張俊坐鎮明州，厲行整頓，其意志與政令，如同強勁的季風，迅速席捲另外兩大水師心臟——泉州與廣州。
朝廷新任命的泉州知州兼福建路水軍都總管趙汝固、廣州知州兼廣南東路經略安撫使、水軍都總管方大宗，皆是精明幹練、通曉海事且與張俊有舊的能臣。
他們到任後，秉承張俊的方略，結合本地實際，開始了對泉州、廣州水師及海防體系的大刀闊斧的改革與強化。
三大基地，地理位置、歷史沿革、面臨任務各有側重，在張俊的統一督導下，呈現出既協同又各有特色的備戰景象。
明州（慶元府），控扼長江出海口，拱衛京畿，連通南北。
此處是張俊的駐蹕之地，也是整頓力度最大、標準最高的所在。
明州水師的任務最為繁重：北需巡弋兩淮以至山東半島南部海域，防範可能自遼東、高麗方向南下的蒙古襲擾船隻；西需保障長江口及杭州灣安全，確保臨安門戶無虞；東需維護通往高麗、日本的航線；南則是聯絡泉州、廣州的中樞。
張俊重點強化了明州港本身的防禦。
在招寶山、金塘山等扼守港口的形勝之地，增築堅固炮臺，安裝大型床子弩和試製的青銅碗口銃，與港內水師戰船構成交叉火力。
擴建水寨，修建可容納大型樓船和維修戰船的幹船塢。
對現有戰船，他要求嚴格按照新標準檢修、改造，尤其強調火器的配備。
明州水師率先成立了“火器營”，抽調巧手士卒，專門學習操作、維護旋風炮、火箭、猛火油櫃，並試驗在戰船上固定使用碗口銃。
張俊甚至從臨安格物院請來幾位工匠，嘗試改進火藥配方和火器效能。
針對長江口及杭州灣水情複雜、沙洲眾多的特點，明州水師大力發展中小型快速戰船，如“多槳船”、“海鰍船”，吃水淺，轉動靈，適於在近岸、淺水及島嶼間穿梭巡邏、追擊走私小船。
同時，組建精銳的“水鬼隊”，負責水下破壞、偵察、夜襲等特種任務。
泉州，刺桐港，海上絲綢之路的起點，帝國最大的對外貿易港口。
這裡的核心任務，是“保商”與“防奸”並重。
泉州水師不僅要防禦外海來敵，更要確保每年數以千計、載著瓷器、絲綢、茶葉出洋，又載回香料、珍寶、金銀的蕃舶安全，同時嚴防這些蕃舶成為蒙古細作、違禁物資進出的渠道。
知州趙汝固到任後，首先強化了泉州市舶司的職能與權力。
擴建碼頭倉庫，規範抽解和博易流程，提高效率，以減少商船滯留時間，降低風險。
對蕃商、船主、水手實行更為嚴格的登記、擔保制度，在蕃坊內實行保甲聯坐。
水師戰船對進出港的大型蕃舶實行護航與監視，並定期巡弋泉州灣外的主要航道和錨地。
在戰備方面，泉州水師的特點是“大艦巨舶，遠海巡弋”。
依託泉州發達的造船業，趙汝固集中資源，建造和改裝了數艘前所未有的巨型戰艦，作為艦隊旗艦與威懾力量。
這些鉅艦長達二三十丈，設有數層甲板，可載士卒數百，裝備多架旋風炮和強弩，船首包鐵，有衝角，宛如海上城堡。
它們的主要任務並非近戰接舷，而是利用其龐大的體型和遠端火力，威懾海盜、不明船隻，並在必要時封鎖航道或掩護商船隊。
