【然而，這個想法遭到了父親李言聞的強烈反對。老人顫抖著說，“修本草乃國家大事，須集天下之力，爾一介布衣何德何能？”李時珍理解父親的擔憂，但他心中有一團火在燃燒，他向父親解釋，修“本草非為個人名利。實因醫藥關係人命，錯誤流傳則貽害無窮。兒雖不才，願效精衛填海之志，窮畢生之力，糾正前人謬誤。”
正當父子爭執不下時，一個機遇改變了李時珍的命運軌跡。嘉靖30年西元1551年，封藩武昌的楚王朱英?聽聞李時珍醫術高明，聘請他擔任王府奉祠正，兼管良醫所。這個職位，雖然品級不高，卻讓李時珍得以接觸到王府珍藏的醫藥典籍和稀有藥材。更關鍵的是，王府醫官的身份對他日後進入太醫院閱覽國家藏書，鋪平了道路。
在楚王府的西年間，李時珍的醫術和眼界都得到了極大提升，他不僅治癒了楚王世子的暴厥症，還接觸到許多民間難得一見的藥材和醫書。楚王府藏書樓中，他發現了大量前代醫學真本，包括一些己經失傳的本草著作殘卷。這段經歷讓他更加堅定地重修本草的決心。只有站在前人的肩膀上，才能看得更遠。
嘉靖34年西元一五五五年，38歲的李時珍因醫術精湛被推薦進入北京太醫院。在那個時代，進入太醫院是無數醫者的最高夢想，意味著成為國家醫療體系的核心成員，享有崇高的社會地位和優厚而優厚待遇。然而現實很快給李時珍潑了一盆冷水。
明代太醫院等級森嚴，分為院使，院判，御醫，吏目等多個等級。李時珍初入太醫院，僅授院判虛職，實際從事的是最低階的文書整理工作。
更讓他失望的是太醫院的學術氛圍極其保守僵化。當時的太醫院以《孫子兵法銅人腧穴針灸圖經》和《太平惠民和濟局方》為金科玉律，所有創新都被視為離經叛道。李時珍曾提出，對本草藥物進行重新考證的建議，遭到同僚的譏笑，一位老御醫甚至當面訓斥，爾一蘄州鄉下郎中，能入太醫院己屬皇恩浩蕩，安敢妄議修撰國家典章？
李時珍在給友人的信中寫道，太醫院非治學之地，乃名利之場。眾人不思進取，藥房所儲，多偽劣之品，醫官所行皆陳腐之方。每思於此，心痛如絞。他深深體會到官僚體制對學術的窒息性束縛。但太醫院經歷也給了李時珍寶貴的機會。他得以閱覽文淵閣，秘閣珍藏的皇家醫書，包括一些民間絕技的真本。在整理藥材庫時，他親眼見到了來自琉球，暹羅，波斯等地的海外藥物，大大開闊了眼界。
他還參與了嘉靖皇帝煉丹的藥材準備工作。雖然厭惡這種荒誕行為，卻也因此接觸到了汞，鉛，砒霜等礦物的藥用知識。轉折點發生在嘉靖37年西元一五五八年，這年秋天，太醫院組織了一次藥材鑑別考核，考官拿出三包外形相似的根莖藥材，要求醫官們辨別。多數人僅憑外觀判斷，結果錯誤百出。
李時珍卻透過看聞摸嘗西法準確鑑別出這是當歸頭，當歸身和獨活，並詳細說明了三者的性味差異和臨床應用區別。這次考核讓院使大為震驚，但也讓李時珍徹底認清了太醫院的侷限。他意識到，在這裡永遠無法實現重修本草的理想，這個龐大的工程需要實地考察，需要民間走訪，需要打破經典權威的勇氣。而這些在官僚體制內都是不可能的。
嘉靖38年春西元一五五九年，42歲的李時珍做出了一個驚人決定。辭去太醫院職務，返回故鄉蘄州，同僚們無法理解李氏瘋矣！多少人夢寐以求而不得之位，鄙竟棄如敝屣。
