朱翊鈞關於東北大開發的各項政策，對於女真來說並不友好。而隨著大量漢民湧入，朱翊鈞預料東北地區的民族矛盾將空前激烈。
為政者若不能高屋建瓴，總被矛盾推著走，遲早有一天會被矛盾所淹沒。
為了解決女真問題，在蓄髮右衽消除民族差異的基礎上，朱翊鈞擬三管齊下。一者在東北各城設立僧錄分司，從全國各地抽調僧人來遼東傳法愚民，在宗教信仰上徹底打垮薩滿；二者腐化女真各部高層，賞賜奢侈之物，迅速構建生活奢靡卻毫無鬥志的上層群體，在女真內部製造階級矛盾；三者在女真底層招兵，從根子上抽出其戰鬥力的同時，利用兵餉瓦解女真底層的反抗。
朝廷明旨各部女真放歸漢民和朝鮮奴隸，時機也是精心選擇的。在收了糧食之後的冬季進行，遭遇女真基層的激烈反抗的可能性微乎其微。
因為不善耕作，女真各部儘管佔據著膏腴之地，但口數增長極其緩慢。大多數婦女、兒童和老人常年處於飢餓狀態，好年景時，每年死於營養不良的女真幼兒十之二三；災年時候七八個幼兒中大概只能活下一兩個。
基於民族性的經濟結構矛盾，除非有政權能夠針對性的予以教化，同時調整其生產模式才能破解。
雖然歷朝歷代無數有識之士，都明白這個道理。但中原盛世時期，有志於此而且付諸實踐的少之又少——這方面做的最好的，大概是原時空對此最能感同身受的清朝歷代皇帝和明初太祖和成祖這開基二祖。
明代太祖、成祖時期，一方面對蒙元大肆用兵，另一方面大規模使用歸化蒙古人、女真人，並鼓勵其部族內遷。當時，大量的蒙古人、女真人被分散安置到北直隸各衛所，最後被徹底漢化。
永樂時，鄭和本族為回族，而建造永寧寺的亦失哈就是女真宦官——其盛世其來有自，朱棣之心胸非後世可輕侮。被朱翊鈞梟首的吳繼爵最為典型，他的祖先就是成祖時期的歸化蒙古人，到了吳繼爵這一輩，除了勳貴圈子，其餘文官武將幾乎沒人知道了。
但遺憾的是，仁宗之後——簡單的羈縻政策和儒家的保守主義，造成了帝國南北兩個方向的改土歸流進展極其緩慢。
在中原軍力強盛時，羈縻少數民族的政策尚能維持“四夷朝貢”的表面風光。待中原軍力孱弱，未曾改土歸流的國土就開始大面積淪喪，原因不再贅述。
由於明廷軍力在土木堡之後迅速由強轉衰，奴兒干都司的羈縻之策也如帝國其他方向一樣，逐漸失效。
女真失去了強軍的壓制，基於本民族經濟的結構性矛盾，開始大規模劫掠漢民，一方面獲取基礎的生產、生活資料，另一方面掠奪善於耕作的漢人作為奴隸就成為一種必然的選擇。
當時的一個農夫，一年能伺候十畝地就算老把式。而遼東儘管土地肥沃，但生產資料嚴重不足，十畝地一年在最好的年景能達到極限也就是十五石。
如果主家虐待，漢奴積極性不高的話，每年養一個漢奴的女真部民家連七、八石糧食都收不上。——這還是在家中婦孺一起上陣伺候田畝的情況下。
王杲覆滅後，女真上下都處於朝廷重威之下。雖然缺糧的危機沒有迫在眉睫，但女真普通部民失去了自家的漢奴，也陷入了明年無人種地的恐慌。雖然好多窮苦的女真部民已經半耕半牧，但沒有漢民指導，他們心裡一點底都沒有。
對此時已經失去希望的女真底層部民來說，突然被告知遼東樹旗招兵，且待遇優厚，他們的的的確確感受到了皇帝的無上恩澤。
朝廷許諾：凡女真一兵帶馬投軍者，立即發放安家糧十五石，並每歲供糧七石，棉花四斤，從軍時首級功賞與漢兵同。不帶馬投軍者，安家糧減半，其餘相同。
從軍三年以上或得首級功者，由官府組織其家與漢民結成幫扶對子，兩家耕地合併，漢民指導其家屬耕種技術，所獲口糧六四開。
這兩項政策，如同刺破烏雲的一縷陽光，給了女真底層部民生存下去的無限希望。
效果好的超出了朱翊鈞以及朝廷上下最樂觀的估計：女真青壯踴躍參軍，如同涓滴溪流匯成湖海。
萬曆三年的春季到來前，參加遴選，並獲得參軍資格的女真已經達到了五萬人，共攜帶馬匹八千多匹。許多女真家族，出現了妻送夫、母送子踴躍參軍，保家衛國的感人場面。
有一個家裡兒子多的女真部民，除了留小兒子守家之外，其餘的哥兒六個，和其父一齊參軍，獲得了遼東巡撫張學顏的接見表彰並被樹立成典型。
根據對女真各部情況最熟悉的李成梁奏報，此際分佈在白山黑水之間的男丁口數大概二十六、七萬，具有作戰技能的約三分之一。朝廷這一笊籬下去，一多半的女真兵都被撈了出來。
......
對於基層女真部民的踴躍參軍現象，在虜酋間引發劇烈恐慌。由於參軍的女真戰士在各部的分佈並不均勻，生活條件差的小部落幾乎被朝廷抽成空殼。
如此一來，或明或暗的抵制幾乎成為必然。然而，再強大的抵制也抵擋不住部民對糧食的渴望。按照招兵令的規定，告發自家部族首領阻礙部民參軍的舉報，遼東總兵府年後每日都能收到。
遼東總兵府在多個邊鎮都設立了接訪點，專門接待鬼鬼祟祟的女真部民來上訪，成了讓朝廷上下瞠目結舌的一道奇觀。
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