【這種以身試藥的精神貫穿了他的整個考察生涯。在南京，他專程拜訪了當時著名的藥商王回回學習海外藥物的鑑別知識。在福建漳州，他登上海船向船員請教乳香，沒藥等外來藥材的來源和特性。在廣州，他透過葡萄牙商人第一次見到了玉米，甘薯等新大陸作物，並敏銳地意識到這些作物的食用和藥用價值。
最令人動容的是，李時珍向勞動人民學習的態度。在江西廬山，他向採藥人學習，辨認黃連的真偽。在洞庭湖畔，他向漁民請教芡實的最佳採集時節。在雲南邊境，他向少數民族醫師學習使用37止血的秘方。他在《本草綱目》中寫道，“醫者貴在博採眾長，樵夫漁夫皆可為師。”
長期的野外考察極其艱苦。然而，更大的困難來自學術界的質疑和家庭的困境。當時的主流醫家認為，李時珍的行為是捨本逐末，不專心臨床治病，卻去搞什麼草木之學。連他的好友，著名文學家吳國倫也寫信勸他，“皓首窮經非智者所為。”
更現實的是經濟壓力。長期的考察耗盡了李時珍的積蓄，家中生活日漸拮据，妻子張時不得不日夜紡織以補貼家用。子女們也早早承擔起家務。李時珍很是愧疚，他能夠堅持完成這項曠日持久的偉業，離不開整個家庭的支援。
這種支援甚至跨越了三代人。父親李言聞雖然最初反對兒子重修本草，但在看到李時珍的決心和初步成果後，逐漸轉變了態度。晚年時，他將自己畢生積累的醫案和藥方全部交給了兒子，並幫助審閱早期稿件。
父親的認可給了李時珍莫大的慰藉。妻子張氏是李時珍事業的默默支持者，這位傳統女性一首支援著丈夫的理想。在李時珍外出考察期間，她獨自承擔起養育西個子女，照顧公婆的重任。更為難得的是，她還協助李時珍整理資料，抄寫稿件。現存的《本草綱目》早期手稿中有一些娟秀的小字批註。據考證，就是張氏的手筆。
李時珍的子女們也參與到這項事業中。長子李建忠科舉出身，官職知縣，雖然走上了與父親不同的道路，但一首為父親的專案提供經濟支援。次子李建元三子李建木則繼承了父親的醫術和志向，成為李時珍最重要的助手。尤其是李建元，他放棄了科舉前途，全心全意協助父親，他不僅陪同父親進行野外考察，還負責標本製作，圖譜繪製和文字校對工作。
《本草綱目》中1100多幅精美的藥物插圖，大部分出自李建元之手，這些插圖不僅具有藝術價值，更重要的是科學準確性，每幅圖都基於實物寫生，為後世藥物鑑別提供了可靠依據。
李時珍在教導兒子時特別強調的草藥重要性。他常對李建元說，“醫者如將，藥者如兵，不知兵而能將鮮矣。故欲為良醫必先試藥。”他親自帶領兒子深入山林，傳授眼看，手摸，鼻聞，口嘗的藥材鑑別方法。這種理論與實踐相結合的教育方式，培養了李建元紮實的藥物學功底。
更難能可貴的是。李時珍打破了秘方不傳外人的傳統陋習，廣收門徒，將知識無私傳授。他的弟子中既有讀書人，也有普通百姓。在蘄州玄妙觀，他定期開設講堂，免費教授醫藥知識。這種開放無私的學術精神與當時醫界普遍存在的門戶之間形成鮮明對比。李時珍在《本草綱目》中收錄了大量民間驗方，並註明來源，體現了他對勞動人民智慧的尊重。他在凡例中寫道，是書所載，有得之書，傳者，有得之諮詢者，有得之目睹者。必註明出處，不敢略美。
家庭的支援和團隊的協作，使得這部浩大工程得以持續進行。當李時珍年事漸高，體力不支時，李建元接過了更多實地考察的任務。當編纂工作進入最繁瑣的分類整理階段時，全家人分工合作，日夜奮戰，這是一個家族用三代人的心血共同鑄就的豐碑。
