瓦西里神父是沙俄東正教會派來哈爾濱的，1907年教堂建成後，他就一直在這裡主持宗教活動，深得俄僑的尊敬。1917年俄國十月革命爆發後，大批俄僑流亡到哈爾濱，瓦西里神父主動收留了不少無家可歸的俄僑，在教堂裡設立臨時收容所，為他們提供食物和住所。
到了1935年，日軍佔領哈爾濱後，對俄僑進行了嚴厲的打壓，瓦西里神父因為拒絕配合日軍的要求，不肯關閉教堂的收容所，被日軍帶到教堂裡嚴刑拷打。據說，日軍為了殺雞儆猴，在教堂的祭壇旁，砍下了瓦西里神父的頭顱，將他的屍體扔在了教堂後面的小巷裡，頭顱則不知所蹤。
俄僑們得知瓦西里神父的死訊後，悲痛萬分，可迫於日軍的壓力，不敢公開為他舉行葬禮，只能在夜裡偷偷來到教堂，為他祈禱。
瓦西里神父的靈魂沒有離開，因為頭顱沒有找到，無法安息，只能被困在教堂裡，夜裡化作無頭身影遊蕩，一邊禱告，一邊尋找自己的頭顱。
這個說法，也為 “無頭神父” 的傳說增添了幾分悲壯的色彩。
人們都說，瓦西里神父死後怨氣不散，魂魄被困在教堂裡，既找不到自己的頭顱，也放不下那些流離失所的俄僑，只能日復一日地在夜裡遊蕩，嘴裡念著禱告詞。教堂裡那些奇怪的低語聲，便被解讀成他在為當年死去的俄僑祈福，為戰亂中的苦難懺悔，也在一遍遍呼喚著自己遺失的頭顱。
這些流言在哈爾濱的街頭巷尾慢慢擴散，加上早年值守工人的親身遭遇、倉庫裡突兀的腳印、憑空出現的檀香，種種細節交織在一起，讓 “無頭神父” 的傳說越傳越真，漸漸成了聖索菲亞大教堂最鮮明、也最讓人忌憚的靈異標籤。
老哈爾濱人提起這教堂，先想到的不是它的建築風格，而是這位無頭神父的故事，夜裡沒人敢獨自靠近，連路過都要加快腳步。
這種說法一直流傳了幾十年，直到上世紀九十年代，政府啟動了聖索菲亞大教堂的修復工程。
當時施工隊進駐教堂，先清理內部堆積的雜物，再逐步修補破損的穹頂和牆面。當工人挖到祭壇下方的地基時，鐵鍬突然碰到了堅硬的東西，挖開浮土後，一具殘缺的骸骨漸漸顯露出來。
骸骨沒有頭顱，身上穿著的衣物殘片，經過鑑定，是當年東正教神父的長袍。這個發現，更是讓“無頭神父”的傳說變得真假難辨。
不少人篤定，這具骸骨就是瓦西里神父的，當年他被日軍殺害後，遺體被好心人偷偷埋在了祭壇地基下，才得以留存至今。大家紛紛議論，骸骨既然已經被發現，瓦西里神父的靈魂也該放下執念，得以安息了。
可事實並非如此，修復教堂的過程中，怪事依舊不斷發生。有修復工人說，夜裡在教堂里加班時，會聽到祭壇旁傳來低語聲。還有人看到過白色的身影在穹頂下飄來飄去。還有人說，自己放在工具包裡的工具，會莫名其妙地消失，第二天又出現在祭壇旁，擺放得整整齊齊。
不過，隨著教堂修復完成、重新對外開放，來往遊客日漸增多，白天的熱鬧漸漸沖淡了陰森感，“無頭神父” 的傳聞也慢慢淡了下去，只在老哈爾濱人的閒談中偶爾被提及。可沒隔多久，聖索菲亞大教堂又有了個新的傳說——深冬暴雪夜的時空錯亂。
這個傳說比無頭神父多了幾分浪漫詭譎，卻也同樣讓人發怵。
哈爾濱的冬天，向來以寒冷刺骨聞名，零下二三十度是常態，暴雪天更是常見。每到深冬，一場暴雪過後，整個城市都被白雪覆蓋，聖索菲亞大教堂的白牆綠穹頂，在白雪的映襯下，更顯聖潔，可也更添了幾分神秘。而就是在這樣的暴雪夜裡，教堂附近，總會出現一些“時空錯亂”的詭異場景。
這個傳說的源頭，是一位旅遊博主 2018 年冬天在網上分享的親身經歷。這位博主痴迷於拍攝各地老建築的夜景，特意選了深冬來哈爾濱，就為了拍一組聖索菲亞大教堂的暴雪夜景。
那天晚上，哈爾濱下著特大暴雪，能見度不足十米，狂風呼嘯卷著雪粒，打在臉上像刀割一樣疼。
博主裹緊羽絨服，揹著相機在教堂廣場上找角度拍攝，足足拍了一個小時，手腳都凍得發麻，相機鏡頭上也結了一層薄霜。就在他抬手擦鏡頭時，突然覺得渾身一冷，是一種從骨子裡透出來的寒意，順著血管往四肢蔓延，瞬間讓他打了個寒顫，連呼吸都帶著冷意。
他以為是站得太久凍透了，正準備找個地方避雪取暖，一陣更猛的狂風捲著雪猛地撲過來，直吹得他睜不開眼。他下意識地閉上眼、低下頭，用手臂擋住臉。
不過幾秒時間，狂風漸漸減弱，他慢慢睜開眼，眼前的景象讓他徹底驚呆了。原本熟悉的廣場不見了，周邊的現代寫字樓、商圈、路燈，全都消失了，取而代之的，是一排排低矮的俄式小平房，屋頂上積滿了厚厚的白雪，房簷下掛著長長的冰稜。
平房之間的街道不寬，鋪著碎石子，上面也蓋了層薄雪。路上往來行人不少，大多裹著厚厚的俄式呢子大衣，戴著皮帽和棉手套，腳步匆匆。有人湊在一起說話，有的說著流利的俄語，有的說著生硬的漢語，夾雜著俄語詞彙，一聽就是常年在哈爾濱生活的俄僑。還有幾個穿著舊式沙俄軍裝計程車兵，揹著步槍，步伐整齊地在街道上巡邏，偶爾會停下來打量路邊的行人。
路邊擺著幾個小攤，攤主是俄僑，賣著俄式麵包、熱飲和手工飾品，小攤前圍著不少人說說笑笑的，熱鬧得很，完全不像剛才暴雪夜的冷清模樣。
