【葉桂反對濫用辛溫藥物。他創制的銀翹散疏風清熱，白虎湯清氣分熱，清營湯清營涼血等方劑成為溫病治療的經典，至今仍廣泛應用於流感肺炎，猩紅熱等疾病。
葉桂還進行了臨床創新診斷方法與診療技巧的突破。葉桂的診療智慧體現在對細節的極致追求上。他將望聞問切發展到新的高度，尤其擅長透過舌象，斑疹，脈象判斷病情。
這種舌診帶脈診的方法，對溫病的快速診斷提供了便捷工具，葉桂提出，斑為陽明熱毒，疹為太陰風熱，透過斑疹的顏色形態判斷病情輕重，色紅活潤則為順，色紫黑晦暗為膩，稀疏均勻為青。這一經驗對判斷傳染病的預後具有重要價值。
他主張在溫病早期及時透邪，截斷傳變，避免病情惡化。例如衛分證階段就用清熱藥防止邪入氣分，在氣分證階段重用生津藥，防止邪入營血。這種早干預，早控制的思路與現代傳染病，早發現，早治療的原則不謀而合。
葉桂一生忙於診病，未親自著書，但其醫學思想透過弟子整理得以傳世，最著名的有《溫熱論》，由弟子顧景文記錄整理，僅數千字卻系統闡述了溫病的病因，傳變，診斷與治療，提出衛氣營血辨證的理論，被稱為溫病學的綱領。書中每一句話都源自臨床實踐，如在衛汗之可也，到氣清氣，入營可透熱轉氣，入血只需涼血散血成為溫病治療辦法，讓溫熱病成為獨立體系，是中醫治療傳染病的里程碑。
《臨症指南醫案》由弟子華岫雲等整理，收錄葉桂診治的內科，婦科，兒科等醫案2000餘則，每案詳述病情，診斷方藥及療效，體現了同病異治，異病同治的辯證思想，展現了辨證施治的靈活性。
葉桂的醫案以複雜多變，辨證精準著稱，尤其擅長處理溫病中的疑難重症，他的診療過程如同抽絲剝繭，總能從紛繁的症狀中找到關鍵病機。
葉桂準確區分了溫病與傷寒，糾正了見發熱就發汗的錯誤。說明診斷疾病不能僅憑相似症狀，而要抓住本質特徵，尤其要警惕誤診帶來的二次傷害。同時，他根據病情變化調整用藥的靈活性，也體現了動態辨證的重要性。
溼熱黃疸分階段治療的層次，此案體現了葉桂分層次，分階段的治療思想，溼熱為患，需根據溼與熱的輕重調整治法，不能一概而論，這對現代治療複雜疾病如慢性肝炎，腎病綜合症有重要啟示。疾病的不同階段有不同的主要矛盾，治療需審時度勢，靈活調整，而非固守一方。同時，他重視環境與生活習慣，對疾病的影響也符合現代生物，心理，社會的醫學模式。
一位產婦產後十天突發高熱，體溫達40攝氏度，伴有惡露不盡，小腹疼痛，口渴，煩躁。葉桂提出，扶正不住邪，祛邪不傷正的治療原則。開出清營湯清熱涼血，減去苦寒藥，加入當歸益母草活血化瘀。同時，配伍少量西洋參益氣養陰。次日惡露增多，腹痛減輕，調理一週後痊癒。此案中，葉桂打破了產後必須必用溫補的思維定勢，根據熱邪為主，虛為次的病情，採用清熱為主，扶正為輔的方案，展現了抓主要矛盾的辨證智慧。這對現代處理複雜病，例如腫瘤患者感染，術後併發症有重要指導意義，治療需兼顧正邪動態平衡，避免一刀切的極端做法。】
東漢
張仲景看到葉桂在臨床進行了診斷方法的創新和診療技巧的突破，大有裨益，得到了很多靈感。沒錯，觀察舌頭和斑疹的顏色性狀都是很好的診斷辦法。主要是葉桂對溫熱病的思想大大啟發了張仲景。
張仲景長久以來的研究重點都放在了傷寒病上。沒想到千年過去，反而成了溫熱病頻發的年代。但這也啟發了張仲景，不僅要關注傷寒病，還要把關注的目光留一點放在溫熱病上，即使張仲景現在所處的時代更多是傷寒病，但是張仲景看了葉桂的故事之後，己經對溫熱病也很感興趣，自己現在就研究一下，也好給後人有更多的參考經驗。
三國時期
華佗攆須點頭。對於葉桂在溫熱病方面的創新還有診斷療法的突破，讓華佗大開眼界。沒想到啊，千年之後的朝代流行的病症也不一樣了。雖然如今華佗自己所處的時代並沒有太多溫熱病，但是華佗仍然認真記錄下來，這對於自己在醫學上的研究有很大幫助。他可真是希望能夠首接和不同朝代的醫者交流討論呀。
看到葉桂在醫治病人的期間採用了辨證施治的理念，華佗特別贊同。行醫就是要如此，不能死板保持一成不變，而需要靈活變通。同病異治，異病同治，甚至在一個病症的不同階段，也要採取不同的治療，有的還需要進行手術，才能徹底根治。
可惜世人大多保守，而且對新知識，新理念接受度不高。而且很多時候對華佗提出的手術治療方案質疑反對，甚至懷疑是覺得是華佗要害他們。最大的典型案例就是那個著名的曹操，還覺得華佗要給他開顱做手術要殺了他。
如果看了天幕之後，世人對新知識新理念，特別是華佗的手術治療，也有寬容接受的態度就好了。那華佗治療病人的過程就輕鬆很多了。
西晉
皇甫謐看著天幕介紹的古代名醫系列也很受啟迪。原來流行的病症也變了。這讓皇甫謐對於針灸之法治療有了更多的靈感，他己經開始著手準備繪製彩色穴點陣圖了。
看到葉桂的故事，他又有新的想法。自己也可以研究一下，雖然現在溫熱病並不多見，但自己也可以研究這針對這類病症的針灸之法。沒想到看個天幕，皇甫謐給自己找了越來越來越多的任務要完成。
但是他甘之如飴，並不覺得難過，他看到了錢己專注於兒科的堅持，宋慈面對社會的鄙視也要堅持和屍體打交道，李時珍歷盡千難萬險也要為世人完成《本草綱目》的精神所打動。皇甫謐的注意力都不放在讀書上，最近都在全心研究針灸之法。希望在自己擅長的領域能夠為世人帶來更多福音。
