八月底，鄭軍水師抵達長江入海口外。
海風獵獵，旌旗蔽空，鄭成功站在旗艦的甲板上，目光銳利地望著前方浩蕩的江面。
這是他第二次帶鄭家水師攻打吳淞口了，路上的風景還是那麼熟悉，只是一切都物是人非了。
鄭成功嘆了一口氣，隆武皇帝賜他“成功”二字，他一直銘記於心。對於隆武帝的死，他久久不能釋懷。
此次鄭成功統領閩軍水師精銳，大小戰船兩千餘艘，將士八萬餘人。
戰船之上，紅衣大炮、虎蹲炮、鳥銃列陣森嚴，船帆之上“鄭”字大旗迎風招展，氣勢磅礴。
船隊自塘沽口出海，順著東南季風一路南下，海面之上，戰船首尾相連，綿延數十里，槳櫓齊動，破浪前行。
此時吳淞口早已被吳軍重兵把守，吳軍深知吳淞口是長江咽喉，一旦被破，南京便會暴露在鄭軍水師的兵鋒之下，故而在此佈下嚴密江防。
吳軍在江面佈設大量木樁、鐵鏈，築起水上攔江工事，沿岸炮臺林立，數十門重型火炮對準江面，上百艘吳軍水師戰船停泊在港口之內，岸上步兵列陣，嚴陣以待，妄圖將鄭軍阻攔在長江之外。
鄭成功立於船頭，仔細觀察吳軍佈防，身旁施琅上前請戰，他卻抬手示意，沉著排布作戰方略。
鄭成功將水師分為三路，施琅艦隊從左路迂迴至吳淞口側翼，牽制吳軍岸防炮臺；右路船隊搭載甘輝所部精銳步兵，伺機登陸突破；自己則親率中路主力戰船，正面強攻吳軍水師防線，以炮火撕開敵軍江防。
次日清晨，天色微亮，江面薄霧尚未散盡，鄭成功一聲令下，水戰正式打響。
中路主力戰船率先開炮，數十門紅衣大炮同時轟鳴，炮聲震天動地，炮彈帶著熾熱的火光呼嘯而出，狠狠砸向吳軍攔江工事與戰船。一時間，江面之上火光沖天，水柱四起，吳軍的攔江木樁被炮彈炸得粉碎，鐵鏈應聲斷裂，前沿戰船被炮火擊中，燃起熊熊大火，吳軍士兵慘叫著墜入江中。
吳軍見狀，立刻開炮反擊，岸防炮臺與戰船上的火炮齊齊發射，炮彈如雨點般飛向鄭軍船隊。
鄭軍戰船憑藉靈活的操控，在江面快速機動，躲避炮火，同時持續還擊，雙方炮戰愈演愈烈，硝煙瀰漫整個江面，視線盡被遮蔽。左路施琅艦隊趁亂突進，逼近吳軍岸防炮臺，船上銃炮齊射，壓制炮臺守軍，步兵則搭乘小船強行登陸，與吳軍展開近身搏殺，喊殺聲、兵器碰撞聲與炮火聲交織在一起。
吳軍雖拼死抵抗，但鄭軍水師攻勢迅猛，戰船火力遠勝吳軍，加之士兵作戰勇猛，不過兩個時辰，吳淞口防線便徹底崩潰。吳軍戰船被擊毀大半，岸防炮臺被逐一攻克，殘餘吳軍倉皇逃竄。
鄭軍成功突破吳淞口，船隊浩浩蕩蕩駛入長江，逆流向西挺進，直奔南京方向。
駛入長江干流後，江面愈發寬闊，沿岸瓜洲、儀徵等重鎮皆是吳軍駐守的戰略要地，其中瓜洲更是扼守長江與運河交匯處，吳軍在此佈下更為兇險的防線。
吳軍在瓜洲江面架設粗大的橫江鐵索，號稱“滾江龍”，橫跨整個江面，阻攔戰船前行，又在江心搭建數座木浮營，以巨木為基，上鋪厚板，築成水上堡壘，每座浮營之上駐紮數百吳軍，配備十餘門火炮，與沿岸炮臺相互呼應，形成水陸立體火力網，妄圖阻擋鄭軍西進之路。
鄭成功望著江面緊鎖的鐵索與江心的木浮營，面色沉穩，當即制定破敵之策。他挑選數十名精通水性的敢死隊員，趁著夜色，身披輕甲，手持利斧與火具，悄悄泅渡至鐵索處。
夜色之下，江面風高浪急，敢死隊員們冒著吳軍巡邏哨的箭矢，奮力靠近鐵索，用利斧猛砍鐵索，同時點燃火具焚燒鐵鏈。吳軍發現後，立刻開槍射箭，火光之中，敢死隊員死傷一片。
但水軍將士們毫不畏懼，死完一波又來一波，前赴後繼之下，終於將橫江鐵索徹底斬斷。
鐵索一破，鄭軍主力戰船立刻全線出擊，朝著江心木浮營與瓜洲沿岸發起猛攻。
施琅率威孚水師戰船數百艘抵進射擊，炮彈密集地砸向木浮營，木浮營瞬間被炮火覆蓋，木板炸裂，火光四起，吳軍士兵在炮火中死傷慘重，哭喊聲不絕於耳。部分木浮營被炮火擊中起火，漸漸沉入江中，鄭軍戰船趁機逼近，船上士兵用火箭、火銃輪番射擊，殘餘吳軍無力抵抗，紛紛潰敗。
與此同時，甘輝親率陸戰精銳鐵人軍，在戰船的掩護下繞至瓜洲後側，登陸包抄吳軍岸防陣地。
防守瓜州的兩千吳軍腹背受敵，陣腳大亂。
鐵人軍身披重甲，衝鋒在前，刀槍難入，如猛虎下山般殺入吳軍陣中，所向披靡。
瓜洲守軍本就被江面炮戰嚇破了膽，面對鄭軍步兵的強攻，迅速潰敗，僅僅一夜，鄭軍即順利攻克瓜洲重鎮，掃清了西進路上的又一大障礙。
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