西元1580年，60歲的李時珍終於完成了《本草綱目》的初稿。這部書稿共有52卷，載藥1892種，其中新增藥物374種，附方1萬1096則，插圖1160幅。全書採用析族區類，振綱分目的科學分類法，將藥物分為16部60類，這種分類體系比西方林奈的分類法早了100多年。
然而，完成書稿只是萬里長征第一步，更大的困難還在後面出版。明代出版書籍需要經過嚴格審查。
特別是醫藥類書籍，更要避免妖言惑眾之嫌。李時珍首先將書稿送到湖廣官府，請求批准刊印，但地方官員對此毫無興趣，甚至譏諷道，李氏欲以布衣之身僭越國家典制乎？書稿被擱置一年有餘，無奈之下，李時珍決定赴南京尋求出版機會。南京作為明朝留都，書房林立，出版業發達。萬曆八年西元1580年，63歲的李時珍攜書稿，來到南京。他拜訪了當時著名的出版家胡承龍。
胡承龍初看書稿，被其規模和質量震撼。但隨即面露難色，李公此書規模宏大，若刊刻成書，須雕版萬餘耗資數千兩。在下小本經營實難承擔。李時珍沒有氣餒，他做出了一個驚人決定，自費出版。他變賣了蘄州的部分田產，又向親朋好友借款，湊齊了出版所需的部分資金。胡承龍被他的執著感動同意墊付剩餘款項，並負責具體的刻版工作。
但就在刻版工作開始後不久，新的問題出現了，一些保守的醫家聯合向官府舉報稱，《本草綱目》擅改古法，詆譭先賢。特別是李時珍對《神農本草經》等經典著作的糾錯，被視為大逆不道。南京刑部甚至派人調查，刻版工作被迫中斷。
這是李時珍一生中最黑暗的時期之一。他在給友人的信中寫道，心血耗盡，每思半生辛勞將付諸東流，夜不能寐。但他沒有放棄，一方面，據理力爭向官府解釋修書初衷，另一方面，對書稿進行修改，緩和了一些過於尖銳的批評。】
三國時期
華佗看到李時珍的觀點是醫者貴在博採眾長，他很是贊同，不由得跟隨著天幕點頭附和。看到李時珍甘願忍受眾人的反對和批判，也要堅持重修本草，而且寫書過程中各種艱難險阻。華佗感慨萬分，自愧不如。自己不過是一個行醫的醫者。李時珍不僅是優秀的醫者，還是有著長遠眼光和大愛仁心的偉大人物。
想到這裡，華佗整肅起身，恭敬的對著天幕行禮。看到李時珍對於草藥的嚴謹認真的態度，華佗只可惜遺憾，不能親自與這位如此優秀的醫者見面。
明朝
嘉靖皇帝朱厚熜把李時珍找到並召見的命令己經吩咐下去。李時珍沒有這麼快能到達京城，但是看到他修書的過程這麼艱難，面臨這麼多困境，嘉靖皇帝一看，這好解決呀！當即就決定這個李時珍撰寫的《本草綱目》由朝廷贊助，不僅是資金上的支援，而且皇宮內很多珍貴的醫書古籍，還有在太醫院裡收藏的各種珍貴的藥材，嘉慶皇帝全部都打算交給李時珍，作為編書的材料。
嘉靖皇帝還打算把自己珍藏的各種丹藥材料都交給這個李時珍寫書，這些可都是天材地寶。作為皇帝的朱厚熜也要用了很長時間才收集得來的。這樣這本書就能更加完善。嘉靖皇帝算了算時間，現在那個李時珍應該開始寫書沒有幾年，還能來得及。
嘉靖皇帝又看了看下首滿頭冷汗的太醫們。之前天幕的後人們提到明朝的太醫都是很是爛，不僅無能的很，而且還治死了好幾任明朝的皇帝。嘉靖皇帝那時候看到後人這樣說，害怕極了，氣的把這些太醫們全部都抓到面前來，罵了好久。現在看著他們，又看著人家李時珍堅持認真負責的態度，他當即在心中決定，讓這些廢物們全部都給李時珍打下手吧。
自己要尋找真正有才的御醫。朝廷如此全力支援李時珍，嘉靖皇帝只有一個要求，就是讓李時珍把朝廷，特別是自己對他的這部草藥學鉅著的支援寫下來，讓後人也知道自己不僅是一個只會煉丹的笨蛋，還是一個目光長遠的，能全力託舉有才之士的伯樂。
