一週時間轉瞬即逝，MIT新學期正式開啟。
對林曉而言，這個新學期的節奏就己經徹底鬆弛下來。
歷經整個寒假的通宵攻堅，他的DCA基因組解析課題核心演算法己經完全落地成型。
整套研究框架搭建完畢，最難的理論突破與程式碼落地環節都己經結束了。
後續只剩引數微調、公開資料集測試與論文撰寫的工作，不需要再像之前那樣爭分奪秒、日夜趕工。
哪怕不用CSAIL裡的頂級工作站，依靠普通裝置完成剩餘收尾工作也綽綽有餘。
只不過，讓林曉倍感意外的是，邦妮教授又給他續了一整個學期的實驗室實習許可權。
原本僅限寒假的科研資格得以順延，讓他在新學期依舊能出入頂尖實驗室，呼叫海量算力與科研資源。
這份優待，林曉還是很感激的。
......
新學期。
上午九點。
又到了一週一次的《計算分子生物學專題》課。
經過上學期的課程打磨，所有選課新生都早己摸清邦妮·伯傑教授的授課風格。
極簡凝練、思維跳躍。
重邏輯輕鋪墊，不講冗餘基礎。
首奔核心難點，聽課門檻極高。
林曉和艾文並肩坐在教室後排。
他現在越來越覺得，邦妮教授講課水平確實很高。
但可能只是因為聽課的人水平達不到，基礎比較薄弱，所以聽得一頭霧水。
可一旦具備足夠的科研積累，便能察覺到她課程裡字字乾貨、句句精髓。
詳略得當、格局極高，完全是頂尖學界的前沿視野。
“好了，各位，上節課我們討論了序列比對中的經典動態規劃。”
“今天，我們要把這個問題升級一下。 當我們面對的不是兩條序列，而是成千上萬條來自同一微生物群落的宏基因組 DNA 片段時，我們的演算法還 Work 嗎？”
“這是個真實問題。我們從人體腸道樣本中測序，得到了幾百萬個短讀長。”
“現在的挑戰是，我們能不能只根據這些碎片，就重建出群落裡所有物種的基因組？ 這叫做‘宏基因組組裝’”
“所以，我們實驗室幾年前提出了一個方法，叫做MetaSpades的變體思路，但今天我更想和你們深入探討的是演算法底層的計算最佳化策略。我們不談生物學應用，就談計算。”
她走到白板前，開始畫一個簡化的二分圖。
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