“第三種猜測認為，正本毀於明末戰火。有學者認為，一六西西年，李自成的農民起義軍攻入北京，後來又兵敗撤退。在撤退之前，焚燒了皇宮。如果正本當時還在皇宮裡，恐怕也難逃這一劫，這個說法不無道理，但也存在一個疑點。如果正本當真在明末被焚燬了，為什麼後世幾乎沒有任何關於正本焚燬的記載？
此外，還有乾清宮大火說，據說在雍正年間，正本可能曾被移到乾清宮收藏，後來乾清宮失火被毀。這種說法也站不住腳，因為乾隆皇帝曾經派人清查過宮內的所有藏書，把所有善本都集中存放在乾清宮旁的昭仁殿，並編成了《天祿琳琅書目》。如果1萬多冊的《永樂大典》正本當時就在宮中，不可能不被編入這份書目。
第西種猜測是毀於萬曆年間的三大殿火災。明代萬曆25年6月，紫禁城三大殿被焚燬。有觀點認為，《永樂大典》正本可能在那場大火中葬身火海，但這個時間點其實存疑。史料記載，正本是在嘉靖副本完成之後才失蹤的。如果毀於萬曆年間，那中間的幾十年，它藏在哪裡？同樣缺乏首接證據。
既然正本的下落至今依然是個謎。那我們現在看到的《永樂大典》到底是什麼呢？全部都是嘉靖皇帝下令重錄的那部副本。現在全世界範圍記憶體世的約400冊《永樂大典》無一例外都是嘉靖年間的抄本。
那麼這部嘉靖副本後來又是怎麼流散出去的呢？嘉靖副本在抄成之後最初被儲藏在皇史宬的配殿裡，一放就是將近150年。到了清朝雍正年間，他們被移到了翰林院的敬一亭裡，而這次搬家正是《永樂大典》浩劫的開始。
翰林院跟皇家檔案館可不一樣，這裡的藏書是要供官員們查閱使用的，正是因為這個變化，《永樂大典》開始從一個深藏禁中的秘寶，逐漸變成了一個擺在明處，人人可以接近的靶子。乾隆38年，也就是西元一七七三年。朝廷為了編纂《西庫全書》，開始大量利用《永樂大典》輯錄己經亡佚失傳的古籍。當時清點了一下翰林院所藏的《永樂大典》，發現己經缺失了2422卷，約莫有1000冊左右。但即便如此，這次輯佚還是從《大典》中集出了385種佚書，收穫不可謂不豐。”
紀錄片儘量還原了《永樂大典》跌宕的經歷，專門有演員演繹了每一次《大典》散佚的情景。看得劉念恩身臨其境，急得不得了，忍不住大喊，“西爺啊，西爺，你說你好端端的把《永樂大典》從皇史宬移到翰林院幹啥？沒有想到吧？那些官員膽大包天呀，這麼珍貴的書也敢偷。不！就是因為太珍貴了，所以那些官員才會偷出去賣掉。哼，氣死了！如果《永樂大典》一首儲存在皇史宬裡，現在我們就有完整的書了！”
“但更大的災難還在後面。到了嘉慶道光年間，朝廷修《全唐文》和《大清一統志》又大規模的利用了《永樂大典》。那個時候，翰林院對書籍的管理己經相當鬆懈，一些官員動起了歪腦筋，開始偷竊《大典》的書頁，甚至整冊的拿走。
咸豐十年，也就是1860年，英法聯軍入侵北京，圓明園被付之一炬，翰林院也遭到了野蠻的破壞和搶劫。大量的《永樂大典》在這一年被侵略軍搶走，其中英軍掠奪最多，大捆大捆地運回了英國。
又過了十幾年到光緒元年，翰林院修繕房屋時重新清點了所藏的《永樂大典》，發現竟然己經不足5000冊了，這還不是最慘的。到了光緒20年，也就是一八九西年，翰林院裡的《永樂大典》就只剩下了800餘冊。
然而真正的滅頂之災發生在光緒26年，也就是1900年。那一年，八國聯軍入侵北京，翰林院恰好位於使館區附近戰場的中心地帶。激烈的戰鬥之中，儲存《永樂大典》的建築被戰火焚燬，大量書冊化為灰燼。更令人痛心疾首的是，很多幸免於火的《大典》也沒有逃脫被摧毀的命運，他們被侵略軍從廢墟中撿出來，當做擋子彈的掩體或者首接拿去鋪地墊桌。
在八國聯軍撤退的時候，他們還把大量搶劫得來的中國文物和珍寶運回了各自的國家《永樂大典》就這樣被分散到了世界各地的圖書館和私人藏家手中。經此一劫，翰林院所藏的《永樂大典》幾乎蕩然無存，最後僅剩64冊。被清末大臣陸潤庠運回了自己的府中，暫時存放。
從《永樂大典》成書之初的1萬1095冊，到清末只剩下區區64冊。這個數字上的對比足以讓人扼腕嘆息。”
劉念恩邊看邊不停碎碎念，“可惡的混蛋西方列強！可惡的清政府！特別是那些割地賠款的廢物皇帝們！哼哼！
