眼下，長島一向一揆眾屢戰屢敗、丟城失地、損兵折將，就算是名義上的住持願證寺證意都無法來收這爛攤子。加上原計劃派出的使者下間玄賴也被俘，使得長島願證寺與外界完全中斷了聯絡。
作為長島願證寺下轄分寺住持的法泉寺空明，他原本是站在石山派一方，想著躋身至長島願證寺的決策層中，獲得更多的權力和寺領。
可是，當伊藤行秀、伊藤實倫、伊藤祐直、伊藤藏人、伊藤縫殿助、樋口親氏等長島派長島一向一揆眾諸將在瀕臨覆滅之際，引來了上杉家介入後，一切都變了。
法泉寺空明不僅沒能獲得更多權力，就連自己的根本之地法泉寺都被上杉軍所搗毀。在萬般無奈之下，只能率殘部逃入願證寺之中苟延殘喘。
雖說三好長延也是石山本願寺派來下向至長島願證寺的坊官之一，但他可與下間賴旦、下間賴成等好戰分子不同，還是保持了一定的理智。
再怎麼說，上杉清定在繼承了越後上杉家的家名後，就放開了信奉一向宗的限制，並廢除了‘無礙光眾禁止令’，還將一向宗之中德高望重，且作為本願寺一家眾之一的本誓寺超賢迎入越後，為其重建本誓寺。這些舉動，讓上杉清定贏得了北陸道諸國之中不少一向宗信徒的好感。這就使得上杉家後續經略越中、佐渡、能登、越前、飛驒等一向宗影響力較大的令制國時，所受到的阻力較低。
不論古今中外，一個國家征服另一個國家後，被推到前面去控制地方的，往往就是那些服務於征服國的，被征服國的精英人物。
隨著出願證寺的一萬餘長島一向一揆軍全軍覆沒，以及求援使者下間玄賴被俘後，願證寺上下頓時喪失了戰意，以法泉寺空明、三好長延等人為首的分寺住持、坊官，皆心生投降之意。
畢竟，上杉家對待主動投降之人，可不會肆意舉起屠刀的，除了那些引起公憤之人。
像下間賴旦這樣心思歹毒、囂張跋扈、擅意妄為、乏善可陳之人，就成了願證寺投降的最大阻力。
為了避免戰後遭到上杉家的清算，願證寺證意、法泉寺空明、三好長延等人在經過一番商議後，就達成一致，將罪責盡數推給下間賴旦、下間賴成、下間豐前法橋、下間豐後法橋、下間賴重等石山本願寺下向長島願證寺的高階坊官，將自己營造成被他們長期迫害的物件。
而後，願證寺證意、法泉寺空明、三好長延等人便以召開軍議為由，在願證寺的佛殿中設下伏兵，並誘騙下間賴旦前來。
由於下間賴旦麾下的僧兵盡數於寺外被上杉軍殲滅，使得他如今與孤家寡人無異。在接到願證寺證意召開軍議的邀請後，認為眼下願證寺之中尚有與自己交好的法泉寺空明，以及同樣出身於石山本願寺坊官的三好長延等人，也沒做多想，便欣然前去。
等下間賴旦一進入佛殿之中，早就埋伏在大門兩側的僧兵們就將緊握的薙刀分別刺入其左肋、右肋。
當下間賴旦還想做出反抗之際，三好長延便抽出腰間的太刀，在一陣寒光過後，便將下間賴旦的首級斬下。
之後，願證寺證意就讓法泉寺空明作為使者，將下間賴旦的首級送往上杉軍本陣之中，表示願證寺願意開城投降，請求上杉家的赦免。
面對願證寺的請降，上杉定虎也不拒絕。
在上杉定虎看來，上杉家眼下的主要目標是西進上洛、討伐偽朝，並不是對一向一揆眾斬盡殺絕，更不是徹底壓制伊勢一國全境。
若是與長島一向一揆眾的戰事遷延日久，上杉軍的糧草輜重消耗可是與日俱增，士氣和戰意還有可能被消磨。
即便上杉定虎代表主君上杉清定接受了長島願證寺的降服，她可沒有繼續讓長島願證寺保持武裝的想法。在近十萬上杉軍的注視下，願證寺證意、法泉寺空明、三好長延等人只得讓願證寺之中殘存的一向一揆眾交出所有武器，以及破卻願證寺、寺內町之中的所有箭櫓、望樓等防禦設施，並對一向一揆眾進行遣散。而且，願證寺證意、法泉寺空明、三好長延等人還需要前往尾張古渡城，向上杉清定請罪。
作為師從高僧天室光育的上杉定虎，深知若是在沒有準備的情況下突然大軍被斷了歸路的，不論古今中外，幾乎沒有全身而退的！如果往前再接著打，那麼由於歸路被斷，後續的糧草運不上來，自己也容易面臨著兩線夾擊。如果回軍，那麼後面又容易被敵軍主力追擊，同樣還可能是兩線夾擊。
最為著名的例子就是威震華夏的武聖關羽。
就算關羽斬龐德、捉于禁，水淹七軍，史載‘羽威震華夏’！在前方打的曹操都差點遷都，就連鄴城這個曹魏首都風聲鶴唳！但後方一旦被缺乏全域性眼光的大魏吳王孫權捅了刀子，馬上就扛不住了。
後來整個魏國朝堂對於蜀漢的態度就是——蜀，小國爾，名將唯羽。
至此，盤踞在伊勢桑名郡杉江莊境內近六十年的長島一向一揆眾徹底覆滅。曾經鼎盛時期擁有寺領十萬石、信徒十餘萬人的長島願證寺再也無法割據一方，恢復曾經的輝煌。
與此同時，曲直瀨道三、曲直瀨玄朔、藤林正保、多羅尾光俊、多羅尾綱知等人在經過千辛萬苦後，終於將方仁親王護送至上杉家治下的若狹境內，並獲得了柿崎景家、齋藤朝信、山名祐豐、一色義幸、神餘親綱、河田元親等人的庇護。
身在尾張古渡城的上杉清定在獲知方仁親王逃出生天後，感到非常高興，當即下令柿崎景家、齋藤朝信等北陸道上杉軍諸將負責派兵沿途護衛，務必將方仁親王安全護送至美濃岐阜城，沿途諸城務必以迎接自己的規格對待方仁親王，違者一律嚴懲不貸。
