林曉目光在議程標題上短暫停留，隨即從容翻開筆記本，靜待交流開始。
顧洪雅沒有搶佔主位，而是側身坐在林曉斜對面，將座椅輕輕轉過來，首面眾人，率先開口道。
“今天特意請林曉同學過來，主要有兩部分交流內容。”
“第一部分是我個人針對這項技術的核心疑問，偏向理論層面。”
說完，她繼續補充道：“第二部分，是各位課題組的同學們，針對實際育種實驗遇到的難題提問，大家可以自由發言、深度探討。”
話音落下，顧洪雅率先丟擲自己積攢己久的問題。
“你論文中提到，DCA在基因組尺度遷移的合法性，高度依賴QLE假設。我想請教，在真實的植物群體資料中，LD衰減速度和蛋白質序列連鎖模式完全不在一個量級，這種情況下，QLE假設的實際適用邊界，是不是比論文預設的還要更狹窄？”
這個問題極其專業，戳中了當下育種領域最棘手的實操痛點，稍有不慎就容易回答片面、出現漏洞。
不過這個對於林曉只能算小case。
畢竟邦妮教授之前幫他看論文的時候，那可是各種難題層出不窮。
“是的，實際邊界遠比理論預設更窄。”
“QLE假設在理想試驗群體中可以完美成立，但玉米這類高LD連鎖物種，相鄰位點的耦合訊號，會被連鎖背景嚴重干擾、覆蓋，極大影響預測精度。我在擬南芥試驗中就己經發現了這個問題。”
接著，他繼續解釋道：“最優解決辦法，是在資料推斷前，先完成一步LD剝離。透過滑窗式背景模型，剔除連鎖背景中的無效共變異訊號，再將提純後的有效訊號代入DCA框架運算。”
顧洪雅眼神一凝，又追問了一個關鍵細節：“剝離處理之後，非編碼區的位點召回率，還能保持原有精度嗎？”
林曉沒有絲毫遲疑，幾乎是脫口而出：“可以維持穩定精度。”
“但核心關鍵在於剝離引數的適應性調整，不同作物的LD衰減速率差異極大，無法通用一套引數。”
“我在論文附錄給出了通用調參框架，但尚未針對玉米物種做專項實測驗證。”
顧洪雅聽完點點頭，眼底滿是欣賞與認可：“那正好，我們課題組手握完整的玉米LD衰減曲線實測資料，剛好可以幫你完成框架驗證，能省去你大量前期試驗和資料整理的時間。”
全程一問一答，銜接流暢。
林曉的邏輯縝密，沒有半點卡頓和含糊。
會議室裡。
所有年輕師生看在眼裡，心底齊齊冒出同一個念頭：果然是名不虛傳啊！
理論層面的深度探討結束，接下來輪到學生提問環節。
萬遠翔和劉磊悄然對視一眼，彼此都看懂了對方的心思。
猶豫片刻後，萬遠翔深吸一口氣，主動站起身，說出了困擾課題組許久的難題。
“林曉同學，你好。”
“我們課題組跑完GWAS分析後，篩選出了上千個候選基因位點，但透過傳統方法完成功能註釋後，絕大部分位點都找不到對應的調控關聯，完全無法落地驗證。”
“我們現在徹底卡在這一步，不知道是該繼續深耕挖掘現有位點，還是徹底更換篩選策略，想請教一下你的建議。”
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