理論模型跑通了，但生物學終究是一門實驗科學。
再完美的數學模型，如果不能在真實的細胞裡得到驗證，那也只是一堆漂亮的廢紙。
畢竟，在生物學界流傳著一句至理名言：“模型是豐滿的，細胞是骨感的，而實驗結果往往是性感的——因為它總是充滿了意外。”
徐辰設計的驗證方案非常直接，甚至可以說是“簡單粗暴”。
他選擇大腸桿菌作為底盤細胞，目標產物設定為工業上價值極高的“琥珀酸”。
實驗的核心邏輯在於驗證那個“反直覺”的預測：
在傳統的代謝工程中，想要提高琥珀酸的產量，通常的做法是過表達合成路徑上的酶。但這往往會帶來嚴重的“代謝負荷”——細胞把能量都拿去生產琥珀酸了，就沒有能量去生長分裂，導致菌體生長緩慢，最終總產量反而上不去。這就是著名的“生長-生產權衡”。
而徐辰的模型預測，如果精準控制pfk（磷酸果糖激酶）和pyk（丙酮酸激酶）這兩個關鍵節點的活性，將其壓低到野生型的35-40之間，這是一個極窄的視窗，這樣就能在不影響細胞生長速率的前提下，強行改變碳通量的分配，實現“生長偶聯生產”。
驗證標準很簡單：如果菌體長得慢，產量高，說明模型平平無奇，只是重複了前人的老路。如果菌體長得快，產量低，說明模型失效，沒能截留碳源。只有當菌體長得快，且產量暴增，才證明徐辰找到了那個上帝遺留的“後門”。
……
徐辰拿著那份“關鍵調控節點列表”的實驗結果，再次敲開了陳志華教授的辦公室。
“陳老師，模型跑出來了。”徐辰開門見山，“我找到了幾個關鍵的調控靶點，理論上，只要對這幾個酶進行擾動，就能大幅度改變代謝流的走向，比如……提高某種產物的產量。”
陳志華接過列表，掃了一眼，眉頭微微一挑。
“pfk？pyk？徐辰，你這選的可都是‘硬骨頭’啊。”
陳志華放下紙張，語氣變得嚴肅起來：“你要知道，這兩個酶是糖酵解途徑的‘看門人’。巴斯德就發現了著名的‘巴斯德效應’，其核心機制就是這兩個酶對atp/ap比率的敏感響應。它們不僅控制著葡萄糖的分解速度，還受到檸檬酸、磷酸烯醇式丙酮酸等十幾種代謝物的變構調節。”
“它們是細胞代謝網路裡最敏感的樞鈕，牽一髮而動全身。以前有不少人試圖動這兩個點，結果要麼是細胞代謝紊亂，胞內中間產物堆積導致酸中毒直接餓死，要麼就是細胞激活了旁路代謝，完全繞過了你的設計，沒有任何效果。”
“我的模型考慮到了變構調節。”徐辰指著列表後面的一組引數，語氣篤定，“傳統的調節是‘開關式’的，要麼敲除，要麼過表達。但我的模型計算出了一個‘安全區間’。只要透過啟用子工程，把酶活性精確控制在這個區間內，就能騙過細胞的監控系統，在它‘沒反應過來’的時候，把代謝流偷走。”
“哦？”陳志華眼中閃過一絲驚訝，“你是說，你想在細胞的眼皮子底下搞走私？這要是能成，那可是突破了代謝工程的天花板啊。”
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“所以，我想跟您借實驗室驗證一下。”徐辰說道。
“沒問題！”陳志華大手一揮，“實驗室隨便你用，試劑耗材走我的經費。不過，這種精細調控的實驗工作量可不小，構建菌株、篩選啟用子、發酵測試……光是gibson組裝就得做幾十次，你一個人忙得過來嗎？要不要我給你派個熟手？”
徐辰尤豫了一下。
雖然陳教授很大方，但他心裡有自己的盤算。這個課題是他獨立立項的，並未掛靠在陳教授的專案下。借用場地和儀器已經是欠了人情，如果再佔用人家博士生的時間，甚至花人家的經費買試劑，那就有點不懂事了。
畢竟博士生都有自己的畢業壓力，誰願意給一個大一本科生打白工？
“不用了，陳老師。”徐辰笑了笑，婉拒道，“我自己做就行，反正我最近課不多，多花幾個晚上熬一熬也就出來了。至於試劑，我自己買點通用的就行。”
就在這時，一個聲音從門口傳來。
“陳老師，讓我來幫他吧。”
徐辰回頭一看，只見劉偉正站在門口。他手裡拿著一盒剛提出來的質粒，身上的白大褂雖然有些舊，但洗得乾乾淨淨。
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