反對皇帝統一教會的東正教勢力與視此舉為威脅的奧斯曼帝國暗中勾結，企圖刺殺皇帝。
然而洞悉陰謀的皇帝將計就計，藉機肅清了帝國內部的奧斯曼密探，一舉摧毀其情報網路，同時擊垮了教會中的強硬派。隨著大規模清洗展開，皇室在與教會的對抗中佔據了絕對優勢。
平息內部反對聲浪的皇帝立即動身前往教廷。
察覺到危機的阿方索立即揮師北上，從西西里島直撲那不勒斯王國展開全面進攻。教皇震怒於阿方索的武力行為，不僅指定安茹家族的雷內為新任那不勒斯國王，更承認米蘭吞併羅馬涅的行徑，以此換取維斯康蒂公爵的支援。
阿方索隨即設下埋伏，趁雷內德安茹前往加冕途中發動突襲。他將俘虜囚禁在地牢，脅迫教皇承認自己對那不勒斯王國的合法統治權。
【...皇室權威已然形同虛設。步入末路的帝國,皇帝不得不借總主教的威名,向異邦乞援。】
1436年,三十二歲。
在宮廷重臣胡尼亞迪亞諾什的鼎力支援下,他身兼教廷全權特使與那不勒斯王國攝政二職,肩負起抗擊阿方索的重任。
皇帝雖召開法庭欲問責阿方索的連番挑釁,但阿方索忌憚被繳械而抗命不從,反趁機掌控那不勒斯王國南部要塞,刻意將戰事拖入膠著。
皇帝抓住時機,派遣帝國代表團加入教廷,開啟了旨在統一教會的宗教會議。阿方索深恐一旦教皇撤銷對皇帝的絕罰令、教會成功統一,自己將喪失希臘地區的統治權,終於決定出兵征討。
與此同時，皇帝揮師南下那不勒斯，巧妙籠絡了因阿方索高壓統治而心生不滿的當地貴族。他集結壯大軍隊後，立即調轉矛頭，率領大軍直逼教廷腹地。
羅馬郊外，皇帝率軍與阿方索對峙。他深知阿方索不敢貿然攻擊羅馬子民，便藉助胡尼亞迪的支援，將士兵暗藏在市民隊伍中。當偽裝成平民的軍隊行進至阿拉貢部隊附近時，皇帝一聲令下，伏兵暴起直取敵軍指揮部。
混亂由此蔓延，當阿方索麾下的那不勒斯士兵開始與阿拉貢軍隊自相殘殺時，皇帝趁機發起猛攻，最終擊敗了阿方索的部隊。
在阿方索之戰告捷的皇帝威望加持下，東西雙方終於以平等地位締結了神聖議會。皇帝剛取得十字軍東征的承諾便立即班師回朝，開始全力籌備這場聖戰。
【將全部希望寄託於議會。這已是這個瀕臨崩潰的國家所能做的最後掙扎。】
西元1437年，時年三十有三。
匈牙利宮廷重臣胡尼亞迪亞諾什聯合阿爾巴尼亞國王喬治卡斯特里奧蒂率領的大軍，以十字軍之名會師，向奧斯曼帝國發起猛攻。
胡尼亞迪亞諾什行事狠辣果決，憑藉高效戰術不到一月便攻入瓦拉幾亞腹地，攪得敵軍陣腳大亂；而自奧斯曼投誠而來的傑爾吉卡斯特里奧蒂則率領阿爾巴尼亞軍，將駐守塞爾維亞的奧斯曼部隊殺得潰不成軍。
當被迫陷入三線作戰的奧斯曼軍隊仍在固守陣地時，皇帝趁機率軍夾擊，聯軍規模已達三萬之眾。
就在莫雷亞地區即將完成統一之際，穆拉德二世率軍突襲這片土地。鐵騎所過之處，滿目瘡痍，數萬帝國子民淪為奴隸，被鐵鏈拴著押往異國他鄉。
1438年，三十四歲。
皇帝不願坐視奧斯曼統治下的疆土日漸荒蕪，決意以雷霆之勢將其驅逐。而志在擴張的奧斯曼人亦不甘示弱，雙方遂在阿德里安堡以北與瓦爾納以西的荒野短兵相接。鐵蹄踏碎凍土，刀劍撕開寒霧，一場決定帝國命運的鏖戰就此展開。
有人將那裡爆發的激戰稱為奇蹟。刀光劍影中，鮮血飛濺聲不絕於耳，那是凡人難以想象的超凡之戰。
然而這奇蹟般的勝利，是用數十年積累的犧牲換來的。七萬對陣三萬，最終竟是三萬人馬取得了勝利。皇帝親率的十字軍殲滅了奧斯曼七萬大軍主力，將奧斯曼勢力幾乎徹底逐出了希臘全境。
自那以後，奧斯曼帝國除加利波利部分地區外盡失所有據點，而這位皇帝時隔整整半個世紀，終於得以確保君士坦丁堡的安全。
曾以索要塞薩洛尼卡為由阻礙帝國重建的威尼斯,也在這場戰爭後走向衰落。皇帝將滿目瘡痍的君士坦丁堡重新定為首都,同時昭告天下誓要收復安納托利亞。
與此同時,狄奧多羅透過獲得羅德島騎士團、塞爾維亞、瓦拉幾亞、阿爾巴尼亞等同盟國與附庸國的支援,重建了霸權地位。
【從那時起，這個國家便只能祈求十字軍凱旋。即便接連傳來十字軍潰敗的訊息，民眾仍日夜禱告不休。曾令帝國傾覆的十字軍，如今竟成了拯救王朝的唯一浮木。何其諷刺。】
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