建安三年（198年），孫策派徐琨趕走袁術所派的丹陽太守袁胤，平定宣城以東各地，迎接剛從袁術處回來的吳景擔任丹陽太守，之後孫策親自進攻丹陽涇縣以西。他先進擊陵陽，擒獲祖郎，又進擊勇裡，擒獲自封丹陽太守的太史慈。孫策平定丹陽回師吳郡後，拜太史慈為折衝中郎將，授祖郎為門下賊曹。 這時，袁術之前任命的周瑜為居巢長，魯肅為東郡長，但二人知袁術難成大器，在孫策平定丹陽時相繼棄官渡江來投奔孫策，孫策親往迎接周瑜，拜建威中郎將，當即給周瑜增兵二千人，馬五十匹。又給周瑜鼓吹等軍用樂隊，興建府院住處，所贈賜的東西在軍中無人能比。 同年，孫策又向漢廷貢獻禮物，規模是建安元年的兩倍。漢廷任命他為討逆將軍，封為吳侯。
建安四年（199年），孫策正準備與曹操、董承、劉璋併力討伐劉表和強弩之末的袁術，軍隊已經整裝待發，但是袁術卻得病而死。 袁術死後，袁術的部下楊弘、張勳欲投奔孫策，不料卻被廬江太守劉勳截擊，全體被俘。而袁術的堂弟袁胤、女婿黃猗等人，也懾於曹操的威力，不敢守衛壽春，抬著袁術的棺木，帶領袁術的家小和部曲男女，到皖城投奔劉勳。孫策以謙恭的言辭和豐厚的禮物勸說劉勳攻取上繚，在劉勳成行後。 孫策率軍繞襲劉勳的大本營皖城，一舉攻破。又在隨後打敗了救援劉勳的黃射（黃祖之子）。十二月八日，孫策進至黃祖屯兵的沙羨。劉表派侄兒劉虎和南陽人韓曦帶領長矛隊五千人趕來支援黃祖。十一日，孫策率領周瑜、呂範、程普、孫權、韓當、黃蓋等同時進攻黃祖軍，最後黃祖隻身逃走，其妻妾子女共七人被孫策抓獲，劉虎、韓曦並兩萬餘部重被殺，跳水溺死者達一萬餘人，孫策繳獲船隻六千餘艘，財物堆積如山。
建安四年（199年）末 ，孫策大敗黃祖後東進豫章，駐軍椒丘，對虞翻說：“華歆名聞於世，但絕非我的對手。如果不早歸附，將來金鼓一震，戰局一開，生靈塗炭，在所難免。你先進城去，把我的意思說給他聽。”虞翻領命進城，見到豫章太守華歆，陳明利害，華歆舉城投降。因劉繇病故於豫章，孫策順便將劉繇的靈柩帶回歸葬，並且帶回其遺孤劉基等諸子，這一舉動受到了王朗的來信稱讚。孫策留中護軍周瑜鎮守巴丘，派遣太史慈為建昌都尉，治海昏，抵擋劉磐，使劉磐不敢侵擾。
這時袁紹的勢力正強大，而孫策又吞併了江東，曹操已無力東顧，嘆息說：“難以與他爭鋒了！”就打算對孫策實行安撫。於是把弟弟的女兒許配給孫策的小弟孫匡，又為兒子曹彰迎娶孫賁的女兒，用禮徵召孫策的弟弟孫權、孫翊，並令揚州刺史嚴象舉薦孫權為茂才。
建安五年（200年），曹操與袁紹在官渡對壘相持，孫策暗中盤算襲擊許都，迎取漢獻帝，便秘密整頓軍隊、部署將領，自封大司馬，自恃勇猛，不設防備。
當初，孫策殺死許貢。許貢的幼子與門客逃亡到江邊。建安五年四月四日，孫策在丹徒山中打獵。他騎的是一匹快馬，扈從騎兵被遠遠的甩在後面。這時忽然碰到三個人，這三人都是被孫策所殺的吳郡太守許貢的門客，孫策問：“你們是什麼人？”三人回答說：“我們是韓當計程車兵，在這裡射鹿。”孫策說：“韓當計程車兵我全部認識，從沒見過你們。”說完向其中一個射箭，那個人隨著弓弦的聲音而倒下。餘下二人非常恐慌當即彎弓搭箭，向孫策射來。孫策面頰中箭。這時，後面的扈從騎兵尋找到孫策，將刺客全部殺死。
孫策傷勢甚重，自知不久於人世，就請來張昭等人，託以後事：“中原正在大亂之中，憑我們吳、越的兵眾，三江的險固，足以觀其虎鬥成敗。你們要好好輔佐我弟弟！”又對張昭說：“如果我弟弟孫權不能勝任，你就可以取而代之。即使不能勝利，慢慢西歸，也沒有什麼顧慮了。”又招呼孫權，將印綬交予他，對他說：“率領江東兵眾，決戰兩陣之間，橫行爭衡天下，你不如我；但舉賢任能，使其各盡其心，用以保守江東，我不如你。”到夜間孫策便去世了，年僅二十六歲。
從西元194年到西元199年，孫策東征西討，終於熬死袁術，全收揚州，在西元200年遭刺身死，將偌大家業留給了弟弟孫權。
在揚州總共有四大勢力，分別為：
1，朝廷勢力：當時是劉繇
2，袁術
3，孫策
4，盜賊：祖郎，嚴白虎之流。
其實從這點也可以看得出來，基本上揚州官紳大體來說是忠於朝廷的，所以才能抵抗袁術與孫策的進攻，而袁術與孫策對朝廷來說的確是逆賊，純粹是為了謀奪漢朝江山的叛逆，而東漢末年的朝廷卻政令不出司隸，對其聽之任之，抱持著鴕鳥心態，眼不見心不煩，只要我沒看見袁術與孫策的叛亂，我就當這次沒發生。
而如今孫堅未死，他與袁術之間的角逐不知要如何收場，我雖有魔裝具天矢這種可以監視百里的能力，但是大漢疆土何其廣大無垠，除了有我影武者坐鎮之地，以及洛陽有紅繡衛與韓龍，其他地方的狀況可以說是兩眼一抹黑，我當然可以以擴張紅繡衛的勢力或是要求韓龍去搜尋各地的訊息，從事間諜工作，但是我不想做到這樣的程度，我還是寧願守住幷州，在洛陽落下釘子，至於其他地區，我倒是沒有太大野心去管，如今孤身來到揚州，也不過是為了從於吉手中拿回魔力腰帶而已。
而如今我隱身不出，藉由秋香隻身遊歷揚州，她身配長劍，身形蕭索，形單影隻，倒頗有古代俠女遊歷江湖的味道。
