崇禎元年八月下旬，遼東的續報送入京中。
最先到的一份寫大淩河收軍，城工、器械多有棄置；後到的一份報祖大壽陣亡。各營歸隊的數目尚未齊全，前後兩報又隔著日子，有人將未歸的全算作潰失，也有人說既然保住了兵，棄一座未完的城便不足深責。
朱由檢收到的兩份奏報都經內閣進呈。周延儒所擬的回旨附在後面：先收攏舊部，催報人馬實數，再議棄城之責。
清算以後，韓爌等舊輔相繼退去。周延儒因幾次召對得旨先入閣，溫體仁隨後也得了入閣之命；如今居首輔的是周延儒。朱由檢讀到所附的歸隊數目，又將兩份軍報對了一遍。至於追究棄城，他讓先取孫承宗自陳。孫將興工、籌糧一併列在自己名下，又提祖大壽身亡，末尾引咎請歸。所附部議裡另有接任督師尚無人選的一節。
召部臣入見時，朱由檢先讓說清祖大壽是在何處死的。兵部來人答，在撤軍道路上中箭，部下抬到接應處，傷重身故。何可綱與親兵的呈報俱在，他將記有這幾句的紙頁翻出，遞到御前。
朱由檢翻看那一頁，問遺體是否已回錦州，家屬是否接到。聽見都已辦了，他放下紙，目光仍停在祖大壽陣亡的那幾行上。
“城是誰請修的？”
部臣答孫承宗主其事，又說修城可使寧錦互為聲援。朱由檢打斷他，取出先前請給糧運的奏報，問當初奏稱能夠接續，為什麼到臨敵時城內的糧便不夠久守。
部臣說該令督師具奏。
朱由檢讓發問。案角另放著六月的請示和批答，他拿起來看了片刻，遞給身旁內侍，讓同後來的軍報放在一處。
有人提起城工損失，建議先令孫承宗離任候勘，另擇人往寧錦主持。朱由檢問新任何時能到，眼下誰收祖部，誰領尚在城外的兵。來人答可令各將暫守，正式人選再議。
“各將聽誰的？”
周延儒接過話，說部議若主張撤換，便請連代領者一併議出。劾疏所言的城工損失應當查，軍中眼下卻要有人接住。
“閣中原擬暫留收軍？”朱由檢問。
“是。棄下的工料仍令具報，先將歸隊的人交回督師約束。”
部臣提議先擇一將代領諸營，待新督師赴任再交割。朱由檢追問人選，對方舉了一人，又說排程諸將仍需另授敕書。皇帝將六月的批答推到案前，叫他先看相機收軍那一條，說孫承宗暫留收軍，兵部須議明關外諸營由誰接管，交清以後再準歸。興工、給糧和敵至後的處置經過，仍須逐項回奏。
他停了一下，又道：“朕準他保兵。兵回來多少，失在哪裡，都要實報。”
祖部的事另議了一陣。
有人想趁主將新喪，將各營分給別的將領。如此不必再等一個能統全軍的人，幾處缺兵也可補上。兵部呈來的意見裡，卻有何可綱已經奉孫承宗命收攏餘部的一節，舊將肯向他交代人數，傷兵家屬也知道到哪裡問。
朱由檢看過，準何可綱暫領舊部、聽督師節制，諸營先依原領將官安置。前鋒總兵的正式補授另議，不叫等待補缺的人在此時爭著划走兵馬。
孫承宗另請添調一支騎兵，先到寧遠聽用。兵部來人說，撤回的人已有不少，再從登萊抽兵，登州的守備也要薄一層。
朱由檢讓他把督師所報的缺處唸完。
部臣翻到所附的人馬冊，念出傷者和失馬的數，又念孫承宗請分作兩班的辦法：一班放城外哨，一班接護糧車。唸到末尾，他自己停下，回頭對了一遍現存馬數，才將兩班還各缺多少報出來。
朱由檢準兵部行文登萊，抽調有馬能戰的一部北上，抵寧遠後聽孫承宗分派，交卸時隨關外軍務一併交接，登州炮手與守城兵不在此調。調令寫明寧錦補防、放哨護運的差使，限登萊查報可發的人馬與啟程日期。
說到撫卹，戶部來人報現有銀數，又報幾處積欠。
朱由檢問逆案諸家尚有多少抄沒銀未解。春間定冊頒行以後，田爾耕、許顯純已處斬，同黨數人先後處決；顧秉謙、馮銓論徒準贖，幾名閣臣革職閒住，從逆者不得複用。戶部答，有些家產還在變價，眼下只能照已到的數撥。皇帝叫將解到的日期也列出來，再報軍中急需。
祖大壽的贈恤須會同有關衙門議擬，其餘戰死軍官兵丁也須照例分等，單是把戰死者核清，便不能一日辦完。
朱由檢聽得眉頭緊蹙，問難道核不清全數，家中便一粒糧也領不到。
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