離開晉中，孫思邈前往晉南。晉南地處汾河沿岸，地勢低窪，每逢雨季，溼氣瀰漫，百姓腰腿痛、骨關節炎的發病率更高。
孫思邈剛到臨汾城外的郭村，便見一群村民抬著擔架匆匆趕來，擔架上躺著一位年輕婦人，她的丈夫抱著她，哭得撕心裂肺：“孫大夫，求您救救俺媳婦！她這腿疼得厲害，連路都走不了，家裡還有兩個孩子要養啊！”
孫思邈連忙檢視，只見婦人的腿關節腫脹僵硬，皮膚下青筋凸起，正是重度骨關節炎，己到了無法行走的地步。他當即施針，又用藥酒敷貼，膏貼外敷，連續診治三日，婦人的腿竟有了好轉，能勉強坐起。
孫思邈又為她開了食療方，用羊肉、當歸、生薑熬湯，每日一碗，溫養氣血，配合藥治療效更佳。
半月後，婦人竟能拄著柺杖下地行走，她拉著孫思邈的手，泣不成聲：“孫大夫，您是俺家的救命恩人啊！俺們全村人都記著您的好！”
郭村的百姓見狀，也紛紛效仿平遙村民，請來石匠，在村口的土地廟旁立起神醫碑與功德碑，碑上刻著孫思邈的事蹟，碑前擺滿了百姓獻上的鮮花與祭品。
孫思邈在晉南行醫期間，還遇到一樁特殊的病例。一位少年，年方十五，自幼患上先天性頸椎病，脖頸歪斜，無法正常抬頭，西處求醫無果。
孫思邈仔細檢視後，發現少年並非骨骼畸形，而是因氣血虧虛，筋脈失養，加之長期姿勢不當，致頸椎錯位。他並未貿然正骨，而是先以針灸調理氣血，刺激筋脈，再用特製的正骨手法，配合藥酒揉擦，逐步復位頸椎。
每日診治時，孫思邈都耐心安撫少年，教他做簡單的頸椎康復操，避免再次錯位。同時，他為少年開了內服的補氣血湯藥，又用膏貼貼於頸椎患處，溫通經絡。
連續診治一月，少年的脖頸竟能慢慢抬起，雖未完全恢復正常，卻己能正常生活。
少年的父母跪地謝恩，孫思邈扶起他們，道：“孩子還小，氣血漸盛，堅持調理，日後定能恢復如初。”
晉南的百姓見孫思邈連疑難雜症都能治好，更是對他敬若神明。有百姓提議，為孫思邈塑一尊像，供在土地廟中，日日供奉，卻被孫思邈拒絕。
他說：“我只是做了醫者該做的事，百姓的心意我領了，塑像不必。若真要留個念想，便將我教你們的醫術傳下去，讓更多人能治病救人，才是最好的念想。”
離開晉南，孫思邈前往上黨地區。上黨群山環繞，山路崎嶇，百姓多以採藥、狩獵為生，常年奔波于山間，極易患上腰腿痛、肩周炎。
孫思邈剛到上黨壺關縣，便聽聞當地有一位老郎中，醫術尚可，卻因年事己高，無力為更多百姓治病。百姓們聽說孫思邈到來，紛紛趕往老郎中的藥鋪，將孫思邈圍了個水洩不通。
壺關縣有一位獵戶，常年上山狩獵，患上嚴重的腰腿痛，一次狩獵時不慎摔下山崖，腰部受傷，從此臥床不起。孫思邈為他診治時，發現他不僅有腰腿痛，還因外傷致腰椎間盤突出，病情複雜。他先以針灸刺激腰部穴位，疏通經絡，再用藥酒熱敷腰部，配合正骨手法復位突出的椎間盤，最後貼上膏貼，輔以內服湯藥。
獵戶的妻子守在一旁，日夜照顧，見孫思邈每日為丈夫診治，心疼不己，便拿出家中僅有的一袋小米，遞給孫思邈：“孫大夫，俺們沒什麼值錢的，這袋小米是俺們自家種的，您收下吧。”
孫思邈接過小米，溫聲道：“大嫂，心意我領了，這小米我收下。你放心，我定會治好他的病。”
連續診治十日，獵戶便能下床行走，雖不能再上山狩獵，卻能做些輕活。他拉著孫思邈的手，哽咽道：“孫大夫，您救了俺的命，俺們上黨百姓都記著您的恩！”
上黨百姓見狀，也紛紛湊錢，請來石匠，在壺關縣城的中心廣場立起神醫碑與功德碑，碑上刻著孫思邈的生平事蹟，以及經他醫治康復的百姓名單。
孫思邈在山西遊歷數月，足跡遍佈晉中、晉南、上黨各地，經他醫治的百姓數以千計，從白髮蒼蒼的老人，到襁褓中的嬰兒，皆受其恩惠。百姓們為他立的神醫碑、功德碑，一塊又一塊，矗立在山西的鄉村與縣城，成為當地一道獨特的風景。
孫思邈站在碑前，望著碑上的大字，心中百感交集。
此時，山谷中的百姓紛紛圍攏過來，手中拿著鮮花、水果，還有百姓拿出了自家釀的米酒，想要獻給孫思邈。
一位白髮蒼蒼的老嫗，顫巍巍地走到孫思邈面前，遞給他一個布包：“孫大夫，這是俺們山谷百姓的一點心意，您收下吧。這布包裡是我們親手繡的鞋墊，您行路多，用得上。”
孫思邈接過布包，開啟一看，裡面是數十雙繡著草藥圖案的鞋墊，針腳細密，做工精緻。他眼眶微紅，緊緊握住老嫗的手：“老人家，心意我領了，這些鞋墊，我會好好珍藏。”
百姓們簇擁著孫思邈，唱起了當地的民謠，歌聲在山谷中迴盪，充滿了感恩與敬意。
孫思邈站在人群中，望著一張張淳樸的臉龐，心中滿是欣慰。他知道，自己所做的一切，都值得。
夕陽西下，金色的陽光灑在神醫碑上，碑身熠熠生輝。孫思邈背起藥箱，向百姓們拱手作別：“各位鄉親，我還要繼續遊歷，為更多百姓治病。你們的心意，我銘記於心。日後若有難處，可尋我留下的醫書，按方施治，亦可派人尋我。”
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