斯坦稱為中天山）的南麓（距哈薩克的阿拉木圖州邊境很近）向東延伸到伊塞克湖東岸（距中國邊境也不遠），再沿著泰爾斯凱山折回，有大大小小數百個砂金礦、巖金礦、銅礦、銅金礦。塔爾迪布拉克銅金礦位於吉爾吉斯山東端、外伊犁山西端的塔爾迪布拉克河右岸，北距楚河州凱明（Kemin）13公里，銅儲量75萬噸，銅品位0.25％；金儲量64噸，品位12-15ppm，今由中國紫金集團控股，地下開採。在塔爾迪布拉克銅金礦的河對岸是奧克托爾科依（Oktorkoy，也稱奧同克）銅金礦，吉爾吉斯斯坦獨立後，改稱阿爾特尼肯（Altynken）銅金礦（也稱塔爾迪布拉克左岸金礦），黃金儲量75噸，銅儲量50萬噸，露天開採。以阿爾特尼肯（Altynken）銅金礦（也稱左岸銅金礦）為中心，四周又有4個銅金礦，分別是北部的波魯拜金礦（Borubai，黃金儲量還在勘察中）、西部的安達什（Andash）銅金礦（黃金儲量27噸）、南部的朱安（Zuoan）金礦（黃金儲量66.86噸）、東部的阿克塔什（Aktash）銅金礦。塔爾迪布拉克-肯蘇-奧克托爾科依銅金礦集區的中部規模比較大的礦山有米洛諾夫斯科耶（Mironovskoe）銅金礦（位於凱明東北19公里）、阿克蒂茲（Aktyuz）銅金礦（位於凱明東北40公里），阿克蒂茲銅金礦附近有卡什卡（Kashka）稀土礦。塔爾迪布拉克-肯蘇-奧克托爾科依銅金礦集區的東部規模最大的礦山有庫姆托爾（Kumtor）金礦，該金礦位於庫姆托爾雪山（屬泰爾斯凱山脈）北麓，西南距卡拉賽約48公里，黃金儲量524噸，露天、地下開採，是吉爾吉斯斯坦最大的金礦。庫姆托爾雪山的南麓就是古代烏孫國的國都赤穀城，今稱伊什提克（Yshtyk），位於阿克梭伊拉克（Akshoyrak）河谷北岸。阿克梭伊拉克河谷有幾十個砂金礦，上游有好幾個巖金礦，如烏奇科什孔（Uch Koshkon）金礦、阿克什伊拉克（Akshyyrak）金礦等。在庫姆托爾金礦東北靠近薩雷扎斯錫鎢礦區有肯蘇（Kensu）金礦，因伴生大量的鎢、鉬，探明的三氧化鎢儲量達3萬噸、品位0.41％，故也稱肯蘇鎢鉬礦，是吉爾吉斯斯坦第二大鎢礦。在庫姆托爾金礦東北140公里、卡拉庫爾（Karakol）東南72公里有阿克蘇（Akesu）金礦（初步探明的黃金儲量10.3噸，有中國某公司控股開採）。
在外伊犁山北麓有鎢鉬成礦帶，有大大小小十幾個鎢鉬礦，這些鎢鉬礦大多屬於哈薩克。最大的鎢鉬礦是位於外伊犁山脈東端的烏利坎—博古特山（Bugyty Mountain）的鎢礦（博古特鎢礦，也稱巴庫塔鎢礦、Bogutinskoye鎢礦、Bugyly鎢礦）。該鎢礦位於阿拉木圖城東180公里、查爾伊河（Charyn River）西25公里，礦石量1.1億噸，三氧化鎢品位0.211％，為哈薩克最大的鎢礦、世界第四大鎢礦。
在納倫盆地的坤別爾蘇（Kumbelsu）河谷、京迪（Kyndy）河谷有很多小型砂金礦。在納倫盆地的西部、費爾干納山的北麓有鐵列克林（Tieliekelin）金礦，該礦東北距克孜勒庫爾幹（Kyzylkurgan）約57公里，初步探明的黃金儲量27.8噸，由中國某公司控股開採。在納倫盆地西部的切特布拉克（Chetbulak）東偏南16公里有瓊塔什（Chontash）銅鉬礦，伴生金、稀土，鉬儲量5600噸。
在納倫盆地西北部有桑迪克霞石礦（位於吉爾吉斯斯坦納倫州朱姆加爾區阿拉爾（Aral）村附近），霞石中的含鋁量達1.47億噸，可以代替鋁土礦來鍊鋁。
在納倫盆地中部的松庫爾湖（Songkul Lake）西南約24公里有個盆地，因卡拉克切河（Karakeche River）流經該盆地，故稱為卡拉克切盆地（也稱卡瓦克盆地），該盆地內有煤田（卡瓦克煤田），煤炭儲量約46億噸，煤質為褐煤。不過卡瓦克盆地的煤炭含有放射性的鈾，燃燒後會對環境造成較大危害，因此只能有選擇性地開採煤礦，如科克莫伊納克煤礦、明古什煤礦、卡拉克切煤礦等。在納倫盆地西南部切特布拉克（Chetbulak）東南27公里有科克基亞（Kok Kiya）煤礦，由中國某公司控股開採。在伊塞克湖東部的卡拉庫爾河（Karakul River）兩岸也有煤礦。
納倫盆地、伊塞克湖地區有豐富的鈾礦資源。如納倫盆地西部的克孜勒庫爾幹（Kyzylkurgan）東21公里有卡什卡蘇（Kashkasu）鈾礦，該鈾礦有2個礦區。卡瓦克盆地的科克莫伊納克煤礦中含有的鈾儲量為1473噸、氧化鈾品位0.01-0.18％。伊塞克湖西22公里有克孜勒奧姆普爾（Kyzya Ompul）鈾礦，探明的氧化鈾儲量3402噸。另外，伊塞克湖地區還有卡普恰蓋鈾礦、烏托爾圖尤克鈾礦等。
