“可以嗎？”
“當然可以，麻煩教授了。”林曉當即欣然應允。
兩人一前一後，沿著長廊朝著理學院獨立辦公樓走去。
作為計算生物學領域的先驅、美國院士級別的頂尖學者，邦妮·伯傑在MIT理學院的地位極高，往來的教職工和學生見到她，都會主動致意。
一路上有不少目光落在二人身上。
林曉跟在身後，心底暗自感慨，也算體驗了一把另類的狐假虎威。
很快抵達目的地。
這裡說是一間辦公室，但更像是一處雅緻安靜的獨立辦公區。
邦妮教授走到辦公桌旁坐下，然後招呼他坐下。
“OK，現在沒人干擾了。”
“你繼續說。”
林曉也不廢話，接著剛剛的話，繼續說道：“如果群體分層的偏差，會在基因協方差矩陣中形成低秩干擾結構，而基因物理耦合對應的是稀疏結構。那我們是否可以調整DCA的正則化項，用稀疏+低秩雙矩陣分解，徹底替代目前行業通用的稀疏+偽計數校正框架？”
話音落下的瞬間，邦妮·伯傑沒有多少遲疑，當即點頭認可，心裡己然對林曉有了一個極大的改觀。
“不難看出…… 你剛才說的這個，原則上並不荒謬。”
她停頓了一下，開口時，語速比剛才慢了大約三分之一。
“DCA 的核心假設是：真正的首接耦合在矩陣中是稀疏的 。也就是說，只有少數幾對殘基之間存在真實的相互作用。而間接關聯，來自於這些稀疏相互作用透過統計傳播所產生的背景噪音，在頻率矩陣中表現為一種稠密但結構化的干擾。”
“注意到目前業界通用的演算法框架，是依靠偽計數與平均場近似，強行抹平這些背景干擾。”
“但你提出的是另一種思路，不抹平它，而是顯式地把它建模為一個低秩結構，然後用矩陣分解把兩個部分分開。”
說著，她抬手拿起桌上的鋼筆，沒有書寫推演，只是捏在指尖輔助思考。
“這套思路在訊號處理領域，有非常成熟的數學對應，魯棒主成分分析。只要你的前提成立，群體分層確實表現為低秩全域性擾動，RPCA的凸最佳化框架，完全可以同步分離低秩干擾與稀疏有效訊號。”
被肯定了假設，林曉點點頭，有些振奮地繼續說道：“如果是這樣的話，我們或許可以把 DCA 改造成一個育種干擾因子濾波器，而不是僅僅把它當作一個結構預測工具。”
“這樣一來，育種家就可以從一個全基因組 SNP 矩陣出發，首接分離出值得雜交組合的功能模組，而不是被群體分層和連鎖拖車干擾。”
聽完這番新穎且邏輯有序的跨領域創新構想，邦妮·伯傑心中的訝異徹底抵達頂峰。
她完全沒有想到，一個普通的本科生，沒有侷限於課堂傳授的既定知識，反而跳出了課本固化的思維定式。
然後將課堂所學的計算生物學知識靈活遷移，結合自己對其他領域的理解，對經典演算法提出了全新的改良思路，有著完全屬於自己的獨特學術思考。
雖然還沒有得到驗證，只是一個粗糙的想法。
但己經足夠亮眼、足夠出人意料。
此刻的邦妮，早己沒有了最初的隨意。
。行可地落的架框法算演新全套這演推真認，心下沉始開，念雜有所起收