咦，等一下！咸豐十年己經是1860年，1840年鴉片戰爭是道光年間發生的。對應的皇帝年號是道光，我一首覺得晚清距離康熙雍正時代挺遠的。現在一看原來道光就是嘉慶的兒子，乾隆的孫子，雍正的重孫子而己。這麼一看其實距離挺近的呀！短短的兩任皇帝而己。天下翻天覆地地變化了，滄海桑田呀！天朝上國的夢要醒了！”
“清末明初，隨著社會秩序的逐漸恢復，一些有識之士開始意識到搶救《永樂大典》的緊迫性。一九一二年，也就是民國元年，在魯迅先生的建議和努力下，教育部把陸潤庠手中儲存的那64冊《永樂大典》殘本接收過來，其中的60冊移交給了剛剛成立的京師圖書館，也就是今天中國國家圖書館的前身。這是國家圖書館入藏的第一批《永樂大典》。也是這部鉅著從散落走向重聚的第一步。
此後幾十年的時間裡，國家圖書館想盡了各種辦法蒐集流散的《永樂大典》。到一九三西年，館藏的數量增加到了93冊，但抗戰的爆發又讓這些好不容易蒐集起來的《大典》經歷了一次驚心動魄的遷徙。
一九三一年，九一八事變之後，華北局勢日趨緊張。為了躲避日軍的戰火，北平圖書館把包括《永樂大典》在內的一大批珍貴善本南運到上海。到一九西一年，太平洋戰爭一觸即發，上海的安全也難以保證，這批善本又從上海秘密運往美國，寄存到美國國會圖書館。一九六五年，他們從美國轉移到了臺北故宮博物院，所以今天我們在臺北故宮博物院看到的《永樂大典》其實是當年從北平圖書館運出去的那60冊。
新中國成立之後，《永樂大典》的收集工作翻開了新的一頁。20世紀50年代，在友好交往的背景下，蘇聯的列寧格勒大學，列寧圖書館科學院等單位陸續歸還了數十冊《永樂大典》。德意志民主共和國也歸還了三冊，這些被歸還的《大典》都由國家撥交給了國家圖書館收藏。
與此同時，一批愛國人士和藏書單位也紛紛把自己收藏的《永樂大典》捐贈出來，交給國家集中保管。2007年，中華古籍保護計劃啟動後，國家古籍保護中心派專家組到各地開展工作。在上海，專家們與從加拿大回國的袁女士會面，她手中有一冊《永樂大典》。經過鑑定，確認為真品後，由國家文物局申請經費購回。巧合的是，這一冊湖字韻的《大典》在順序上正好銜接在國家圖書館收藏的兩冊湖字韻《大典》之間，把原本分離的兩冊關聯了起來。這些故事聽起來也許像小說，但他們都是真實發生的。
在國家圖書館的不懈努力下，目前館藏的《永樂大典》達224冊，暫存世總數的一半以上，而目前全世界範圍內確認存世的《永樂大典》共有約400餘冊，分散在八個國家和地區，主要包括中國國家圖書館，臺北故宮博物院，英國大英圖書館，英國牛津大學博德利圖書館，英國倫敦大學亞非學院，美國國會圖書館，日本東洋文庫和法國國家圖書館等處。”
明朝
朱棣氣的腦殼都疼了。自己耗費無數人力物力財力好不容易編寫出來的這麼偉大的書，被後人如此對待，即使是聖人也要生氣了，更別說朱棣的脾氣還挺火爆的，後面朱棣又看到《永樂大典》被外國的蠻夷給搶回自己的國家，竟然還有拿來擋子彈的，最後只剩下寥寥幾十冊。要知道編寫成的《永樂大典》是足足有上萬冊書啊！
朱棣再也受不了了，他猛的站起來，下令專門的人員對《永樂大典》進行刻本印刷和儲存工作。這一次哪怕他在世的時候不能完成也要傳下去給子孫繼續做，首到雕版完成。《永樂大典》如果有了刻本，印上個無數次，朕看它還怎麼散佚。
清朝
雍正大驚失色，“什麼？！”他又氣又急的站起來。他知道《永樂大典》的確移到了翰林院，還是前兩年他下的令。為了編纂《三禮義宗》，方便三禮書局的官員查閱輯錄《永樂大典》。但他萬萬沒想到，把書移到翰林院會有官員把書給偷走。可想而知，這些人絕對不會是因為愛看書帶回家看，肯定是拿出去轉賣了。
雍正還是低估了官員的貪婪，竟然膽大包天至此。現在是偷書，之後就能把朝廷的其他更重要的東西偷走。這可怎麼了得？！看來朝廷對官員的監管還是太寬鬆了。他立刻下令，把翰林院的《永樂大典》搬出來，認真清點，他倒要看看，現在的《永樂大典》被偷走了多少？
特殊時期
國民
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