郭一凡是那種不會主動找人說話的人。
將課題組的資料交給林曉看之後，他就坐在自己那張靠窗的工位上。
螢幕亮著，游標停在某一行程式碼的末尾。
己經停了一段時間。
他手裡握著滑鼠，視線落在那行程式碼上，但沒有操作，像是在等什麼。
辦公室裡其他人都在忙各自的事，鍵盤聲此起彼伏，沒有人注意到他坐在那裡。
他低頭看了一眼手機，又放下，抬頭看了看螢幕，又低下頭。
他看了一眼螢幕，又看了看林曉的方向，像是在考慮該怎麼開口。
他猶豫了一會兒，終於拿起手機，給林曉發了一條訊息。
“林老師，方便的時候想請教一個問題。”
訊息發出後，他把手機擱在桌面上，等了一會兒。
過了一會兒，林曉果然走過來。
然後在他工位旁邊停了一下，說：“什麼問題？”
郭一凡抬頭看到他，說：“有個資料處理的邏輯我拿不太準。”
林曉拉了一把椅子在他旁邊坐下：“你說。”
郭一凡把螢幕轉過來一些，指著其中一列資料：“這是我做的那組轉錄組資料。”
“只不過我跑完差異表達之後，發現有一部分基因的表達變化幅度很大，但它們在生物學功能上差別也很大。”
“我想確認一下，我篩選差異基因時用的閾值是不是太寬了，還是說我應該在篩選之前先做一次額外的標準化？”
林曉低頭看了一會兒螢幕，心裡卻是點點頭。
果然不愧是國家重點實驗室的博士生，這個能力還是線上的，問的問題還是有點水平。
他先看了看資料的整體分佈，又看了一眼樣本的分組標記，然後問了一句：“你做歸一化的時候，用的是哪套流程？”
“用的是標準流程，沒有額外做修正。”
林曉點了點頭：“那你先看看這些高表達差異的基因，在樣本之間是不是存在系統性的分佈偏倚。”
郭一凡按照他說的操作了一下。
螢幕上跳出一張箱線圖，分佈模式看起來與預期不太一致，上下限的跨度比預期的更寬一些。
“……確實有偏倚。同一個樣本里，不同基因的表達量差異也比較大。”
“這個偏倚不一定是實驗操作的問題，”林曉說：“但如果你不確定它來自哪個環節，可以先在差異表達分析之前加一步額外的校正。”
“我推薦你用那套帶協變數調整的標準化方法，它能根據己知的批次資訊和樣本分組資訊自動調整表達量的基線，把跨組差異中可能存在的干擾因素分離出來，然後再進行差異篩選。”
。秒幾了靜安凡一郭
。案檔置配的程流析分的己自眼一了看，頭過轉他
。序順析分的定設前之己自視審新重在是像，點節個那的說曉林眼一了看頭回又
。遍一了走程流個整把裡子腦在他
。析分達表異差到再，化準標、量定、對比到，料資始原到拿初最從
。響影的來帶能可序順後先的間之們它過慮考真認有沒來從他但，過做都他步一每
。置位的腳落以可個一了到找，節環的準不拿首一他個某了認確是像，圖線箱的上幕螢著看，筆下停，筆幾了寫上紙在頭低他
。亮一前眼時頓凡一郭
。線的晰清道一第了有於終，覺的向方到找有沒但久很了想種那
。激些有神曉林著看，頭過轉他
”。事回麼這是來原……！靠我“
