約翰尼斯放棄了與坎塔庫澤諾斯家族的聯姻，轉而迎娶塞爾維亞王族之女索菲婭拉扎雷維奇。恰在此時，名為穆斯塔法的奧斯曼王族突然現身索要皇位，塞爾維亞與共治皇帝約翰尼斯視此為良機，聯手支援叛亂卻最終功敗垂成。
當莫雷亞被要求作為盟軍協助鎮壓叛亂時，因其態度曖昧不清，威尼斯趁勢聯合出兵，一舉攻陷了阿提卡公國。
【髮妻因難產夭折之痛香消玉殞。續絃夫人亦不久於人世。】
西元1421年，十七歲。
繼續對未加入奧斯曼聯盟的城邦發動猛攻,逐一征服。在以埃皮魯斯公國為核心的聯軍身上取得勝利後,他立弟弟托馬斯帕里奧洛格斯為埃皮魯斯的親王。
在收復阿內特的同時，帕特農教會開始著手重建。為安撫首都持續高壓下躁動的人心，大主教首次公開提議設立總教區。
與此同時,當朝蘇丹穆罕默德一世默許此次征討,引發軍中不滿,將士們遂擁立穆拉德二世登基。共治皇帝約翰尼斯料定叛亂餘波未平,仍堅持強硬路線。
然而覬覦帝位的穆斯塔法與剛平定保加利亞叛亂的穆拉德二世，終究兵臨君士坦丁堡城下。陷入絕境的約翰尼斯急遣使者向莫雷亞求援，為解圍城之危，大軍隨即拔營出征。
穆拉德二世年僅十七歲便繼承大統，他御駕親征，兩次平定叛亂。
1422年，年方十八。
面對穆拉德二世的進軍，男主將內帕特雷化作火攻戰場，烈焰吞噬數千敵兵，硬生生拖緩了推進速度。當耶尼切裡軍團咬尾追擊時，他親率騎士佯裝敗退，將追兵誘入伏擊圈。鐵騎自山隘間暴起突襲，殺得敵軍潰不成軍。
他故意讓部分士兵掉隊，佯裝成生死攸關的危急模樣引誘敵軍注意，隨即發動突襲。再次造成數千人傷亡，令穆拉德二世焦頭爛額。隨後他試圖在阿內特據城死守，但奧斯曼人已建立起高效的運輸體系，開始大規模使用石炮轟擊，令他陷入絕境。
副官阿德里亞諾斯主動請纓斷後力戰而亡，可當殘部撤至科林託斯近郊時，奧斯曼艦隊突然從海面殺出。鐵甲戰船切斷退路，殘存將士頓時陷入重圍。
但在奧斯曼主力部隊全面壓境前，他率先調動熱那亞艦隊這支援軍，成功誘使威尼斯做出反應。當兩大共和國幾乎同步展開軍事行動時，穆拉德二世誤將這聯動視為十字軍東征的前兆，因而遲延了戰略決斷。
在熱那亞與埃皮魯斯聯軍的支援下，他率軍突破科林託斯防線，挾持帝國庇護的奧斯曼王族，成功煽動安納托利亞諸總督揭竿而起。最終迫使穆拉德二世因本土告急而和談，一舉收復至拉里薩周邊地區。
從這場戰爭中汲取教訓後，他一歸來便雷厲風行地展開了全面改革。
【攻佔君士坦丁堡失敗的奧斯曼大軍，將怒火傾瀉向莫雷亞。面對洶湧攻勢，莫雷亞毫無招架之力，任何抵抗都成了徒勞。】
1423年，十九歲。
威尼斯人接管了塞薩洛尼卡。退位的馬努伊爾二世與現任皇帝約翰尼斯全力支援，指定他為共治皇帝。加冕典禮上，鎏金權杖折射著燭光，紫袍綬帶摩擦發出沙響，他迎著十二聲禮炮踏上猩紅地毯。
【帝國的最後一場加冕禮未能在聖索菲亞大教堂舉行，而是在莫雷亞倉促完成。末代皇帝自此再未獲得正式加冕的機會。】
1428年，24歲。
平定安納托利亞的蘇丹穆拉德二世震怒於君士坦丁堡的忤逆之舉，悍然發兵征討色雷斯。戰火肆虐下，除君士坦丁堡外的色雷斯全境流民四起，人們或逃往莫雷亞，或西渡避難。
【色雷斯這片土地，從未真正重歸帝國懷抱。】
1430年，26歲。
穆拉德二世頒佈大規模封臣徵召令。
響應徵召的基督教封臣齊聚一堂，集結大軍逾三萬之眾。穆拉德二世以鐵腕震懾君士坦丁堡，掃清後方威脅。旋即劍鋒西指，向著因傷重未能赴約的塞爾維亞公爵斯特凡拉扎雷維奇發動討伐。
短短數月間，塞爾維亞南部大半疆土已淪陷於奧斯曼鐵蹄之下。西方諸國危機感驟增，在教皇大力推動下，企圖透過召開議會組建新十字軍。豈料穆拉德二世先發制人扣押帝國使團，教皇只得撇開帝國單方面頒佈十字軍東征詔令。
就在這期間，他的私生女海倫妮呱呱墜地。
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