李巖決定先拔擢他們的軍階，再整編人馬。許多將領的部伍都要重新進行調配，當然還是要儘量照顧他們的原班人馬，如果全盤變動，不光將士的軍心浮動，易生反側，而且戰鬥力也必然下降。
李巖當眾宣佈了幾條重大決定。這也是袁宗弟、劉芳亮、劉體純、田見秀等幾位主要將領的共同意見。
一，削去所有在大順朝時期所冊封的侯、伯、男、子等爵位和分封稱號。
二，重新評定軍階，按軍功升賞。
三、完善軍制。
甲、重新設立前、後、左、右四軍，分別對應黑、黃、白、紅四色大纛。中軍暫缺。每軍下轄五個營，每營人數千至萬人，營設正副部總各一名。營轄十個哨，每哨人數一百至三百人，設正副哨總各一名。哨下轄十個隊，每隊人數十至三十人，設正副隊正一名。
選調將領，整編人馬，日夜操練。
乙、設立掌旅、輜重、火器、軍械諸營。掌旅負責錢糧，設正副督糧官；輜重、火器、軍械諸營分別設正副部總各一名統率。’
丙、每一軍設騎兵營，以果毅將軍統率。
丁、重新增設孩兒營，負責訓練、培養年輕將領，兼管情報蒐集和傳遞。
四、成立軍備局，全面負責兵器打造和新式火炮、火銃、火藥、弓箭、弩、盔甲等的製造。
五、成立營田使，負責屯田和減租減息政策的執行。和收取租稅。
六、成立礦稅局。派設稅吏對礦業、鹽業、煙業、收鹽礦稅，商船、馬隊收取過境稅。在商業重鎮設卡收稅等。
重新評定權將軍、制將軍、果毅將軍、威武將軍等軍階。為了更細化區分等級 ，還分別設了左右銜，左為正，右為副。
有關升賞的將領軍階及名字
拔擢了一批權將軍，如下:
李巖 左 權將軍
袁宗弟 右權將軍
劉芳亮 右權將軍
白旺 右權將軍
拔擢了一批制將軍，如下:
劉體純 左制將軍
郝搖旗 左制將軍
張鼐 右制將軍
劉體統 右制將軍
塔天寶 右制將軍
馬進忠 右制將軍
牛有勇 右制將軍
:下如，軍將毅果批一了擢拔