他知道離開體制意味著失去穩定收入和崇高地位，但也意味著獲得了學術的自由。回到蘄州後，李時珍立即開始了重修本草的準備工作。他制定了詳細的計劃，第一步通讀歷代醫藥典籍，輯錄所有藥物條目。第二步走訪全國藥物產地，實地考察藥材形態採集炮製。第三步，請教各地醫家藥農百姓，收集民間用藥經驗。第西步，透過臨床驗證確定藥性療效。第五步，分類整理，編纂成書。
這個計劃需要耗費的時間和精力是驚人的。李時珍清楚地知道，以一人之力完成如此浩大工程，很可能窮盡一生，也無法完成。但他想起了司馬遷的話，人固有一死，或重於泰山，或輕於鴻毛。他願意將自己的生命融入進這項事業中。
從嘉靖39年西元1560年開始，43歲的李時珍踏上了漫長的考察之路。他的足跡遍及湖北，湖南，江西，安徽，江蘇，河北，山東，福建，廣東等地，歷時十餘年，行程數萬裡，這在交通不便的明朝，對於一個年過40的中年人來說，需要怎樣的毅力和勇氣？！
李時珍的考察方式極具科學精神，每到一地，他必做三件事。第一，登臨當地名山，實地採集藥物標本。第二，走訪藥鋪，記錄藥材交易情況。第三，拜訪當地醫家藥農，獵戶，漁民，請教藥物知識。
在武當山，他冒著生命危險攀爬懸崖。只為親眼目睹傳說中的曼陀羅花。當地藥農警告此花有毒，聞之令人狂笑。李時珍卻堅持要親自試驗，他在筆記中詳細記錄了實驗過程，這種以身試藥的精神貫穿了他的整個考察生涯。】
隨著影片的推進，網友們的彈幕不斷滾動出現。
明朝太明朝的太醫出了名的爛，原來就就是因為如此迂腐。
明朝有多少個皇帝，因為他們的太醫的無能而死的。原來是他們太醫院，本來根子上就爛了。
只會死抱著一兩本舊醫書而不更新醫術的醫生哪是什麼好醫生？怪不得明朝太醫出了名的爛。
明朝
李時珍看到天幕說自己曾經在王府和太醫院的經歷，也有些恍神，的確，天幕說的沒錯，在王府以及太醫院的經歷，讓李時珍獲益匪淺。他見識到了許多在民間見識不到的珍貴的藥材，還有閱讀到很多珍貴的，民間絕對沒有的醫書古籍。這對自己寫書有很大的幫助。
至於說到放棄太醫院的職位，李時珍如今己經釋然。他自己多年科舉不成，辭去太醫院人人豔羨的職位，自己早己經把公認的所謂的好社會地位和功名這些身外之物置之度外，如今的李時珍一心只想把書寫好。
現在有了天幕的讚譽和支援，李時珍對未來有了新的希望。自己現在寫書面臨的反對肯定會少很多，得到的支援也會多得多。
朱元璋看到網友們的彈幕生氣極了，他不是氣網友，而是生氣太醫院的廢物太醫們。連後人都知道明朝的太醫是廢物，那這些太醫們到底有多差呢？可想而知。另外朱元璋在看到網友們說明朝很多任皇帝都由於太醫院的無能而死，他的頭立刻就痛了。
網友們說的對，就只會抱著舊的醫書守舊，不願更新學習新的醫術，一個醫者連最基本的熟悉草藥都做不到，草藥知識都這麼都這麼差。這些人竟然還佔據了太醫院寶貴的位置。朱元璋越想越後悔，自己日理萬機，忙於處理國事，抓貪官，竟然疏忽了太醫院。這可關乎到自家的生命和身體健康，是重中之重呀！不行，越想越氣的朱元璋立刻決定，要大刀闊斧整頓太醫院。
明朝各個不同時代的皇帝們，包括崇禎皇帝看了天幕的解說，都對自己太醫院的無能守舊氣憤不己，不約而同的都開始整頓太醫院了。
